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Autor:
Marco Podda, Simone Bonechi, Andrea Palladino, Mattia Scaramuzzino, Alessandro Brozzi, Guglielmo Roma, Alessandro Muzzi, Corrado Priami, Alina Sîrbu, Margherita Bodini
Publikováno v:
iScience, Vol 27, Iss 3, Pp 109257- (2024)
Summary: Whole genome sequencing of bacteria is important to enable strain classification. Using entire genomes as an input to machine learning (ML) models would allow rapid classification of strains while using information from multiple genetic elem
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/4313af5a770c4ed68e5f8934277fd0ef
Autor:
Steering Committee, De Luca (Chairman), L., Gulizia (co-chairman), M.M., Temporelli, P.L., Riccio, C., Colivicchi, F., Amico, A.F., Formigli, D., Geraci, G., Di Lenarda, A., Executive Committee, De Luca, L., Maggioni, A.P., Lucci, D., Coordinating Center, Lorimer, A., Orsini, G., Gonzini, L., Fabbri, G., Priami, P., Maras, P., Ramani, F., Falcone, C., Passarelli, I., Mauri, S., Calabrò, P., Bianchi, R., Di Palma, G., Mascia, F., Vetrano, A., Fusco, A., Proia, E., Aiello, A., Tomai, F., Licitra, R., Petrolini, A., Bosco, B., Magliari, F., Callerame, M., Mazzella, T., Lettica, G.V., Coco, G., Incao, F., Marinacci, L., D'Addario, S., Tartaglione, S.N., Ubaldi, S., Sanchez, F.A., Costa, P., Manca, G., Failla, M., Scherillo, M., Procaccini, V., Senni, M., Luminita, E.M., Bonomo, P., Mossa, C., Corda, S., Colavita, A.R., Trevisonno, G., Vizzari, G., Cosentino, N., Formaro, C., Paolillo, C., Nalin, I.L., De Rosa, F.M., Fontana, F., Fuscaldo, G.F., Passamonti, E., Bertella, E., Calvaruso, E.V., Varani, E., Tani, F., Cicchitelli, G., Gabrielli, D., Paoloni, P., Marziali, A., Campo, G., Tebaldi, M., Biscaglia, S., Biase, M Di, Brunetti, N.D., Gallotta, A.M., Mattei, L., Marini, R., Balsemin, F., Urbano, M.D., Naio, R., Vicinelli, P., Arena, G., Mazzini, M., Gigli, N., Miserrafiti, B., Monopoli, A., Mortara, A., Delfino, P., Chioffi, M.M., Marino, P., Gravellone, M., Barbieri, L., Ledda, A., Carmina, M.G., Raisaro, A.E., Di Giacomo, C., Somaschini, A., Fasano, M.L., Sannazzaro, M., Arcieri, R., Pantaleoni, M., Leuzzi, C., Gorlato, G., Greco, G., Chiera, A., Ammaturo, T.A., Malanchini, G., Del Corral, M.P., Tedesco, L., Pede, S., Urso, L.G., Piscione, F., Galasso, G., Provasoli, S., Fattore, L., Lucca, G., Cresti, A., Cardillo, A., Fera, M.S., Vennettilli, F., Gaudio, C., Paravati, V., Caldarola, P., Locuratolo, N., Verlato, R., De Conti, F., Turiano, G., Preti, G., Moretti, L., Silenzi, S., Colonna, G., Picciolo, A., Nicosia, A., Cascone, C., Di Sciascio, G., Mangiacapra, F., Russo, A., Mastroianno, S., Esposito, G., Cosmi, F., D'Orazio, S., Costantini, C., Lanari, A., De Rosa, P., Esposito, L., Bilato, C., Valle, C Dalla, Ceresa, M., Colombo, E., Pennisi, V., Casciola, G., Driussi, M., Bisceglia, T., Scalvini, S., Rivadossi, F., Volpe, M., Comito, F., Scorzoni, D., Grimoldi, P., Lagioia, R., Santoro, D., De Cesare, N., Comotti, T., Poli, A., Martina, P., Musolino, M.F., Multari, E.I., Bilardo, G., Scalchi, G., Olivieri, C., Caranci, F., Pavan, D., Ganci, G., Mariani, A., Falchetti, E., Lanzillo, T., Caccavale, A., Bongo, A.S., Rizzi, A., Favilli, R., Maffei, S., Mallardo, M., Fulgione, C., Bordin, F., Bonmassari, R., Battaia, E., Puzzo, A., Vianello, G., D'Arpino, A., Romei, M., Pajes, G., Petronzelli, S., Ghezzi, F., Brigido, S., Pignatelli, L., Brscic, E., Sori, P., Russo, M., Biancolillo, E., Ignone, G., De Giorgio, N.A., Campaniello, C., Ponticelli, P., Margonato, A., Gerosa, S., Cutaia, A., Casalicchio, C., Bartolomucci, F., Larosa, C., Spadafina, T., Putignano, A., De Cristofaro, R., Bernardi, L., Sommariva, L., Celestini, A., Bertucci, C.M., Marchetti, M., Grisolia, E Franceschini, Ammendolea, C., Carini, M., Scipione, P., Politano, M., Rubino, G., Reina, C., Peccerillo, N., Paloscia, L., D'Alleva, A., Petacchi, R., Pignalosa, M., Lucchetti, D., Di Palma, F., La Mastra, R.A., Filippis, M De, Fontanella, B., Zanini, G., Casolo, G., Del Meglio, J., Parato, V.M., Genovesi, E., D'Alimonte, A., Miglioranza, A., Alessandri, N., Moscariello, F., Mauro, C., Sasso, A., Caso, P., Petrillo, C., Napoletano, C., Paparoni, S.R., Bernardo, V., Serdoz, R., Rotunno, R., Oppo, I., Aloisio, A., Aurelio, A., Licciardello, G., Cassaniti, L., Gulizia, M.M., Francese, G.M., Marcassa, C., Villani, R., Zorzoli, F., Mileto, F., Vecchis, M De, Scolozzi, D., Lupi, G., Caruso, D., Rebulla, E., La Fata, B., Anselmi, M., Girardi, P., Borruso, E., Ferrantelli, G., Sassone, B., Bressan, S., Capriolo, M., Pelissero, E., Piancastelli, M., Gobbi, M., Cocco, F., 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Leonardo, Temporelli, Pier Luigi, Gulizia, Michele Massimo, Gonzini, Lucio, Ammaturo, Tiziana Anita, Tedesco, Luigi, Pede, Silvia, Oliva, Fabrizio, Gabrielli, Domenico, Colivicchi, Furio, Averna, Maurizio R.
Publikováno v:
In Nutrition, Metabolism and Cardiovascular Diseases December 2023 33(12):2398-2405
Akademický článek
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Publikováno v:
Proceedings of The Royal Society A, 474(2218), 2018
Sensitivity analysis of biochemical reactions aims at quantifying the dependence of the reaction dynamics on the reaction rates. The computation of the parameter sensitivities, however, poses many computational challenges when taking stochastic noise
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1707.09193
Autor:
Danilo Tomasoni, Alessio Paris, Stefano Giampiccolo, Federico Reali, Giulia Simoni, Luca Marchetti, Chanchala Kaddi, Susana Neves-Zaph, Corrado Priami, Karim Azer, Rosario Lombardo
Publikováno v:
Communications Biology, Vol 4, Iss 1, Pp 1-10 (2021)
Lombardo and colleagues present QSPcc, a computational code compiler designed to convert code from popular scientific programming languages, such as MATLAB or R, into fast-running C code. This reduces the computational load required for complex model
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/bbfb9707f88c446087e6464dcdeadb0c
Autor:
Alina Sîrbu, Greta Barbieri, Francesco Faita, Paolo Ferragina, Luna Gargani, Lorenzo Ghiadoni, Corrado Priami
Publikováno v:
Scientific Reports, Vol 11, Iss 1, Pp 1-14 (2021)
Abstract With the outbreak of COVID-19 exerting a strong pressure on hospitals and health facilities, clinical decision support systems based on predictive models can help to effectively improve the management of the pandemic. We present a method for
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/34716b8d4543467a9ae9c449c07676a4
Publikováno v:
PLoS Computational Biology, Vol 18, Iss 5, p e1009531 (2022)
Schizophrenia is a debilitating psychiatric disorder, leading to both physical and social morbidity. Worldwide 1% of the population is struggling with the disease, with 100,000 new cases annually only in the United States. Despite its importance, the
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/8999a3ea27934315a361941094e501fe
Publikováno v:
IEEE Access, Vol 8, Pp 150999-151011 (2020)
The body of biomedical literature is growing at an unprecedented rate, exceeding the ability of researchers to make effective use of this knowledge-rich amount of information. This growth has created interest in biomedical relation extraction approac
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/565ecbac68fb46119c5b86a3d16508b2
Autor:
Karla Misselbeck, Silvia Parolo, Francesca Lorenzini, Valeria Savoca, Lorena Leonardelli, Pranami Bora, Melissa J. Morine, Maria Caterina Mione, Enrico Domenici, Corrado Priami
Publikováno v:
Nature Communications, Vol 10, Iss 1, Pp 1-14 (2019)
Metabolic syndrome is characterized by complex phenotypes that increases the risk of cardiovascular disease and type 2 diabetes. Here the authors’ integrative network analysis suggests BTK inhibitor ibrutinib to be a promising treatment through its
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/f96705c65bfd49bc85730e82b064dab7
Autor:
Lorena Leonardelli, Giuseppe Lofano, Gianluca Selvaggio, Silvia Parolo, Stefano Giampiccolo, Danilo Tomasoni, Enrico Domenici, Corrado Priami, Haifeng Song, Duccio Medini, Luca Marchetti, Emilio Siena
Publikováno v:
Frontiers in Immunology, Vol 12 (2021)
RNA vaccines represent a milestone in the history of vaccinology. They provide several advantages over more traditional approaches to vaccine development, showing strong immunogenicity and an overall favorable safety profile. While preclinical testin
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/2339446d667e4c499e4d3df6c6ee4afe