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Autor:
Salcedo, A., Tarabichi, M., Espiritu, S.M.G., Deshwar, A.G., David, M., Wilson, N.M., Dentro, S., Wintersinger, J.A., Liu, L.Y., Ko, M., Sivanandan, S., Zhang, H., Zhu, K., Ou Yang, T.-H., Chilton, J.M., Buchanan, A., Lalansingh, C.M., P’ng, C., Anghel, C.V., Umar, I., Lo, B., Zou, W., Jha, A., Huang, T., Yang, T.-P., Peifer, M., Sahinalp, C., Malikic, S., Vázquez-García, I., Mustonen, V., Yang, H.-T., Lee, K.-R., Ji, Y., Sengupta, Subhajit, Rudewicz, J., Nikolski, M., Schaeverbeke, Q., Yuan, K., Markowetz, F., Macintyre, G., Cmero, M., Chaudhary, B., Leshchiner, I., Livitz, D., Getz, G., Loher, P., Yu, K., Wang, W., Zhu, H., Simpson, J.T., Stuart, J.M., Anastassiou, D., Guan, Y., Ewing, A.D., Ellrott, K., Wedge, D.C., Morris, Q., Van Loo, P., Boutros, P.C.
Publikováno v:
Nature biotechnology
Salcedo, A, Tarabichi, M, Espiritu, S M G, Deshwar, A G, David, M, Wilson, N M, Dentro, S, Wintersinger, J A, Liu, L Y, Ko, M, Sivanandan, S, Zhang, H, Zhu, K, Ou Yang, T-H, Chilton, J M, Buchanan, A, Lalansingh, C M, P’ng, C, Anghel, C V, Umar, I, Lo, B, Zou, W, Jha, A, Huang, T, Yang, T-P, Peifer, M, Sahinalp, C, Malikic, S, Vázquez-García, I, Mustonen, V, Yang, H-T, Lee, K-R, Ji, Y, Sengupta, S, Rudewicz, J, Nikolski, M, Schaeverbeke, Q, Yuan, K, Markowetz, F, Macintyre, G, Cmero, M, Chaudhary, B, Leshchiner, I, Livitz, D, Getz, G, Loher, P, Yu, K, Wang, W, Zhu, H, Simpson, J T, Stuart, J M, Anastassiou, D, Guan, Y, Ewing, A D, Ellrott, K, Wedge, D C, Morris, Q, Van Loo, P & Boutros, P C 2020, ' A community effort to create standards for evaluating tumor subclonal reconstruction ', Nature biotechnology, vol. 38, pp. 97-107 . https://doi.org/10.1038/s41587-019-0364-z
Nature Biotechnology
Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2020, 38 (1), pp.97-107. ⟨10.1038/s41587-019-0364-z⟩
Salcedo, A, Tarabichi, M, Espiritu, S M G, Deshwar, A G, David, M, Wilson, N M, Dentro, S, Wintersinger, J A, Liu, L Y, Ko, M, Sivanandan, S, Zhang, H, Zhu, K, Ou Yang, T-H, Chilton, J M, Buchanan, A, Lalansingh, C M, P’ng, C, Anghel, C V, Umar, I, Lo, B, Zou, W, Jha, A, Huang, T, Yang, T-P, Peifer, M, Sahinalp, C, Malikic, S, Vázquez-García, I, Mustonen, V, Yang, H-T, Lee, K-R, Ji, Y, Sengupta, S, Rudewicz, J, Nikolski, M, Schaeverbeke, Q, Yuan, K, Markowetz, F, Macintyre, G, Cmero, M, Chaudhary, B, Leshchiner, I, Livitz, D, Getz, G, Loher, P, Yu, K, Wang, W, Zhu, H, Simpson, J T, Stuart, J M, Anastassiou, D, Guan, Y, Ewing, A D, Ellrott, K, Wedge, D C, Morris, Q, Van Loo, P & Boutros, P C 2020, ' A community effort to create standards for evaluating tumor subclonal reconstruction ', Nature biotechnology, vol. 38, pp. 97-107 . https://doi.org/10.1038/s41587-019-0364-z
Nature Biotechnology
Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2020, 38 (1), pp.97-107. ⟨10.1038/s41587-019-0364-z⟩
Tumor DNA sequencing data can be interpreted by computational methods that analyse genomic heterogeneity to infer evolutionary dynamics. A growing number of studies have used these approaches to link cancer evolution with clinical progression and res
Autor:
Bailey M. H., Meyerson W. U., Dursi L. J., Wang L. -B., Dong G., Liang W. -W., Weerasinghe A., Li S., Li Y., Kelso S., Akbani R., Anur P., Buchanan A., Chiotti K., Covington K., Creason A., Ding L., Ellrott K., Fan Y., Foltz S., Getz G., Hale W., Haussler D., Hess J. M., Hutter C. M., Kandoth C., Kasaian K., Kasapi M., Larson D., Leshchiner I., Letaw J., Ma S., McLellan M. D., Men Y., Mills G. B., Niu B., Peto M., Radenbaugh A., Reynolds S. M., Saksena G., Sofia H., Stewart C., Struck A. J., Stuart J. M., Wang W., Weinstein J. N., Wheeler D. A., Wong C. K., Xi L., Ye K., Bieg M., Boutros P. C., Buchhalter I., Butler A. P., Chen K., Chong Z., Drechsel O., Jonathan Dursi L., Eils R., Espiritu S. M. G., Fulton R. S., Gao S., Gelpi J. L., Gerstein M. B., Gonzalez S., Gut I. G., Hach F., Heinold M. C., Hinton J., Hu T., Huang V., Huang Y., Hutter B., Jones D. R., Jung J., Jager N., Kim H. -L., Kleinheinz K., Kumar S., Kumar Y., Lalansingh C. M., Letunic I., Livitz D., Ma E. Z., Maruvka Y. 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Publikováno v:
Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-1 (2020)
Nature communications, vol 11, iss 1
Nature communications, vol 11, iss 1
Weitere Nicht-UDE-Autoren sind nicht genannt. Originalpublikation: 10.1038/s41467-020-18151-y. CA extern The original version of this Article omitted from the author list the 9th author Yize Li, who is from the ‘The McDonnell Genome Institute at Wa
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::58a5f62c8099f02a9addd94129605a52
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/33257764
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/33257764
Autor:
Li C. H., Prokopec S. D., Sun R. X., Yousif F., Schmitz N., Al-Shahrour F., Atwal G., Bailey P. J., Biankin A. V., Boutros P. C., Campbell P. J., Chang D. K., Cooke S. L., Deshpande V., Faltas B. M., Faquin W. C., Garraway L., Getz G., Grimmond S. M., Haider S., Hoadley K. A., Jiao W., Kaiser V. B., Karlic R., Kato M., Kubler K., Lazar A. J., Louis D. N., Margolin A., Martin S., Nahal-Bose H. K., Nielsen G. P., Nik-Zainal S., Omberg L., P'ng C., Perry M. D., Polak P., Rheinbay E., Rubin M. A., Semple C. A., Sgroi D. C., Shibata T., Siebert R., Smith J., Stein L. D., Stobbe M. D., Thai K., Wright D. W., Wu C. -L., Yuan K., Zhang J., Aaltonen L. A., Abascal F., Abeshouse A., Aburatani H., Adams D. J., Agrawal N., Ahn K. S., Ahn S. -M., Aikata H., Akbani R., Akdemir K. C., Al-Ahmadie H., Al-Sedairy S. T., Alawi M., Albert M., Aldape K., Alexandrov L. B., Ally A., Alsop K., Alvarez E. G., Amary F., Amin S. B., Aminou B., Ammerpohl O., Anderson M. 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P., Tsao M., Tsunoda T., Tubio J. M. C., Tucker O., Turkington R., Turner D. J., Tutt A., Ueno M., Ueno N. T., Umbricht C., Umer H. M., Underwood T. J., Urban L., Urushidate T., Ushiku T., Uuskula-Reimand L., Valencia A., Van Den Berg D. J., Van Laere S., Van Loo P., Van Meir E. G., Van den Eynden G. G., Van der Kwast T., Vasudev N., Vazquez M., Vedururu R., Veluvolu U., Vembu S., Verbeke L. P. C., Vermeulen P., Verrill C., Viari A., Vicente D., Vicentini C., Raghavan K. V., Viksna J., Vilain R. E., Villasante I., Vincent-Salomon A., Visakorpi T., Voet D., Vyas P., Vazquez-Garcia I., Waddell N. M., Waddell N., Wadelius C., Wadi L., Wagener R., Wala J. A., Wang J., Wang L., Wang Q., Wang W., Wang Y., Wang Z., Waring P. M., Warnatz H. -J., Warrell J., Warren A. Y., Waszak S. M., Wedge D. C., Weichenhan D., Weinberger P., Weinstein J. N., Weischenfeldt J., Weisenberger D. J., Welch I., Wendl M. C., Werner J., Whalley J. P., Wheeler D. A., Whitaker H. C., Wigle D., Wilkerson M. D., Williams A., Wilmott J. S., Wilson G. W., Wilson J. M., Wilson R. K., Winterhoff B., Wintersinger J. A., Wiznerowicz M., Wolf S., Wong B. H., Wong T., Wong W., Woo Y., Wood S., Wouters B. G., Wright A. J., Wright M. H., Wu D. -Y., Wu G., Wu J., Wu K., Wu Y., Wu Z., Xi L., Xia T., Xiang Q., Xiao X., Xing R., Xiong H., Xu Q., Xu Y., Xue H., Yachida S., Yakneen S., Yamaguchi R., Yamaguchi T. N., Yamamoto M., Yamamoto S., Yamaue H., Yang F., Yang H., Yang J. Y., Yang L., Yang S., Yang T. -P., Yang Y., Yao X., Yaspo M. -L., Yates L., Yau C., Ye C., Ye K., Yellapantula V. D., Yoon C. J., Yoon S. -S., Yu J., Yu K., Yu W., Yu Y., Yuan Y., Yuen D., Yung C. K., Zaikova O., Zamora J., Zapatka M., Zenklusen J. C., Zenz T., Zeps N., Zhang C. -Z., Zhang F., Zhang H., Zhang X., Zhang Y., Zhang Z., Zhao Z., Zheng L., Zheng X., Zhou W., Zhou Y., Zhu B., Zhu H., Zhu J., Zhu S., Zou L., Zou X., deFazio A., van As N., van Deurzen C. H. M., van de Vijver M. J., Veer L., von Mering C.
Publikováno v:
Nature Communications, 11 (1)
Nature communications, vol 11, iss 1
11:4330
Nature Communications
Li, C H, Prokopec, S D, Sun, R X, Yousif, F, Schmitz, N, PCAWG Tumour Subtypes and Clinical Translation, Boutros, P C & PCAWG Consortium 2020, ' Sex differences in oncogenic mutational processes ', Nature Communications, vol. 11, 4330 . https://doi.org/10.1038/s41467-020-17359-2
Nature Communications, 11
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Li, Constance H; Prokopec, Stephenie D; Sun, Ren X; Yousif, Fouad; Schmitz, Nathaniel; Boutros, Paul C (2020). Sex differences in oncogenic mutational processes. Nature communications, 11(1), p. 4330. 10.1038/s41467-020-17359-2
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Nature communications, 11(1):4330. Nature Publishing Group
NATURE COMMUNICATIONS
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Li, C H, Prokopec, S D, Sun, R X, Yousif, F, Schmitz, N, Boutros, P C, PCAWG Tumour Subtypes and Clinical Translation & Brunak, S 2020, ' Sex differences in oncogenic mutational processes ', Nature Communications, vol. 11, no. 1, 4330 . https://doi.org/10.1038/s41467-020-17359-2
Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-24 (2020)
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Universidad de Barcelona
Li, C H, Prokopec, S D, Sun, R X, Yousif, F, Schmitz, N & Boutros, P C 2020, ' Sex differences in oncogenic mutational processes ', Nat Commun, vol. 11, no. 1, pp. 4330 . https://doi.org/10.1038/s41467-020-17359-2
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Sex differences have been observed in multiple facets of cancer epidemiology, treatment and biology, and in most cancers outside the sex organs. Efforts to link these clinical differences to specific molecula
Sex differences have been observed in multiple facets of cancer epidemiology, treatment and biology, and in most cancers outside the sex organs. Efforts to link these clinical differences to specific molecula
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Autor:
Ewing AD, Houlahan KE, Hu Y, Ellrott K, Caloian C, Yamaguchi TN, Bare JC, P'ng C, Waggott D, Sabelnykova VY, ICGC-TCGA DREAM Somatic Mutation Calling Challenge participants, Kellen MR, Norman TC, Haussler D, Friend SH, Stolovitzky G, Margolin AA, Stuart JM, Boutros PC
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The detection of somatic mutations from cancer genome sequences is key to understanding the genetic basis of disease progression, patient survival and response to therapy. Benchmarking is needed for tool assessment and improvement but is complicated
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Akademický článek
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