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Autor:
Izadi-Pruneyre N; Bacterial Transmembrane Systems Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR, Paris, France., Karami Y; Structural Bioinformatics Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR, Paris, France., Nilges M; Structural Bioinformatics Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR, Paris, France. michael.nilges@pasteur.fr.
Publikováno v:
Sub-cellular biochemistry [Subcell Biochem] 2024; Vol. 104, pp. 549-563.
Autor:
Serrano T; Membrane Traffic and Cell Division Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3691, Paris F-75015, France., Casartelli N; Virology department, Virus and Immunity Lab, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris F-75015, France., Ghasemi F; Université Paris Cité, CNRS, Institut Jacques Monod, Paris F-75013, France., Wioland H; Université Paris Cité, CNRS, Institut Jacques Monod, Paris F-75013, France., Cuvelier F; Membrane Traffic and Cell Division Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3691, Paris F-75015, France., Salles A; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Photonic Bio-Imaging Unit, Centre de Ressources et Recherches Technologiques (UTechS-PBI, C2RT), Paris F-75015, France., Moya-Nilges M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Ultrastructural BioImaging, Paris F-75015, France., Welker L; Université de Strasbourg, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Architecture et Réactivité de l'ARN, CNRS UPR9002, Strasbourg F-67084, France.; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Department of Integrated Structural Biology, CNRS UMR 7104, Inserm U 1258, University of Strasbourg, Illkirch F-67404, France., Bernacchi S; Université de Strasbourg, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Architecture et Réactivité de l'ARN, CNRS UPR9002, Strasbourg F-67084, France., Ruff M; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Department of Integrated Structural Biology, CNRS UMR 7104, Inserm U 1258, University of Strasbourg, Illkirch F-67404, France., Jégou A; Université Paris Cité, CNRS, Institut Jacques Monod, Paris F-75013, France., Romet-Lemonne G; Université Paris Cité, CNRS, Institut Jacques Monod, Paris F-75013, France., Schwartz O; Virology department, Virus and Immunity Lab, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris F-75015, France., Frémont S; Membrane Traffic and Cell Division Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3691, Paris F-75015, France., Echard A; Membrane Traffic and Cell Division Unit, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3691, Paris F-75015, France.
Publikováno v:
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proc Natl Acad Sci U S A] 2024 Nov 26; Vol. 121 (48), pp. e2407835121. Date of Electronic Publication: 2024 Nov 18.
Autor:
Somboon K; School of Chemistry, University of Southampton, Southampton, United Kingdom., Melling O; School of Chemistry, University of Southampton, Southampton, United Kingdom., Lejeune M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Bacterial Transmembrane Systems Unit, Paris, France., Pinheiro GMS; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Bacterial Transmembrane Systems Unit, Paris, France., Paquelin A; Institut de Biologie Physico-Chimique, UMR 7099, CNRS Université de Paris, Paris, France., Bardiaux B; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Bacterial Transmembrane Systems Unit, Paris, France., Nilges M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France., Delepelaire P; Institut de Biologie Physico-Chimique, UMR 7099, CNRS Université de Paris, Paris, France., Khalid S; School of Chemistry, University of Southampton, Southampton, United Kingdom.; Department of Biochemistry, University of Oxford, Oxford, United Kingdom., Izadi-Pruneyre N; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR3528, Bacterial Transmembrane Systems Unit, Paris, France.
Publikováno v:
MBio [mBio] 2024 Oct 30, pp. e0178124. Date of Electronic Publication: 2024 Oct 30.
Autor:
Schmidt S; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France.; Sorbonne Université, Collège Doctoral, Paris, France., Mondino S; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France., Gomez-Valero L; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France., Escoll P; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France., Mascarenhas DPA; Department of Cell Biology, Medical School of Ribeirão Preto, FMRP/USP, Ribeirão Preto, Brazil., Gonçalves A; Department of Cell Biology, Medical School of Ribeirão Preto, FMRP/USP, Ribeirão Preto, Brazil., Camara PHM; Department of Cell Biology, Medical School of Ribeirão Preto, FMRP/USP, Ribeirão Preto, Brazil., Garcia Rodriguez FJ; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France., Rusniok C; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France., Sachse M; UTechS UBI, Centre de Ressources et Recherches Technologiques, Institut Pasteur, Paris, France., Moya-Nilges M; UTechS UBI, Centre de Ressources et Recherches Technologiques, Institut Pasteur, Paris, France., Fontaine T; Biologie et Pathogénicité fongiques, Institut Pasteur, Paris, France., Zamboni DS; Department of Cell Biology, Medical School of Ribeirão Preto, FMRP/USP, Ribeirão Preto, Brazil., Buchrieser C; Institut Pasteur, Université Paris Cité, Biologie des Bactéries Intracellulaires, CNRS UMR 6047, Paris, France.
Publikováno v:
PLoS pathogens [PLoS Pathog] 2024 Sep 11; Vol. 20 (9), pp. e1012534. Date of Electronic Publication: 2024 Sep 11 (Print Publication: 2024).
Autor:
Mareuil F; Bioinformatics and Biostatistics Hub, Département Biologie Computationnelle, Institut Pasteur, USR 3756 CNRS, 75015 Paris, France., Moine-Franel A; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, 75015 Paris, France.; Collège Doctoral, Sorbonne Université, 75005 Paris, France., Kar A; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, 75015 Paris, France., Nilges M; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, 75015 Paris, France., Ciambur CB; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, 75015 Paris, France., Sperandio O; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, 75015 Paris, France.
Publikováno v:
Bioinformatics (Oxford, England) [Bioinformatics] 2024 Jul 01; Vol. 40 (7).
Autor:
Izadi A; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Karami Y; Université de Lorraine, CNRS, Inria, LORIA, F-54000, Nancy, France.; Institut Pasteur, Université Paris cite, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, F-75015, Paris, France., Bratanis E; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Wrighton S; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Khakzad H; Université de Lorraine, CNRS, Inria, LORIA, F-54000, Nancy, France., Nyblom M; Department of Biology & Lund Protein Production Platform (LP3), Lund University, Lund, Sweden., Olofsson B; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Happonen L; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Tang D; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Sundwall M; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Godzwon M; Department of Immunotechnology and SciLifeLab Drug Discovery and Development Platform, Lund University, Lund, Sweden., Chao Y; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Toledo AG; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Schmidt T; Department of Clinical Sciences Lund, Division of Pediatrics, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Ohlin M; Department of Immunotechnology and SciLifeLab Drug Discovery and Development Platform, Lund University, Lund, Sweden., Nilges M; Institut Pasteur, Université Paris cite, CNRS UMR3528, Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, F-75015, Paris, France., Malmström J; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Bahnan W; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Shannon O; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden.; Section for Oral Biology and Pathology, Faculty of Odontology, Malmö University, Malmö, Sweden., Malmström L; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden., Nordenfelt P; Department of Clinical Sciences Lund, Infection Medicine, Faculty of Medicine, Lund University, Lund, Sweden. pontus.nordenfelt@med.lu.se.; Department of Laboratory Medicine, Clinical Microbiology, Skåne University Hospital Lund, Lund University, Lund, Sweden. pontus.nordenfelt@med.lu.se.
Publikováno v:
Nature communications [Nat Commun] 2024 Apr 27; Vol. 15 (1), pp. 3600. Date of Electronic Publication: 2024 Apr 27.
Autor:
Moine-Franel A; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, Paris, France.; Collège Doctoral, Sorbonne Université, Paris, F-75005, France., Mareuil F; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, Paris, France., Nilges M; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, Paris, France., Ciambur CB; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, Paris, France., Sperandio O; Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3528, Paris, France. olivier.sperandio@pasteur.fr.
Publikováno v:
Scientific data [Sci Data] 2024 Apr 20; Vol. 11 (1), pp. 402. Date of Electronic Publication: 2024 Apr 20.
Autor:
Gleeson PJ; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France.; Department of Medicine, School of Microbiology, APC Microbiome Ireland, University College Cork, Cork T12 Y337 Ireland.; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Bichat-Claude Bernard, Service de Néphrologie, Paris 75018, France., Benech N; Sorbonne Université, INSERM, Centre de Recherche Saint-Antoine, CRSA, AP-HP, Saint Antoine Hospital, Gastroenterology Department, Paris 75012, France.; Paris Center for Microbiome Medicine (PaCeMM) FHU, Paris 75012, France.; Hospices Civils de Lyon, Claude Bernard Lyon 1 University, CRCL, 69003 Lyon, France., Chemouny J; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France.; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, 78350 Jouy-en-Josas, France., Metallinou E; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Berthelot L; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., da Silva J; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Bex-Coudrat J; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Boedec E; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Canesi F; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Bounaix C; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Morelle W; Université Lille, Centre National de la Recherche Française, UMR 8576-Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle-Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle, F-59000 Lille, France., Moya-Nilges M; Unité Technologie et Service Bioimagerie Ultrastructurale (UTechS UBI), Institut Pasteur, 28 Rue Du Docteur Roux, 75015 Paris, France., Kenny J; Teagasc Food Research Centre, Moorepark, Fermoy, Co. Cork P61 C996 Ireland.; APC Microbiome Ireland, University College Cork, College Road, Cork, T12 YT20 Ireland., O'Mahony L; Department of Medicine, School of Microbiology, APC Microbiome Ireland, University College Cork, Cork T12 Y337 Ireland., Saveanu L; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France., Arnulf B; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Saint Louis, Service d'Immuno-Hématologie, Myosotis 4, 75010 Paris, France., Sannier A; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Bichat-Claude Bernard, Service d'Anatomie-Pathologique, 75018 Paris, France., Daugas E; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France.; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Bichat-Claude Bernard, Service de Néphrologie, Paris 75018, France., Vrtovsnik F; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France.; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Bichat-Claude Bernard, Service de Néphrologie, Paris 75018, France., Lepage P; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, 78350 Jouy-en-Josas, France., Sokol H; Sorbonne Université, INSERM, Centre de Recherche Saint-Antoine, CRSA, AP-HP, Saint Antoine Hospital, Gastroenterology Department, Paris 75012, France.; Paris Center for Microbiome Medicine (PaCeMM) FHU, Paris 75012, France.; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, 78350 Jouy-en-Josas, France., Monteiro RC; Université Paris Cité, INSERM UMR1149 and CNRS EMR8252, Centre de Recherche sur l'Inflammation, Inflamex Laboratory of Excellence, Paris 75018, France.; AP-HP, Nord/université de Paris, hôpital Bichat-Claude Bernard, Service d'Immunologie, 75018 Paris, France.
Publikováno v:
Science translational medicine [Sci Transl Med] 2024 Mar 27; Vol. 16 (740), pp. eadl6149. Date of Electronic Publication: 2024 Mar 27.
Autor:
Filella-Merce I; Life Sciences Department, Electronic and Atomic Protein Modeling Group (EAPM), Barcelona Supercomputing Center (BSC), Barcelona, Spain.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France., Mallet V; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France., Durand E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de La Méditerranée (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de La Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 7255, Marseille, France., Nilges M; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France., Bouvier G; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 3528, Structural Bioinformatics Unit, Paris, France., Pellarin R; Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB), University of Lyon, Centre National de La Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 5086, Lyon, France.; Laboratoire de Biologie et Modélisation de La Cellule, École Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm U1293, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.
Publikováno v:
Frontiers in bioinformatics [Front Bioinform] 2024 Jan 26; Vol. 4, pp. 1321508. Date of Electronic Publication: 2024 Jan 26 (Print Publication: 2024).
Autor:
Kandolo O; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 7255, Marseille, France., Cherrak Y; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 7255, Marseille, France., Filella-Merce I; Institut Pasteur, Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Paris, France.; Sorbonne Université, Collège doctoral, Paris, France., Le Guenno H; Microscopy Core Facility, Aix Marseille Univ, CNRS, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Marseille Cedex 20, France., Kosta A; Microscopy Core Facility, Aix Marseille Univ, CNRS, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Marseille Cedex 20, France., Espinosa L; Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de la Recherche Scientifique, Marseille, France., Santucci P; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 7255, Marseille, France., Verthuy C; Proteomic Core Facility IMM, Marseille Protéomique (MaP), Aix Marseille Univ, Marseille Cedex 20, France., Lebrun R; Proteomic Core Facility IMM, Marseille Protéomique (MaP), Aix Marseille Univ, Marseille Cedex 20, France., Nilges M; Institut Pasteur, Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Paris, France., Pellarin R; Institut Pasteur, Structural Bioinformatics Unit, Department of Structural Biology and Chemistry, Paris, France., Durand E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-UMR 7255, Marseille, France.; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies and Biotechnologie (IM2B), Aix-Marseille Université, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Marseille, France.
Publikováno v:
PLoS pathogens [PLoS Pathog] 2023 Sep 28; Vol. 19 (9), pp. e1011687. Date of Electronic Publication: 2023 Sep 28 (Print Publication: 2023).