Zobrazeno 1 - 10
of 28
pro vyhledávání: '"Ng, Duncan Y. K."'
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Additional file 11 of LotuS2: an ultrafast and highly accurate tool for amplicon sequencing analysis
Autor:
Özkurt, Ezgi, Fritscher, Joachim, Soranzo, Nicola, Ng, Duncan Y. K., Davey, Robert P., Bahram, Mohammad, Hildebrand, Falk
Additional file 11: Supplementary Figure S7. Observed composition of the mock community compared to the composition predicted by each pipeline. A) Relative abundances of the 16 orders having the highest abundance. B) Bray-Curtis distance based PCoA o
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::40221e8aeef4e05f5c740ea0ab32f18c
Autor:
Özkurt, Ezgi, Fritscher, Joachim, Soranzo, Nicola, Ng, Duncan Y. K., Davey, Robert P., Bahram, Mohammad, Hildebrand, Falk
Additional file 7: Supplementary Figure S3. Reproducibility of the technical replicates respective to different LotuS2 non-default parameters. Bray-Curtis distances between technical replicates of A) gut-16S, B) soil-16S, and C) soil-ITS datasets usi
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::3e1250399826ef556c9fcdd558771edf
Autor:
Özkurt, Ezgi, Fritscher, Joachim, Soranzo, Nicola, Ng, Duncan Y. K., Davey, Robert P., Bahram, Mohammad, Hildebrand, Falk
Additional file 8: Supplementary Figure S4. Data usage efficiency of different amplicon sequence data analysis pipelines. Data usage efficiency on gut 16S rRNA (gut- 16S) and soil 16S rRNA (soil-16S) amplicons tested with different pipelines at diffe
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::5cacd544d8f3414618374f0a21171bed
Autor:
Özkurt, Ezgi, Fritscher, Joachim, Soranzo, Nicola, Ng, Duncan Y. K., Davey, Robert P., Bahram, Mohammad, Hildebrand, Falk
Additional file 6: Supplementary Figure S2. Reproducibility and data usage efficiency respective to dereplication filtering. A, D and G) Data usage efficiency of each tested pipeline at different dereplication parameters of LotuS2 (from strictest to
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::0fe487c17b9e89e142a2d93cebaaa615
Autor:
Özkurt, Ezgi, Fritscher, Joachim, Soranzo, Nicola, Ng, Duncan Y. K., Davey, Robert P., Bahram, Mohammad, Hildebrand, Falk
Additional file 9: Supplementary Figure S5. Reproducibility of beta diversity at different read truncation lengths. Reproducibility of sequenced technical replicates by measuring the Bray-Curtis (A and C) and Jaccard distances (B and D) of the microb
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::0c04d51c7ee06ee6231166a9a3b0904f
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.