Structural Space of the Duffy Antigen/Receptor for Chemokines' Intrinsically Disordered Ectodomain 1 Explored by Temperature Replica-Exchange Molecular Dynamics Simulations.

Autor: Kranjc A; Université Paris Cité and Université des Antilles and Université de la Réunion, BIGR, UMR_S1134, DSIMB Team, Inserm, F-75014 Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), F-75015 Paris, France.; Institute of Neuroscience and Medicine (INM-9)/Institute for Advanced Simulation (IAS-5), Forschungszentrum Jülich, D-52425 Jülich, Germany., Narwani TJ; Université Paris Cité and Université des Antilles and Université de la Réunion, BIGR, UMR_S1134, DSIMB Team, Inserm, F-75014 Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), F-75015 Paris, France., Abby SS; University Grenoble Alpes, CNRS, UMR 5525, VetAgro Sup, Grenoble INP, TIMC, F-38000 Grenoble, France., de Brevern AG; Université Paris Cité and Université des Antilles and Université de la Réunion, BIGR, UMR_S1134, DSIMB Team, Inserm, F-75014 Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), F-75015 Paris, France.

Publikováno v: International journal of molecular sciences [Int J Mol Sci] 2023 Aug 26; Vol. 24 (17). Date of Electronic Publication: 2023 Aug 26.

Analysis of Integrin α IIb Subunit Dynamics Reveals Long-Range Effects of Missense Mutations on Calf Domains.

Autor: Anies S; INSERM, BIGR, Université de Paris and Université de la Réunion et Université des Antilles, F-75015 Paris, France., Jallu V; Centre National de Référence en Hémobiologie Périnatale (CNRHP), Site St Antoine, DMU Biologie et Génomique Médicales, AP-HP, Sorbonne Université, F-75012 Paris, France., Diharce J; INSERM, BIGR, Université de Paris and Université de la Réunion et Université des Antilles, F-75015 Paris, France., Narwani TJ; INSERM, BIGR, Université de Paris and Université de la Réunion et Université des Antilles, F-75015 Paris, France., de Brevern AG; INSERM, BIGR, Université de Paris and Université de la Réunion et Université des Antilles, F-75015 Paris, France.

Publikováno v: International journal of molecular sciences [Int J Mol Sci] 2022 Jan 13; Vol. 23 (2). Date of Electronic Publication: 2022 Jan 13.

NOD: a web server to predict New use of Old Drugs to facilitate drug repurposing.

Autor: Narwani TJ; Molecular Biophysics Unit, Indian Institute of Science, Bengaluru, Karnataka, 560012, India., Srinivasan N; Molecular Biophysics Unit, Indian Institute of Science, Bengaluru, Karnataka, 560012, India. ns@iisc.ac.in., Chakraborti S; Molecular Biophysics Unit, Indian Institute of Science, Bengaluru, Karnataka, 560012, India.

Publikováno v: Scientific reports [Sci Rep] 2021 Jun 29; Vol. 11 (1), pp. 13540. Date of Electronic Publication: 2021 Jun 29.

Discrete analyses of protein dynamics.

Autor: Narwani TJ; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France., Craveur P; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Department of Integrative Structural and Computational Biology, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA, USA., Shinada NK; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Discngine, SAS, Paris, France., Floch A; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Etablissement Français du Sang Ile de France, Créteil, France.; IMRB - INSERM U955 Team 2 « Transfusion et Maladies du Globule Rouge », Paris Est- Créteil Univ, Créteil, France.; UPEC, Université Paris Est-Créteil, Créteil, France., Santuz H; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France., Vattekatte AM; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Faculté Des Sciences et Technologies, Saint Denis Messag, La Réunion, France., Srinivasan N; Molecular Biophysics Unit, IISc, Bangalore, India., Rebehmed J; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Department of Computer Science and Mathematics, Lebanese American University, Byblos, Lebanon., Gelly JC; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Faculté Des Sciences et Technologies, Saint Denis Messag, La Réunion, France.; IBL, Paris, France., Etchebest C; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Faculté Des Sciences et Technologies, Saint Denis Messag, La Réunion, France., de Brevern AG; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire D'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Faculté Des Sciences et Technologies, Saint Denis Messag, La Réunion, France.; IBL, Paris, France.

Publikováno v: Journal of biomolecular structure & dynamics [J Biomol Struct Dyn] 2020 Jul; Vol. 38 (10), pp. 2988-3002. Date of Electronic Publication: 2019 Aug 12.

Discrete analysis of camelid variable domains: sequences, structures, and in-silico structure prediction.

Autor: Melarkode Vattekatte A; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Faculté des Sciences et Technologies, Saint Denis, La Réunion, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France., Shinada NK; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; Discngine SAS, Paris, France., Narwani TJ; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France., Noël F; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; PSL Research University, INSERM, UMR 932, Institut Curie, Paris, France.; Université Paris Sud, Université Paris-Saclay, Orsay, France., Bertrand O; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France., Meyniel JP; ISoft, Saint-Aubin, France., Malpertuy A; Atragene, Ivry-sur-Seine, France., Gelly JC; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; IBL, Paris, France., Cadet F; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Faculté des Sciences et Technologies, Saint Denis, La Réunion, France.; Peaccel, Protein Engineering Accelerator, Paris, France., de Brevern AG; Biologie Intégrée du Globule Rouge UMR_S1134, Inserm, Univ. Paris, Univ. de la Réunion, Univ. des Antilles, Paris, France.; Laboratoire d'Excellence GR-Ex, Paris, France.; Faculté des Sciences et Technologies, Saint Denis, La Réunion, France.; Institut National de la Transfusion Sanguine (INTS), Paris, France.; IBL, Paris, France.

Publikováno v: PeerJ [PeerJ] 2020 Mar 06; Vol. 8, pp. e8408. Date of Electronic Publication: 2020 Mar 06 (Print Publication: 2020).