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Publikováno v:
Bioinformatics 34, 485-493 (2018)
Motivation: The high dimensionality of genomic data calls for the development of specific classification methodologies, especially to prevent over-optimistic predictions. This challenge can be tackled by compression and variable selection, which comb
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1502.05933
Autor:
Dumont A; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Mendiboure N; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Savocco J; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Anani L; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Moreau P; Unité Régulation spatiale des génomes, Institut Pasteur, CNRS UMR3525, 75015 Paris, France., Thierry A; Unité Régulation spatiale des génomes, Institut Pasteur, CNRS UMR3525, 75015 Paris, France., Modolo L; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Jost D; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France., Piazza A; Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR5239, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule, 46 Allée d'Italie, 69007 Lyon, France. Electronic address: aurele.piazza@ens-lyon.fr.
Publikováno v:
Molecular cell [Mol Cell] 2024 Sep 05; Vol. 84 (17), pp. 3237-3253.e6. Date of Electronic Publication: 2024 Aug 22.
Autor:
Mercier BC; RNA Therapeutics Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, Massachusetts 01605, USA., Labaronne E; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France.; ADLIN Science, 9100 Evry-Courcouronnes, France., Cluet D; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Guiguettaz L; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Fontrodona N; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Bicknell A; RNA Therapeutics Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, Massachusetts 01605, USA., Corbin A; Centre International de Recherche en Infectiologie Université de Lyon, Inserm U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, F-69007 Lyon, France., Wencker M; Centre International de Recherche en Infectiologie Université de Lyon, Inserm U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon, F-69007 Lyon, France., Aube F; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Modolo L; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Jouravleva K; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Auboeuf D; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France., Moore MJ; RNA Therapeutics Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, Massachusetts 01605, USA; emiliano.ricci@ens-lyon.org melissa.moore@umassmed.edu., Ricci EP; Laboratory of Biology and Modeling of the Cell (LBMC), Université de Lyon, ENS de Lyon, Université Claude Bernard, CNRS UMR 5239, Inserm U1293, 69007 Lyon, France; emiliano.ricci@ens-lyon.org melissa.moore@umassmed.edu.
Publikováno v:
Genome research [Genome Res] 2024 Apr 25; Vol. 34 (3), pp. 394-409. Date of Electronic Publication: 2024 Apr 25.
Akademický článek
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Autor:
Colin L; CNRS - Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Lyon, France.; ENS de Lyon, Université Lyon, site Jacques Monod, Lyon, France., Reyes C; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France., Berthezene J; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France., Maestroni L; CNRS, INSERM, Aix Marseille Université, Institut Paoli-Calmettes, CRCM, Equipe labellisée par la Ligue Nationale contre le Cancer, Marseille, France., Modolo L; CNRS - Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Lyon, France.; ENS de Lyon, Université Lyon, site Jacques Monod, Lyon, France., Toselli E; CNRS - Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Lyon, France.; ENS de Lyon, Université Lyon, site Jacques Monod, Lyon, France., Chanard N; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France.; CBI, MCD-UMR5077, CNRS, Chromatin Dynamics Team, Toulouse, France., Schaak S; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France.; CBI, MCD-UMR5077, CNRS, Chromatin Dynamics Team, Toulouse, France., Cuvier O; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France.; CBI, MCD-UMR5077, CNRS, Chromatin Dynamics Team, Toulouse, France., Gachet Y; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France., Coulon S; CNRS, INSERM, Aix Marseille Université, Institut Paoli-Calmettes, CRCM, Equipe labellisée par la Ligue Nationale contre le Cancer, Marseille, France., Bernard P; CNRS - Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Lyon, France.; ENS de Lyon, Université Lyon, site Jacques Monod, Lyon, France., Tournier S; MCD, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France.
Publikováno v:
ELife [Elife] 2023 Nov 21; Vol. 12. Date of Electronic Publication: 2023 Nov 21.
Autor:
Monnet, C., Camus, F., Modolo, L., Bochud, F., Bischof Delaloye, A., O. Prior, J., R. Verdun, F.
Publikováno v:
In Medecine Nucleaire 2008 32(11):589-595
Autor:
Terrone S; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Valat J; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Fontrodona N; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Giraud G; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Claude JB; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Combe E; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Lapendry A; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Polvèche H; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France.; CECS/AFM, I-STEM, 28 rue Henri Desbruères, F-91100, Corbeil-Essonnes, France., Ameur LB; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Duvermy A; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Modolo L; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Bernard P; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Mortreux F; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Auboeuf D; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France., Bourgeois CF; Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule, Ecole Normale Superieure de Lyon, CNRS, UMR 5239, Inserm, U1293, Universite Claude Bernard Lyon 1, 46 allee d'Italie, F-69364 Lyon, France.
Publikováno v:
Nucleic acids research [Nucleic Acids Res] 2022 Sep 09; Vol. 50 (16), pp. 9226-9246.
Autor:
Zreika S; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.; Azm Center for Research in Biotechnology and its Applications, LBA3B, EDST, Lebanese University, Tripoli, 1300, Lebanon., Fourneaux C; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France., Vallin E; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France., Modolo L; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France., Seraphin R; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France., Moussy A; Ecole Pratique des Hautes Etudes, PSL Research University, UMRS951, INSERM, Univ-Evry, Paris, France., Ventre E; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.; Inria Team Dracula, Inria Center Grenoble Rhone-Alpes, Grenoble, France.; Institut Camille Jordan, CNRS UMR 5208, Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France., Bouvier M; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.; Vidium solutions, Lyon, France., Ozier-Lafontaine A; Nantes Université, Centrale Nantes, Laboratoire de mathématiques Jean Leray, LMJL, F-44000, Nantes, France., Bonnaffoux A; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.; Vidium solutions, Lyon, France., Picard F; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France., Gandrillon O; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France.; Inria Team Dracula, Inria Center Grenoble Rhone-Alpes, Grenoble, France., Gonin-Giraud S; Laboratory of Biology and Modelling of the Cell, Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS, UMR5239, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France. sandrine.giraud@ens-lyon.fr.
Publikováno v:
BMC biology [BMC Biol] 2022 Jul 06; Vol. 20 (1), pp. 155. Date of Electronic Publication: 2022 Jul 06.
Akademický článek
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Autor:
Mold JE; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Modolo L; LBBE, UMR CNRS 5558, Université Lyon 1, Villeurbanne, France LBMC UMR 5239 CNRS/ENS Lyon, Lyon, France., Hård J; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Zamboni M; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Larsson AJM; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Stenudd M; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Eriksson CJ; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Durif G; LBBE, UMR CNRS 5558, Université Lyon 1, Villeurbanne, France LBMC UMR 5239 CNRS/ENS Lyon, Lyon, France., Ståhl PL; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden; Science for Life Laboratory, Department of Gene Technology, KTH Royal Institute of Technology, 106 91 Stockholm, Sweden., Borgström E; Science for Life Laboratory, Department of Gene Technology, KTH Royal Institute of Technology, 106 91 Stockholm, Sweden., Picelli S; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Reinius B; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden; Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Sandberg R; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Réu P; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Talavera-Lopez C; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Andersson B; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden., Blom K; Center for Infectious Medicine, Department of Medicine, Karolinska Institutet, Karolinska University Hospital Huddinge, 141 86 Stockholm, Sweden., Sandberg JK; Center for Infectious Medicine, Department of Medicine, Karolinska Institutet, Karolinska University Hospital Huddinge, 141 86 Stockholm, Sweden., Picard F; LBBE, UMR CNRS 5558, Université Lyon 1, Villeurbanne, France LBMC UMR 5239 CNRS/ENS Lyon, Lyon, France., Michaëlsson J; Center for Infectious Medicine, Department of Medicine, Karolinska Institutet, Karolinska University Hospital Huddinge, 141 86 Stockholm, Sweden. Electronic address: jakob.michaelsson@ki.se., Frisén J; Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, 171 77 Stockholm, Sweden. Electronic address: jonas.frisen@ki.se.
Publikováno v:
Cell reports [Cell Rep] 2021 May 25; Vol. 35 (8), pp. 109174.