Zobrazeno 1 - 10
of 776
pro vyhledávání: '"Mobley, David"'
Autor:
Takaba, Kenichiro, Pulido, Iván, Behara, Pavan Kumar, Cavender, Chapin E., Friedman, Anika J., Henry, Michael M., Opeskin, Hugo MacDermott, Iacovella, Christopher R., Nagle, Arnav M., Payne, Alexander Matthew, Shirts, Michael R., Mobley, David L., Chodera, John D., Wang, Yuanqing
The development of reliable and extensible molecular mechanics (MM) force fields -- fast, empirical models characterizing the potential energy surface of molecular systems -- is indispensable for biomolecular simulation and computer-aided drug design
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2307.07085
Autor:
Cavender, Chapin E., Case, David A., Chen, Julian C. -H., Chong, Lillian T., Keedy, Daniel A., Lindorff-Larsen, Kresten, Mobley, David L., Ollila, O. H. Samuli, Oostenbrink, Chris, Robustelli, Paul, Voelz, Vincent A., Wall, Michael E., Wych, David C., Gilson, Michael K.
This review article provides an overview of structurally oriented, experimental datasets that can be used to benchmark protein force fields, focusing on data generated by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and room temperature (RT) protein
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2303.11056
Autor:
Hahn, David F., Bayly, Christopher I., Macdonald, Hannah E. Bruce, Chodera, John D., Gapsys, Vytautas, Mey, Antonia S. J. S., Mobley, David L., Benito, Laura Perez, Schindler, Christina E. M., Tresadern, Gary, Warren, Gregory L.
Free energy calculations are rapidly becoming indispensable in structure-enabled drug discovery programs. As new methods, force fields, and implementations are developed, assessing their expected accuracy on real-world systems (benchmarking) becomes
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2105.06222
Autor:
Mey, Antonia S. J. S., Allen, Bryce, Macdonald, Hannah E. Bruce, Chodera, John D., Kuhn, Maximilian, Michel, Julien, Mobley, David L., Naden, Levi N., Prasad, Samarjeet, Rizzi, Andrea, Scheen, Jenke, Shirts, Michael R., Tresadern, Gary, Xu, Huafeng
Alchemical free energy calculations are a useful tool for predicting free energy differences associated with the transfer of molecules from one environment to another. The hallmark of these methods is the use of "bridging" potential energy functions
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2008.03067
We consider the recently developed weighted ensemble milestoning (WEM) scheme [J. Chem. Phys. 152, 234114 (2020)], and test its capability of simulating ligand-receptor dissociation dynamics. We performed WEM simulations on the following host-guest s
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2007.09325
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.