Zobrazeno 1 - 10
of 37
pro vyhledávání: '"Mitra, Eshan D."'
Autor:
Mitra, Eshan D., Hlavacek, William S.
Motivation: Recent work has demonstrated the feasibility of using non-numerical, qualitative data to parameterize mathematical models. However, uncertainty quantification (UQ) of such parameterized models has remained challenging because of a lack of
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1909.00072
Autor:
Mitra, Eshan D., Hlavacek, William S.
Mathematical models can provide quantitative insight into immunoreceptor signaling, but require parameterization and uncertainty quantification before making reliable predictions. We review currently available methods and software tools to address th
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1906.11365
Autor:
Mitra, Eshan D., Suderman, Ryan, Colvin, Joshua, Ionkov, Alexander, Hu, Andrew, Sauro, Herbert M., Posner, Richard G., Hlavacek, William S.
In systems biology modeling, important steps include model parameterization, uncertainty quantification, and evaluation of agreement with experimental observations. To help modelers perform these steps, we developed the software PyBioNetFit. PyBioNet
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1903.07750
Autor:
Hlavacek, William S., Longo, Jennifer, Baker, Lewis R., Álamo, María del Carmen Ramos, Ionkov, Alexander, Mitra, Eshan D., Suderman, Ryan, Erickson, Keesha E., Dias, Raquel, Colvin, Joshua, Thomas, Brandon R., Posner, Richard G.
BioNetFit is a software tool designed for solving parameter identification problems that arise in the development of rule-based models. It solves these problems through curve fitting (i.e., nonlinear regression). BioNetFit is compatible with determin
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1809.08321
Lipid phase heterogeneity in the plasma membrane is thought to be crucial for many aspects of cell signaling, but the physical basis of participating membrane domains such as "lipid rafts" remains controversial. Here we consider a lattice model yield
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1802.01067
Autor:
Suderman, Ryan, Mitra, Eshan D., Lin, Yen Ting, Erickson, Keesha E., Feng, Song, Hlavacek, William S.
Gillespie's direct method for stochastic simulation of chemical kinetics is a staple of computational systems biology research. However, the algorithm requires explicit enumeration of all reactions and all chemical species that may arise in the syste
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1801.10227
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.