The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure

Autor: Barquera, R., https://orcid.org/0000-0003-0518-4518, Hernández-Zaragoza, D., Bravo-Acevedo, A., Arrieta-Bolaños, E., Clayton, S., Acuña-Alonzo, V., Martínez-Álvarez, J., López-Gil, C., Adalid-Sáinz, C., Vega-Martínez, M., Escobedo-Ruíz, A., Juárez-Cortés, E., Immel, A., Pacheco-Ubaldo, H., González-Medina, L., Lona-Sánchez, A., Lara-Riegos, J., Sánchez-Fernández, M., Díaz-López, R., Guizar-López, G., Medina-Escobedo, C., Arrazola-García, M., Montiel-Hernández, G., Hernández-Hernández, O., la Cruz, R., Rocío, F., Juárez-Nicolás, F., Pantoja-Torres, J., Rodríguez-Munguía, T., Juárez-Barreto, V., Delgado-Aguirre, H., Escutia-González, A., Goné-Vázquez, I., Benítez-Arvizu, G., Arellano-Prado, F., García-Arias, V., Rodríguez-López, M., Méndez-Mani, P., García-Álvarez, R., González-Martínez, M., Aquino-Rubio, G., Escareño-Montiel, N., Vázquez-Castillo, T., Uribe-Duarte, M., Ruíz-Corral, M., Ortega-Yáñez, A., Bernal-Felipe, N., Gómez-Navarro, B., Arriaga-Perea, A., Martínez-Bezies, V., Macías-Medrano, R., Aguilar-Campos, J., Solís-Martínez, R., Serrano-Osuna, R., Sandoval-Sandoval, M., Jaramillo-Rodríguez, Y., Salgado-Adame, A., Juárez-de la Cruz, F., Novelo-Garza, B., Pavón-Vargas, M., Salgado-Galicia, N., Bortolini, M., Gallo, C., Bedoya, G., Rothhammer, F., González-José, R., Ruiz-Linares, A., Canizales-Quinteros, S., Romero-Hidalgo, S., Krause, J., https://orcid.org/0000-0001-9144-3920, Zúñiga, J., Yunis, E., Bekker-Méndez, C., Granados, J.

Publikováno v: CONICET Digital (CONICET)
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
instacron:CONICET
Human Immunology
Human Immunology, Elsevier, 2020, 81 (9), pp.461-474. ⟨10.1016/j.humimm.2020.06.008⟩
Human Immunology, 2020, 81 (9), pp.461-474. ⟨10.1016/j.humimm.2020.06.008⟩

We studied HLA class I (HLA-A, -B) and class II (HLA-DRB1, -DQB1) allele groups and alleles by PCR-SSP based typing in a total of 15,318 mixed ancestry Mexicans from all the states of the country divided into 78 sample sets, providing information reg

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::00bbf0523edbd53d7840394c41e750e2
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0198-8859(20)30343-8

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The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure.

Autor: Barquera R; Department of Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History (MPI-SHH), Jena, Germany; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico. Electronic address: barquera@shh.mpg.de., Hernández-Zaragoza DI; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico; Immunogenetics Unit, Técnicas Genéticas Aplicadas a la Clínica (TGAC), Mexico City, Mexico., Bravo-Acevedo A; Blood Bank, UMAE Hospital de Gineco Obstetricia No. 4 'Luis Castelazo Ayala', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Arrieta-Bolaños E; Institute for Experimental Cellular Therapy, University Hospital Essen, Essen, Germany., Clayton S; Department of Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History (MPI-SHH), Jena, Germany., Acuña-Alonzo V; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., Martínez-Álvarez JC; HLA Laboratory, Central Blood Bank, Hospital de Especialidades, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE), Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., López-Gil C; Histocompatibility Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 6, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Puebla, Puebla, Mexico., Adalid-Sáinz C; Laboratory of Histocompatibility, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Vega-Martínez MDR; Molecular Biology and Histocompatibility Laboratory, Hospital Central Sur de Alta Especialidad, Petróleos Mexicanos (PEMEX), Mexico City, Mexico., Escobedo-Ruíz A; Histocompatibility Laboratory, Hospital de Especialidades, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Juárez-Cortés ED; Histocompatibility Laboratory, Central Blood Bank, Centro Médico Nacional 'La Raza', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Immel A; Department of Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History (MPI-SHH), Jena, Germany; Institute of Clinical Molecular Biology (IKMB), Kiel University, University Hospital, Schleswig-Holstein, Germany., Pacheco-Ubaldo H; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., González-Medina L; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., Lona-Sánchez A; Molecular Genetics Laboratory, Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., Lara-Riegos J; Chemistry Faculty, Universidad Autónoma de Yucatán (UADY), Mérida, Yucatán, Mexico., Sánchez-Fernández MGJ; Department of Nephrology and Transplantation Unit, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Díaz-López R; Molecular Biology Laboratory, Hospital Central Militar, Secretaría de la Defensa Nacional (SEDENA), Mexico City, Mexico., Guizar-López GU; Molecular Biology Laboratory, Hospital Central Militar, Secretaría de la Defensa Nacional (SEDENA), Mexico City, Mexico., Medina-Escobedo CE; Unit of Research and Education in Health, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 10, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mérida, Yucatán, Mexico., Arrazola-García MA; HLA Laboratory, Central Blood Bank, Hospital de Especialidades, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE), Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Montiel-Hernández GD; Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., Hernández-Hernández O; Immunogenetics Unit, Técnicas Genéticas Aplicadas a la Clínica (TGAC), Mexico City, Mexico., Ramos-de la Cruz FDR; Histocompatibility Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 6, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Puebla, Puebla, Mexico., Juárez-Nicolás F; Molecular Immunogenetics Laboratory, Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., Pantoja-Torres JA; Immunology Division, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 1, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), León, Guanajuato, Mexico., Rodríguez-Munguía TJ; Molecular Biology Laboratory, Hospital General 'Norberto Treviño Zapata', Dirección de Servicios de Salud de Tamaulipas, Ciudad Victoria, Tamaulipas, Mexico., Juárez-Barreto V; Blood Bank, Hospital Infantil de México 'Federico Gómez', Mexico City, Mexico., Delgado-Aguirre H; Laboratory of Histocompatibility, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Escutia-González AB; Molecular Immunogenetics Laboratory, Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., Goné-Vázquez I; Histocompatibility Laboratory, Hospital de Especialidades, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Benítez-Arvizu G; HLA Laboratory, Central Blood Bank, Hospital de Especialidades, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE), Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Arellano-Prado FP; Pediatrics Hospital, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., García-Arias VE; Pediatrics Hospital, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Rodríguez-López ME; Pediatrics Hospital, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Méndez-Mani P; Histocompatibility Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 6, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Puebla, Puebla, Mexico., García-Álvarez R; Pharmacology Laboratory, Research Unit, Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., González-Martínez MDR; Microbiology Department, Faculty of Medicine, Universidad Autónoma de Coahuila, Torreón, Coahuila, Mexico., Aquino-Rubio G; Molecular Biology Laboratory, Hospital General 'Norberto Treviño Zapata', Dirección de Servicios de Salud de Tamaulipas, Ciudad Victoria, Tamaulipas, Mexico., Escareño-Montiel N; Department of Transplantation, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Vázquez-Castillo TV; Department of Molecular Biology, Laboratorios Diagnóstica, Villahermosa, Tabasco, Mexico., Uribe-Duarte MG; Clinical Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 2, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Ciudad Obregón, Sonora, Mexico., Ruíz-Corral MJ; Clinical Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 2, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Ciudad Obregón, Sonora, Mexico., Ortega-Yáñez A; Department of Development Genetics and Molecular Physiology, Instituto de Biotecnología (IBT), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Cuernavaca, Morelos, Mexico., Bernal-Felipe N; Escuela Nacional de Antropología e Historia (ENAH), Mexico City, Mexico., Gómez-Navarro B; Central Office of Nephrology, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico., Arriaga-Perea AJ; Histocompatibility Laboratory, Central Blood Bank, Centro Médico Nacional 'La Raza', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Martínez-Bezies V; Molecular Immunogenetics Laboratory, Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., Macías-Medrano RM; Histocompatibility Laboratory, Central Blood Bank, Centro Médico Nacional 'La Raza', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Aguilar-Campos JA; Clinical Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 2, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Ciudad Obregón, Sonora, Mexico., Solís-Martínez R; Department of Molecular Biology, Laboratorios Diagnóstica, Villahermosa, Tabasco, Mexico., Serrano-Osuna R; Clinical Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 2, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Ciudad Obregón, Sonora, Mexico., Sandoval-Sandoval MJ; Central Office of Transplantation, Centro Médico Nacional de Occidente (CMNO), Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Guadalajara, Jalisco, Mexico; Health Research Division, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Jaramillo-Rodríguez Y; Direction of Health Education and Research, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Salgado-Adame A; Direction of Health Education and Research, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Juárez-de la Cruz F; Department of Transplantation, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 71, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Torreón, Coahuila, Mexico., Novelo-Garza B; Medical Infrastructure Planning Committee, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Pavón-Vargas MLÁ; Histocompatibility Laboratory, Unidad Médica de Alta Especialidad (UMAE) # 6, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Puebla, Puebla, Mexico., Salgado-Galicia N; Molecular Biology and Histocompatibility Laboratory, Hospital Central Sur de Alta Especialidad, Petróleos Mexicanos (PEMEX), Mexico City, Mexico., Bortolini MC; Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Brazil., Gallo C; Laboratorios de Investigación y Desarrollo, Facultad de Ciencias y Filosofía, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru., Bedoya G; Genética Molecular (GENMOL, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia., Rothhammer F; Programa de Genética Humana, ICBM, Facultad de Medicina, Universidad de Chile, Santiago, Chile; Instituto de Alta Investigación, Universidad de Tarapacá, Arica, Chile., González-José R; Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas-Centro Nacional Patagónico, CONICET, Puerto Madryn, Argentina., Ruiz-Linares A; Ministry of Education Key Laboratory of Contemporary Anthropology and Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, Fudan University, Shanghai, China; Aix-Marseille Univ, CNRS, EFS, ADES, Marseille, France., Canizales-Quinteros S; Unidad de Genómica de Poblaciones Aplicada a la Salud, Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México e Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Romero-Hidalgo S; Department of Computational Genomics, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Mexico City, Mexico., Krause J; Department of Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History (MPI-SHH), Jena, Germany., Zúñiga J; Laboratory of Immunobiology and Genetics, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas, Mexico City, Mexico; Tecnologico de Monterrey, Escuela de Medicina y Ciencias de la Salud, Mexico City, Mexico., Yunis EJ; Department of Cancer Immunology and Virology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA, USA., Bekker-Méndez C; Immunology and Infectology Research Unit, Infectology Hospital, Centro Médico Nacional 'La Raza', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Granados J; Department of Transplantation, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición 'Salvador Zubirán' (INCMNSZ), Mexico City, Mexico. Electronic address: julgrate@yahoo.com.

Publikováno v: Human immunology [Hum Immunol] 2020 Sep; Vol. 81 (9), pp. 461-474. Date of Electronic Publication: 2020 Jul 08.