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Genomics and epidemiology of a novel SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil.

Autor: Faria NR; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Department of Zoology, University of Oxford, UK., Mellan TA; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Whittaker C; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Claro IM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Candido DDS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Department of Zoology, University of Oxford, UK., Mishra S; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Crispim MAE; Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia, Manaus, Brazil.; Diretoria de Ensino e Pesquisa, Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia, Manaus, Brazil., Sales FC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Hawryluk I; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., McCrone JT; Institute of Evolutionary Biology, University of Edinburgh, Edinburgh, UK., Hulswit RJG; Division of Structural Biology, Wellcome Centre for Human Genetics, University of Oxford, Oxford, United Kingdom., Franco LAM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Ramundo MS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., de Jesus JG; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Andrade PS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Coletti TM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Ferreira GM; Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, Brazil., Silva CAM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Manuli ER; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Pereira RHM; Institute for Applied Economic Research - Ipea, Brasília, Brazil., Peixoto PS; Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, São Paulo, Brazil., Kraemer MU; Department of Zoology, University of Oxford, UK., Gaburo N Jr; DB Diagnósticos do Brasil, São Paulo, Brazil., Camilo CDC; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Hoeltgebaum H; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Souza WM; Virology Research Centre, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Rocha EC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., de Souza LM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., de Pinho MC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Araujo LJT; Laboratory of Quantitative Pathology, Center of Pathology, Adolfo Lutz Institute, São Paulo, Brazil., Malta FSV; Instituto Hermes Pardini, Brazil., de Lima AB; Instituto Hermes Pardini, Brazil., Silva JDP; Instituto Hermes Pardini, Brazil., Zauli DAG; Instituto Hermes Pardini, Brazil., de S Ferreira AC; Instituto Hermes Pardini, Brazil., Schnekenberg RP; Nuffield Department of Clinical Neurosciences, University of Oxford, UK., Laydon DJ; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Walker PGT; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Schlüter HM; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Dos Santos ALP; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Vidal MS; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Del Caro VS; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Filho RMF; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Dos Santos HM; CDL Laboratório Santos e Vidal, Manaus, Brazil., Aguiar RS; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Modena JLP; Laboratory of Emerging Viruses, Department of Genetics, Evolution, Microbiology and Immunology, Institute of Biology, University of Campinas (UNICAMP), São Paulo, Brazil., Nelson B; Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, Brazil., Hay JA; Department of Epidemiology, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, USA.; Center for Communicable Disease Dynamics, Harvard T H Chan School of Public Health, Boston, MA, USA., Monod M; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Miscouridou X; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Coupland H; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Sonabend R; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Vollmer M; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Gandy A; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Suchard MA; Department of Biomathematics, Department of Biostatistics and Department of Human Genetics, University of California, Los Angeles, CA, USA., Bowden TA; Division of Structural Biology, Wellcome Centre for Human Genetics, University of Oxford, Oxford, United Kingdom., Pond SLK; Institute for Genomics and Evolutionary Medicine, Temple University, USA., Wu CH; Mathematical Sciences, University of Southampton, Southampton, UK., Ratmann O; Department of Mathematics, Imperial College London, UK., Ferguson NM; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Dye C; Department of Zoology, University of Oxford, UK., Loman NJ; Institute for Microbiology and Infection, University of Birmingham, Birmingham, UK., Lemey P; Department of Microbiology, Immunology and Transplantation, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Rambaut A; Institute of Evolutionary Biology, University of Edinburgh, Edinburgh, UK., Fraiji NA; Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia, Manaus, Brazil.; Diretoria Clínica, Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil., Carvalho MDPSS; Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia, Manaus, Brazil.; Diretoria da Presidência, Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, Manaus, Brazil., Pybus OG; Department of Zoology, University of Oxford, UK.; Department of Pathobiology and Population Sciences, The Royal Veterinary College, London, UK., Flaxman S; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK., Bhatt S; Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, UK.; Section of Epidemiology, Department of Public Health, University of Copenhagen, Denmark., Sabino EC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.

Publikováno v: MedRxiv : the preprint server for health sciences [medRxiv] 2021 Mar 03. Date of Electronic Publication: 2021 Mar 03.

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