STAG2 loss-of-function affects short-range genomic contacts and modulates the basal-luminal transcriptional program of bladder cancer cells.

Autor: Richart L; Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), 28029 Madrid, Spain., Lapi E; Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), 28029 Madrid, Spain.; Center for Biomedical Research Network (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Pancaldi V; Barcelona Supercomputing Center (BSC), 08034 Barcelona, Spain.; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, ERL5294 CNRS, 31037 Toulouse, France.; University Paul Sabatier III, Toulouse, France., Cuenca-Ardura M; Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), 28029 Madrid, Spain., Pau EC; Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), 28029 Madrid, Spain., Madrid-Mencía M; Barcelona Supercomputing Center (BSC), 08034 Barcelona, Spain.; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, ERL5294 CNRS, 31037 Toulouse, France.; University Paul Sabatier III, Toulouse, France., Neyret-Kahn H; Institut Curie, PSL Research University, CNRS, UMR144, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, 75005 Paris, France.; Sorbonne Université, UPMC Université Paris 06, CNRS, UMR144, 75005 Paris, France., Radvanyi F; Institut Curie, PSL Research University, CNRS, UMR144, Equipe Labellisée Ligue Contre le Cancer, 75005 Paris, France.; Sorbonne Université, UPMC Université Paris 06, CNRS, UMR144, 75005 Paris, France., Rodríguez JA; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), 08028 Barcelona, Spain., Cuartero Y; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), 08028 Barcelona, Spain., Serra F; Barcelona Supercomputing Center (BSC), 08034 Barcelona, Spain., Le Dily F; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), 08028 Barcelona, Spain., Valencia A; Barcelona Supercomputing Center (BSC), 08034 Barcelona, Spain.; Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), 08010 Barcelona, Spain., Marti-Renom MA; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), 08028 Barcelona, Spain.; Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), 08010 Barcelona, Spain.; Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), 08003 Barcelona, Spain.; Departament de Ciències Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra (UPF), 08003 Barcelona, Spain., Real FX; Epithelial Carcinogenesis Group, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), 28029 Madrid, Spain.; Center for Biomedical Research Network (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain.; Departament de Ciències Experimentals i de la Salut, Universitat Pompeu Fabra (UPF), 08003 Barcelona, Spain.

Publikováno v: Nucleic acids research [Nucleic Acids Res] 2021 Nov 08; Vol. 49 (19), pp. 11005-11021.

Low Replicative Stress Triggers Cell-Type Specific Inheritable Advanced Replication Timing.

Autor: Courtot L; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France., Bournique E; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France., Maric C; Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, DNA Replication Pathologies Team, F-75006 Paris, France., Guitton-Sert L; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France., Madrid-Mencía M; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France., Pancaldi V; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Barcelona Supercomputing Center, 08034 Barcelona, Spain., Cadoret JC; Université de Paris, CNRS, Institut Jacques Monod, DNA Replication Pathologies Team, F-75006 Paris, France., Hoffmann JS; Laboratoire de pathologie, Laboratoire d'excellence Toulouse Cancer, Institut Universitaire du Cancer-Toulouse, Oncopole, 1 Avenue Irène-Joliot-Curie, CEDEX, 31059 Toulouse, France., Bergoglio V; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), UMR1037 Inserm, University Paul Sabatier III, ERL5294 CNRS, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.

Publikováno v: International journal of molecular sciences [Int J Mol Sci] 2021 May 07; Vol. 22 (9). Date of Electronic Publication: 2021 May 07.

Insights on TAM Formation from a Boolean Model of Macrophage Polarization Based on In Vitro Studies.

Autor: Marku M; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Verstraete N; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Raynal F; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Madrid-Mencía M; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Domagala M; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Fournié JJ; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Ysebaert L; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France.; Service d'Hématologie, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse-Oncopole, 31330 Toulouse, France., Poupot M; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France., Pancaldi V; INSERM, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, 2 Avenue Hubert Curien, 31037 Toulouse, France.; Université III Toulouse Paul Sabatier, Route de Narbonne, 31330 Toulouse, France.; Barcelona Supercomputing Center, Carrer de Jordi Girona, 29, 31, 08034 Barcelona, Spain.

Publikováno v: Cancers [Cancers (Basel)] 2020 Dec 07; Vol. 12 (12). Date of Electronic Publication: 2020 Dec 07.

Single-Cell Virtual Cytometer allows user-friendly and versatile analysis and visualization of multimodal single cell RNAseq datasets.

Autor: Pont F; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN., Tosolini M; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN., Gao Q; Biolegend, San Diego, CA 92121, USA., Perrier M; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN., Madrid-Mencía M; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN., Huang TS; Biolegend, San Diego, CA 92121, USA., Neuvial P; Institut de Mathématiques de Toulouse, UMR 5219, Université de Toulouse, CNRS, UPS, F-31062 Toulouse, France., Ayyoub M; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN., Nazor K; Biolegend, San Diego, CA 92121, USA., Fournié JJ; Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse, INSERM UMR1037, Toulouse, France; Université Toulouse III Paul-Sabatier, Toulouse, France; ERL 5294 CNRS, Toulouse, France, Institut Universitaire du Cancer-Oncopole de Toulouse, Toulouse, France, laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, TOUCAN.

Publikováno v: NAR genomics and bioinformatics [NAR Genom Bioinform] 2020 Apr 20; Vol. 2 (2), pp. lqaa025. Date of Electronic Publication: 2020 Apr 20 (Print Publication: 2020).

Exosomal cargos-mediated metabolic reprogramming in tumor microenvironment.

Autor: Tan, Shiming¹ (AUTHOR), Yang, Yiqing¹ (AUTHOR), Yang, Wenjuan¹ (AUTHOR), Han, Yaqian¹ (AUTHOR), Huang, Lisheng^1,2 (AUTHOR), Yang, Ruiqian^1,2 (AUTHOR), Hu, Zifan^1,2 (AUTHOR), Tao, Yi^1,2 (AUTHOR), Liu, Lin¹ (AUTHOR), Li, Yun¹ (AUTHOR), Oyang, Linda¹ (AUTHOR), Lin, Jinguan¹ (AUTHOR), Peng, Qiu¹ (AUTHOR), Jiang, Xianjie¹ (AUTHOR), Xu, Xuemeng¹ (AUTHOR), Xia, Longzheng¹ (AUTHOR), Peng, Mingjing¹ (AUTHOR), Wu, Nayiyuan¹ (AUTHOR), Tang, Yanyan¹ (AUTHOR), Cao, Deliang¹ (AUTHOR) 1814589590@qq.com

Publikováno v: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research (17569966). 3/11/2023, Vol. 42 Issue 1, p1-28. 28p.