Výsledky vyhledávání - "Long-branch attraction"

Akademický článek

Short branch attraction in phylogenomic inference under the multispecies coalescent

Autor: Liang Liu, Lili Yu, Shaoyuan Wu, Jonathan Arnold, Christopher Whalen, Charles Davis, Scott Edwards

Publikováno v: Frontiers in Ecology and Evolution, Vol 11 (2023)

Accurate reconstruction of species trees often relies on the quality of input gene trees estimated from molecular sequences. Previous studies suggested that if the sequence length is fixed, the maximum likelihood may produce biased gene trees which s

Externí odkaz: https://doaj.org/article/532ee409f71a42fbb1a4ef315300aba6

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

LSX: automated reduction of gene-specific lineage evolutionary rate heterogeneity for multi-gene phylogeny inference

Autor: Carlos J. Rivera-Rivera, Juan I. Montoya-Burgos

Publikováno v: BMC Bioinformatics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-4 (2019)

Abstract Background Lineage rate heterogeneity can be a major source of bias, especially in multi-gene phylogeny inference. We had previously tackled this issue by developing LS3, a data subselection algorithm that, by removing fast-evolving sequence

Externí odkaz: https://doaj.org/article/0d5543795f7047b8a191ac139157bee0

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Testing adequacy for DNA substitution models

Autor: Wei Chen, Toby Kenney, Joseph Bielawski, Hong Gu

Publikováno v: BMC Bioinformatics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-16 (2019)

Abstract Background Testing model adequacy is important before a DNA substitution model is chosen for phylogenetic inference. Using a mis-specified model can negatively impact phylogenetic inference, for example, the maximum likelihood method can be

Externí odkaz: https://doaj.org/article/7e0eed4ae36d4bcb91fe6e5d5c917120

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML