Time-series incubations in a coastal environment illuminates the importance of early colonizers and the complexity of bacterial biofilm dynamics on marine plastics

Autor: Lemonnier, C., Chalopin, M., Huvet, A., Le Roux, F., Labreuche, Y., Petton, B., Maignien, L., Paul-Pont, I., Reveillaud, J.

Publikováno v: In Environmental Pollution 1 November 2022 312

Cooperation and cheating orchestrate Vibrio assemblages and polymicrobial synergy in oysters infected with OsHV-1 virus.

Autor: Oyanedel D; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Lagorce A; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Bruto M; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané F-29280, France.; Sorbonne Université, Université Pierre et Marie Curie Paris 06, CNRS, UMR8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff F-29680, France., Haffner P; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Morot A; Université de Bretagne Occidentale, CNRS, Institut de recherche pour le développement (IRD), Ifremer, Laboratoire des sciences de l'environnement marin (LEMAR), Plouzané, F-29280, France.; Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines, Université Bretagne Sud, EMR CNRS 6076, Institut Universitaire Européen de la Mer, Lorient F-56100, France., Labreuche Y; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané F-29280, France.; Sorbonne Université, Université Pierre et Marie Curie Paris 06, CNRS, UMR8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff F-29680, France., Dorant Y; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., de La Forest Divonne S; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Delavat F; Nantes Université, CNRS, Unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies (US2B), UMR6286, Nantes, F-44000, France., Inguimbert N; Centre de Recherches Insulaires et OBservatoire de l'Environnement (CRIOBE), UAR3278, Ecole Pratique des Hautes Etudes (EPHE), Université de Perpignan Via Domitia, CNRS, Perpignan F-66860, France., Montagnani C; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Morga B; Ifremer, Adaptation Santé des invertébrés Marins (ASIM), La Tremblade F-17390, France., Toulza E; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Chaparro C; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Escoubas JM; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Gueguen Y; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France.; MARine Biodiversity, Exploitation and Conservation (MARBEC) Univ Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Sète F-34200, France., Vidal-Dupiol J; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., de Lorgeril J; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France.; Ifremer, IRD, Univ Nouvelle-Calédonie, Univ La Réunion, ENTROPIE, Nouméa, Nouvelle-Calédonie, F-98800, France., Petton B; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané F-29280, France.; Université de Bretagne Occidentale, CNRS, Institut de recherche pour le développement (IRD), Ifremer, Laboratoire des sciences de l'environnement marin (LEMAR), Plouzané, F-29280, France., Degremont L; Ifremer, Adaptation Santé des invertébrés Marins (ASIM), La Tremblade F-17390, France., Tourbiez D; Ifremer, Adaptation Santé des invertébrés Marins (ASIM), La Tremblade F-17390, France., Pimparé LL; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Leroy M; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Romatif O; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Pouzadoux J; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Mitta G; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France.; Ifremer, Université de Polynésie Française, IRD, Institut Louis Malardé (ILM), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (EIO), Vairao F-98719, Polynésie Française., Le Roux F; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané F-29280, France.; Sorbonne Université, Université Pierre et Marie Curie Paris 06, CNRS, UMR8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff F-29680, France., Charrière GM; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Travers MA; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France., Destoumieux-Garzón D; Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE), Université de Montpellier, CNRS, Ifremer, Université de Perpignan Via Domitia, Montpellier F-34090, France.

Publikováno v: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proc Natl Acad Sci U S A] 2023 Oct 03; Vol. 120 (40), pp. e2305195120. Date of Electronic Publication: 2023 Sep 26.

Selection of Vibrio crassostreae relies on a plasmid expressing a type 6 secretion system cytotoxic for host immune cells.

Autor: Piel D; Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ZI de la Pointe du Diable, CS 10070, Ifremer, F-29280, Plouzané, France.; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., Bruto M; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., James A; Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ZI de la Pointe du Diable, CS 10070, Ifremer, F-29280, Plouzané, France.; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., Labreuche Y; Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ZI de la Pointe du Diable, CS 10070, Ifremer, F-29280, Plouzané, France.; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., Lambert C; Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin, UMR 6539 CNRS UBO IRD IFREMER, Institut Universitaire Européen de la Mer, Technopôle Brest-Iroise - Rue Dumont d'Urville, F-29280, Plouzané, France., Janicot A; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., Chenivesse S; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France., Petton B; Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ZI de la Pointe du Diable, CS 10070, Ifremer, F-29280, Plouzané, France.; Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin, UMR 6539 CNRS UBO IRD IFREMER, Institut Universitaire Européen de la Mer, Technopôle Brest-Iroise - Rue Dumont d'Urville, F-29280, Plouzané, France., Wegner KM; AWI - Alfred Wegener Institut, Helmholtz-Zentrum für Polar und Meeresforschung, Coastal Ecology, Wadden Sea Station Sylt, 25992, Hafenstrasse 43, List, Germany., Stoudmann C; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, CH-1015, Lausanne, Switzerland., Blokesch M; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, CH-1015, Lausanne, Switzerland., Le Roux F; Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ZI de la Pointe du Diable, CS 10070, Ifremer, F-29280, Plouzané, France.; Sorbonne Universités, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, CS 90074, F-29688, Roscoff cedex, France.

Publikováno v: Environmental microbiology [Environ Microbiol] 2020 Oct; Vol. 22 (10), pp. 4198-4211. Date of Electronic Publication: 2019 Aug 26.

Phage-host coevolution in natural populations.

Autor: Piel D; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France.; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., Bruto M; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., Labreuche Y; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France.; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., Blanquart F; Centre for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB), Collège de France, CNRS, INSERM, PSL Research University, Paris, France.; Infection Antimicrobials Modelling Evolution, UMR 1137, INSERM, Université de Paris, Paris, France., Goudenège D; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France.; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., Barcia-Cruz R; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France.; Department of Microbiology and Parasitology, CIBUS-Faculty of Biology, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain., Chenivesse S; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., Le Panse S; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France., James A; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France., Dubert J; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France.; Department of Microbiology and Parasitology, CIBUS-Faculty of Biology, Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain.; Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA., Petton B; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France., Lieberman E; Eligo Bioscience, Paris, France., Wegner KM; AWI - Alfred Wegener Institut - Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung, Coastal Ecology, Waddensea Station Sylt, List, Germany., Hussain FA; Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA., Kauffman KM; Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA., Polz MF; Department of Civil and Environmental Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA.; Division of Microbial Ecology, Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Austria., Bikard D; Synthetic Biology Group, Department of Microbiology, Institut Pasteur, Paris, France., Gandon S; CEFE (UMR 5175 CNRS - Université de Montpellier - Université Paul Valéry - EPHE), Montpellier, France., Rocha EPC; Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3525, Microbial Evolutionary Genomics, Paris, France., Le Roux F; Ifremer, Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins, ZI de la Pointe du Diable, Plouzané, France. frederique.le-roux@sb-roscoff.fr.; Sorbonne Université, UPMC Paris 06, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique de Roscoff, Roscoff cedex, France. frederique.le-roux@sb-roscoff.fr.

Publikováno v: Nature microbiology [Nat Microbiol] 2022 Jul; Vol. 7 (7), pp. 1075-1086. Date of Electronic Publication: 2022 Jun 27.

Isolation, Characterization, and Unlocking the Potential of Mimir124 Phage for Personalized Treatment of Difficult, Multidrug-Resistant Uropathogenic E. coli Strain.

Autor: Golomidova, Alla¹ (AUTHOR) alla_golomidova@mail.ru, Kupriyanov, Yuriy² (AUTHOR) dr.kupriyanov@mail.ru, Gabdrakhmanov, Ruslan¹ (AUTHOR) rgabdrahmanov136@gmail.com, Gurkova, Marina³ (AUTHOR) mgurkova@micromir.bio, Kulikov, Eugene¹ (AUTHOR) eumenius@gmail.com, Belalov, Ilya¹ (AUTHOR) ilya.belalov@gmail.com, Uskevich, Viktoria³ (AUTHOR) v.yuskevich@micromir.bio, Bespiatykh, Dmitry⁴ (AUTHOR) d.bespiatykh@gmail.com, Letarova, Maria¹ (AUTHOR) sulfatreduction@gmail.com, Efimov, Alexander¹ (AUTHOR) efsasha@bk.ru, Kuznetsov, Alexander¹ (AUTHOR), Shitikov, Egor⁴ (AUTHOR) egorshtkv@gmail.com, Pushkar, Dmitry² (AUTHOR) pushkardm@mail.ru, Letarov, Andrey¹ (AUTHOR) letarov@inmi.ru, Zurabov, Fedor³ (AUTHOR) letarov@inmi.ru

Publikováno v: International Journal of Molecular Sciences. Dec2024, Vol. 25 Issue 23, p12755. 16p.