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Les ontologies ATOL et EOL, des outils en appui aux nouveaux challenges en production porcine: Phénotypage et élevage de précision
Autor: Marie-Christine Meunier-Salaün, Jérôme Bugeon, Olivier Dameron, Alice Fatet, Isabelle Hue, Catherine Hurtaud, Léa Joret, Claire Nédellec, Matthieu Reichstadt, Jean Vernet, Pierre-Yves Le Bail
Publikováno v: 46èmes Journées de la Recherche Porcine
46. Journées de la Recherche Porcine
46. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2014, Paris, France. pp.281-285
46. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2014, Paris, France. IFIP-Institut du Porc, 46, pp.281-285, 2014, Journées de la Recherche Porcine
Journées de la Recherche Porcine en France
HAL
La vocation des ontologies est de faciliter l'organisation et l'exploitation des connaissances et des données produites en grande quantité notamment en biologie. L'ontologie ATOL (http://www.atol-ontology.com) pour "Animal Trait Ontology for Livest
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::0d764a9fcef39122c612f75c16183046
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01019239
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2
Un langage de référence pour le phénotypage des animaux d’élevage : l’ontologie ATOL
Autor: Wiktoria Golik, Jérôme Bugeon, Jean Vernet, Catherine Jondreville, Isabelle Hue, Philippe Chemineau, Claire Nédellec, Jean-François Hocquette, Léa Joret, Catherine Hurtaud, Marie-Christine Meunier-Salaün, Olivier Dameron, Pierre-Yves Le Bail, Alice Fatet, Matthieu Reichstadt
Publikováno v: INRA Productions Animales
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.195-208. ⟨10.20870/productions-animales.2014.27.3.3067⟩
Productions animales
Productions animales, Institut National de la Recherche Agronomique, 2014, 27 (3), pp.195-208
HAL
INRA Productions Animales 3 (27), 195-208. (2014)
Les avancées technologiques récentes en biologie permettent la production de grandes quantités de données capables de décrire de plus en plus finement les phénotypes. Pour traiter en masse ces informations à l’aide de programmes informatique
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::64361b05276d903b887404f89da80801
https://hal.science/hal-01129862/file/2014_YLeBail_INRAProdAnim_1.pdf
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3
ATOL and EOL ontologies, steps towards embryonic phenotypes shared worldwide?
Autor: Jean Vernet, Claire Nédellec, Isabelle Hue, Catherine Hurtaud, Alice Fatet, Léa Joret, Matthieu Reichstadt, P.-Y. Le Bail, Jérôme Bugeon, Marie-Christine Meunier-Salaün, Olivier Dameron
Publikováno v: Animal Reproduction Science
Fourth Mammalian Embryo Genomics Meeting
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, Oct 2013, Hilton Quebec City, Canada. 102 p., ⟨10.1016/j.anireprosci.2014.06.013⟩
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, Université Laval. CAN., Oct 2013, Hilton Quebec City, Canada. 102 p., ⟨10.1016/j.anireprosci.2014.06.013⟩
Fourth Mammalian Embryo Genomics Meeting. (149 (1-2))2014; 4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, Hilton Quebec City, CAN, 2013-10-09-2013-10-11, 99-99
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, Oct 2013, Hilton Quebec City, Canada. Elsevier, 149, 102 p., 2014, Animal Reproduction Science. 〈10.1016/j.anireprosci.2014.06.013〉
Special Issue: SISpecial Issue: SI; The development and the use of ontologies contribute to a better organization and use of the huge amount of knowledge available in biology, but could even contribute better when used worldwide to share common bases
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::615b8bf487a00fb4be0e52fe3b044a55
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01205091
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4
EOL: a new ontology for livestock system and rearing conditions
Autor: Léa Joret, Jérôme Bugeon, Joel Aubin, Blancheton, J. P., Melynda Hassouna, Catherine Hurtaud, Sadasivam Kaushik, Francoise Medale, Marie-Christine Meunier-Salaün, Jean Vernet, Aurélie Wilfart, Jean-Yves Dourmad, Pierre-Yves Le Bail
Publikováno v: Annual Meeting of the European Association for Animal Production
64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP)
64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. 660 p
HAL
National audience
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::e10d67eb49e78e8d961be5b19cdba6bf
https://hal.inrae.fr/hal-02745982
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5
Etat d'avancement d'ATOL et notion de robustesse
Autor: Pierre-Yves Le Bail, Léa Joret, Olivier Dameron, Alice Fatet, Catherine Hurtaud, Isabelle Hue, Marie-Christine Salaun, Claire Nédellec, Matthieu Reichstadt, Jean Vernet
Publikováno v: Transversalité du groupe "Domestication" INRA-IFREMER
Transversalité du groupe "Domestication" INRA-IFREMER, Jun 2013, Paris, France
Transversalité du groupe "Domestication" INRA-IFREMER, Jun 2013, Paris, France. 2013
HAL
absent
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::6f2695a1329e78ebaaf99ceea8d32b24
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01210757
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6
ATOL: The Multi-species Livestock Trait Ontology
Autor: Olivier Dameron, Matthieu Reichstadt, Wiktoria Golik, Jean Vernet, Léa Joret, Claire Nédellec, Pierre-Yves Le Bail, Catherine Hurtaud, Jérôme Bugeon, Alice Fatet, Isabelle Hue, Frédéric Papazian, Marie-Christine Salaun
Publikováno v: Communications in Computer and Information Science
Metadata and Semantics Research
6. Research Conference, MTSR
6. Research Conference, MTSR, Nov 2012, Cadiz, Spain. pp.289-300, ⟨10.1007/978-3-642-35233-1_28⟩
Communications in Computer and Information Science ISBN: 9783642352324
MTSR
6. Research Conference, MTSR, Nov 2012, Cadiz, Spain. Springer, 2012, pp.289-300, 2012, Communications in Computer and Information Science. 〈10.1007/978-3-642-35233-1_28〉
Metadata and Semantics Research. (2012)2012; 6. Research Conference, MTSR, Cadiz, ESP, 2012-11-28-2012-11-30, 289-300
It resulted in a detailed taxonomy of 1,654 traits that is available at http://www.atol-ontology.comIt resulted in a detailed taxonomy of 1,654 traits that is available at http://www.atol-ontology.com; This paper presents the multi-species Animal Tra
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::2d092d83638de4bbad84619a39d6f8ce
https://hal.science/hal-01191279/file/golik_1.pdf
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7
Atol: Animal Trait Ontology for Livestock. Atol: Où en sommes-nous ?
Autor: Pierre-Yves Le Bail, Jérôme Bugeon, Olivier Dameron, Alice Fatet, Catherine Hurtaud, Isabelle Hue, Léa Joret, Marie-Christine Salaun, Claire Nédellec, Matthieu Reichstadt, Jean Vernet
Publikováno v: 4. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2012)
4. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2012), Jan 2012, Rennes, France. 30 diapositives, 2012
4. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2012), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Jan 2012, Rennes, France. 30 diapositives
4. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2012), Jan 2012, Rennes, France. 30 diapositives
HAL
Présentation exposée en PPTPrésentation exposée en PPT; absent
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::3361842dabd63215965e09d91cdc0f4b
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01210637
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8
ATOL : une ontologie pour le phénotypage des animaux d'élevage
Autor: Jean Vernet, Jérôme Bugeon, Olivier Dameron, Alice Fatet, Isabelle Hue, Catherine Hurtaud, Léa Joret, Marie-Christine Salaun, Park, C., Matthieu Reichstadt, James Reecy, Pierre-Yves Le Bail
Publikováno v: Colloque international "La génomique bovine. Contribution de la génomique à l'avenir de l'élevage bovin"
Colloque international "La génomique bovine. Contribution de la génomique à l'avenir de l'élevage bovin", Oct 2011, Clermont-Ferrand, France
HAL
Atol [Animal Trait Ontology for Livestock]Atol [Animal Trait Ontology for Livestock]; absent
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::9a06f8b93c27b6f361cee04cd8d48439
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01019432
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ATOL: une ontologie pour le phénotypage des animaux d'élevage
Autor: Jean Vernet, Jérôme Bugeon, Olivier Dameron, Alice Fatet, Isabelle Hue, Catherine Hurtaud, Léa Joret, Marie-Christine Meunier-Salaün, Park, C. A., Didier Micol, Matthieu Reichstadt, Reecy, J., Pierre-Yves Le Bail
Publikováno v: Comptes Rendus de l'Académie d'Agriculture de France
Les Colloques de l'Académie d'Agriculture de France
Les Colloques de l'Académie d'Agriculture de France, Nov 2010, Paris, France. 75 p
HAL
International audience
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::bd724415f69a2a97235ff99fc260f0d4
https://hal.inrae.fr/hal-02750374
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