Zobrazeno 1 - 10
of 93
pro vyhledávání: '"Koukos, Panagiotis"'
Autor:
Honorato, Rodrigo Vargas, Koukos, Panagiotis I., Jiménez-García, Brian, Tsaregorodtsev, Andrei, Verlato, Marco, Giachetti, Andrea, Rosato, Antonio, Bonvin, Alexandre M. J. J.
Structural biology aims at characterizing the structural and dynamic properties of biological macromolecules at atomic details. Gaining insight into three dimensional structures of biomolecules and their interactions is critical for understanding the
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2107.01056
Autor:
Basciu, Andrea, Koukos, Panagiotis I., Malloci, Giuliano, Bonvin, Alexandre M. J. J., Vargiu, Attilio V.
Publikováno v:
Journal of Computer-Aided Molecular Design 34, 149-162 (2020)
We report the performance of our newly introduced Ensemble Docking with Enhanced sampling of pocket Shape (EDES) protocol coupled to a template-based algorithm to generate near-native ligand conformations in the 2019 iteration of the Grand Challenge
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2005.04142
Autor:
Matos-Filipe, Pedro, Preto, António J., Koukos, Panagiotis I., Mourão, Joana, Bonvin, Alexandre M. J. J., Moreira, Irina S.
Membrane Proteins (MPs) account for around 15-39% of the human proteome and assume a critical role in a vast set of cellular and physiological mechanisms, including molecular transport, nutrient uptake, toxin and waste product clearance, respiration,
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1902.02321
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
We describe a robust, fast, and memory-efficient procedure that can cluster millions of structures derived from molecular dynamics simulations. The essence of the method is based on a peak-picking algorithm applied to three- and five-dimensional dist
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1512.04024
Quantifying convergence and sufficient sampling of macromolecular molecular dynamics simulations is more often than not a source of controversy (and of various ad hoc solutions) in the field. Clearly, the only reasonable, consistent and satisfying wa
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1309.1108
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
This is a collection of scripts useful for pre- and post-processing and analysis for HADDOCK runs.
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::56a0c4c4573039d53173be47a39ec81d