Challenging modeling strategies for LES of non-adiabatic turbulent stratified combustion

Autor: Fiorina, B., Mercier, R., Kuenne, G., Ketelheun, A., Avdić, A., Janicka, J., Geyer, D., Dreizler, A., Alenius, E., Duwig, C., Trisjono, P., Kleinheinz, K., Kang, S., Pitsch, H., Proch, F., Cavallo Marincola, F., Kempf, A.

Publikováno v: In Combustion and Flame November 2015 162(11):4264-4282

Author Correction: Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Autor: Bailey M. H., Meyerson W. U., Dursi L. J., Wang L. -B., Dong G., Liang W. -W., Weerasinghe A., Li S., Li Y., Kelso S., Akbani R., Anur P., Buchanan A., Chiotti K., Covington K., Creason A., Ding L., Ellrott K., Fan Y., Foltz S., Getz G., Hale W., Haussler D., Hess J. M., Hutter C. M., Kandoth C., Kasaian K., Kasapi M., Larson D., Leshchiner I., Letaw J., Ma S., McLellan M. D., Men Y., Mills G. B., Niu B., Peto M., Radenbaugh A., Reynolds S. M., Saksena G., Sofia H., Stewart C., Struck A. J., Stuart J. M., Wang W., Weinstein J. N., Wheeler D. A., Wong C. K., Xi L., Ye K., Bieg M., Boutros P. C., Buchhalter I., Butler A. P., Chen K., Chong Z., Drechsel O., Jonathan Dursi L., Eils R., Espiritu S. M. G., Fulton R. S., Gao S., Gelpi J. L., Gerstein M. B., Gonzalez S., Gut I. G., Hach F., Heinold M. C., Hinton J., Hu T., Huang V., Huang Y., Hutter B., Jones D. R., Jung J., Jager N., Kim H. -L., Kleinheinz K., Kumar S., Kumar Y., Lalansingh C. M., Letunic I., Livitz D., Ma E. Z., Maruvka Y. E., Mashl R. J., Menzies A., Milovanovic A., Nielsen M. M., Ossowski S., Paramasivam N., Pedersen J. S., Perry M. D., Puiggros M., Raine K. M., Rheinbay E., Royo R., Sahinalp S. C., Sarrafi I., Schlesner M., Simpson J. T., Stebbings L., Stobbe M. D., Teague J. W., Tiao G., Torrents D., Wala J. A., Wang J., Waszak S. M., Weischenfeldt J., Wendl M. C., Werner J., Wu Z., Xue H., Yakneen S., Yamaguchi T. N., Yellapantula V. D., Yung C. K., Zhang J., Aaltonen L. A., Abascal F., Abeshouse A., Aburatani H., Adams D. J., Agrawal N., Ahn K. S., Ahn S. -M., Aikata H., Akdemir K. C., Al-Ahmadie H., Al-Sedairy S. T., Al-Shahrour F., Alawi M., Albert M., Aldape K., Alexandrov L. B., Ally A., Alsop K., Alvarez E. G., Amary F., Amin S. B., Aminou B., Ammerpohl O., Anderson M. J., Ang Y., Antonello D., Aparicio S., Appelbaum E. L., Arai Y., Aretz A., Arihiro K., Ariizumi S. -I., Armenia J., Arnould L., Asa S., Assenov Y., Atwal G., Aukema S., Auman J. T., Aure M. 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Publikováno v: Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-1 (2020)
Nature communications, vol 11, iss 1

Weitere Nicht-UDE-Autoren sind nicht genannt. Originalpublikation: 10.1038/s41467-020-18151-y. CA extern The original version of this Article omitted from the author list the 9th author Yize Li, who is from the ‘The McDonnell Genome Institute at Wa

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/33257764

Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig

Autor: Rubanova, Y., Shi, R., Harrigan, C.F., Li, R., Wintersinger, J., Sahin, N., Deshwar, A.G., Dentro, S.C., Leshchiner, I., Gerstung, M., Jolly, C., Haase, K., Tarabichi, M., Yu, K., Gonzalez, S., Macintyre, G., Adams, D.J., Anur, P., Beroukhim, R., Boutros, P.C., Bowtell, D.D., Campbell, P.J., Cao, S., Christie, E.L., Cmero, M., Cun, Y., Dawson, K.J., Demeulemeester, J., Donmez, N., Drews, R.M., Eils, R., Fan, Y., Fittall, M., Garsed, D.W., Getz, G., Ha, G., Imielinski, M., Jerman, L., Ji, Y., Kleinheinz, K., Lee, J., Lee-Six, H., Livitz, D.G., Malikic, S., Markowetz, F., Martincorena, I., Mitchell, T.J., Mustonen, V., Oesper, L., Peifer, M., Peto, M., Raphael, B.J., Rosebrock, D., Sahinalp, S.C., Salcedo, A., Schlesner, M., Schumacher, S., Sengupta, Subhajit, Shin, S.J., Spiro, O., Stein, L.D., Vázquez-García, I., Vembu, S., Wheeler, D.A., Yang, T.-P., Yao, X., Yuan, K., Zhu, H., Wang, W., Morris, Q., Spellman, P.T., Wedge, D.C., Van Loo, P.

Publikováno v: Nature Communications
Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-12 (2020)
Rubanova, Y, Shi, R, Harrigan, C F, Li, R, Wintersinger, J, Sahin, N, Deshwar, A G, Dentro, S C, Leshchiner, I, Gerstung, M, Jolly, C, Haase, K, Tarabichi, M, Wintersinger, J, Deshwar, A G, Yu, K, Gonzalez, S, Rubanova, Y, Macintyre, G, Adams, D J, Anur, P, Beroukhim, R, Boutros, P C, Bowtell, D D, Campbell, P J, Cao, S, Christie, E L, Cmero, M, Cun, Y, Dawson, K J, Demeulemeester, J, Donmez, N, Drews, R M, Eils, R, Fan, Y, Fittall, M, Garsed, D W, Getz, G, Ha, G, Imielinski, M, Jerman, L, Ji, Y, Kleinheinz, K, Lee, J, Lee-Six, H, Livitz, D G, Malikic, S, Markowetz, F, Martincorena, I, Mitchell, T J, Mustonen, V, Oesper, L, Peifer, M, Peto, M, Raphael, B J, Rosebrock, D, Sahinalp, S C, Salcedo, A, Schlesner, M, Schumacher, S, Sengupta, S, Shi, R, Shin, S J, Spiro, O, Stein, L D, Vázquez-García, I, Vembu, S, Wheeler, D A, Yang, T-P, Yao, X, Yuan, K, Zhu, H, Wang, W, Morris, Q, Spellman, P T, Wedge, D C, Van Loo, P & Morris, Q 2020, ' Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig ', Nature Communications, vol. 11, no. 1 . https://doi.org/10.1038/s41467-020-14352-7
Nature communications, vol 11, iss 1
Nature Communications, 11, 1
Nature Communications, 11

The type and genomic context of cancer mutations depend on their causes. These causes have been characterized using signatures that represent mutation types that co-occur in the same tumours. However, it remains unclear how mutation processes change

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