Zobrazeno 1 - 10
of 29
pro vyhledávání: '"Klarner, Hannes"'
The attractors of Boolean networks and their basins have been shown to be highly relevant for model validation and predictive modelling, e.g., in systems biology. Yet there are currently very few tools available that are able to compute and visualise
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1807.10103
Asymptotic behaviors are often of particular interest when analyzing Boolean networks that represent biological systems such as signal trans- duction or gene regulatory networks. Methods based on a generalization of the steady state notion, the so-ca
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1509.07731
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 6
Cell classifier circuits are synthetic biological circuits capable of distinguishing between different cell states depending on specific cellular markers and engendering a state-specific response. An example are classifiers for cancer cells that reco
Autor:
Klarner, Hannes
This thesis addresses three challenges in modeling regulatory and signal transduction networks. Starting point is the generalized logical formalism as introduced by R. Thomas and further developed by D. Thieffry, E. H. Snoussi and M. Kaufman. We intr
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4732::8702f4be399ea20055fd5ab32217331c
https://doi.org/10.17169/refubium-13160
https://doi.org/10.17169/refubium-13160
Autor:
Klarner, Hannes, Siebert, Heike
Publikováno v:
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol 3 (2015)
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
This paper introduces the notion of approximating asynchronous attractors of Boolean networks by minimal trap spaces. We define three criteria for determining the quality of an approximation: “faithfulness” which requires that the oscillating var
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=pmid_dedup__::2870a783cf51cab94a6457ac442191c2
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/15535
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/15535
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Cellular Automata: 11th International Conference on Cellular Automata for Research & Industry, ACRI 2014, Krakow, Poland, September 22-25, 2014. Proceedings; 2014, p561-570, 10p
Publikováno v:
Computational Methods in Systems Biology: 12th International Conference, CMSB 2014, Manchester, UK, November 17-19, 2014, Proceedings; 2014, p32-44, 13p
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.