Zobrazeno 1 - 10
of 76
pro vyhledávání: '"Kerpedjiev P"'
Autor:
Sarah B. Reiff, Andrew J. Schroeder, Koray Kırlı, Andrea Cosolo, Clara Bakker, Soohyun Lee, Alexander D. Veit, Alexander K. Balashov, Carl Vitzthum, William Ronchetti, Kent M. Pitman, Jeremy Johnson, Shannon R. Ehmsen, Peter Kerpedjiev, Nezar Abdennur, Maxim Imakaev, Serkan Utku Öztürk, Uğur Çamoğlu, Leonid A. Mirny, Nils Gehlenborg, Burak H. Alver, Peter J. Park
Publikováno v:
Nature Communications, Vol 13, Iss 1, Pp 1-11 (2022)
This paper describes the ‘4DN Data Portal’ that hosts data generated by the 4D Nucleome network, including Hi-C and other chromatin conformation capture assays, as well as various sequencing-based and imaging-based assays. Raw data have been unif
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/d368866915264a939fd27bae89ea035d
Autor:
Hecker, Nikolai, Kahlscheuer, Matthew L., Kerpedjiev, Peter, Stadler, Peter F., Gorodkin, Jan, Hofacker, Ivo L., Walter, Nils G., Qin, Jing
Recent genome and transcriptome sequencing projects have unveiled a plethora of highly structured RNA molecules as central mediators of cellular function. Single molecule Forster Resonance Energy Transfer (smFRET) is a powerful tool for analyzing the
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1610.00340
Autor:
Su Wang, Soohyun Lee, Chong Chu, Dhawal Jain, Peter Kerpedjiev, Geoffrey M. Nelson, Jennifer M. Walsh, Burak H. Alver, Peter J. Park
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 21, Iss 1, Pp 1-15 (2020)
Abstract The three-dimensional conformation of a genome can be profiled using Hi-C, a technique that combines chromatin conformation capture with high-throughput sequencing. However, structural variations often yield features that can be mistaken for
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/d548886af16841be8db011de393a0821
Autor:
Sarah B. Reiff, Andrew J. Schroeder, Koray Kırlı, Andrea Cosolo, Clara Bakker, Luisa Mercado, Soohyun Lee, Alexander D. Veit, Alexander K. Balashov, Carl Vitzthum, William Ronchetti, Kent M. Pitman, Jeremy Johnson, Shannon R. Ehmsen, Peter Kerpedjiev, Nezar Abdennur, Maxim Imakaev, Serkan Utku Öztürk, Uğur Çamoğlu, Leonid A. Mirny, Nils Gehlenborg, Burak H. Alver, Peter J. Park
Publikováno v:
Nature Communications, Vol 13, Iss 1, Pp 1-1 (2022)
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/eff094491fc2443ea9b24418b9319a77
Autor:
Peter Kerpedjiev, Nezar Abdennur, Fritz Lekschas, Chuck McCallum, Kasper Dinkla, Hendrik Strobelt, Jacob M. Luber, Scott B. Ouellette, Alaleh Azhir, Nikhil Kumar, Jeewon Hwang, Soohyun Lee, Burak H. Alver, Hanspeter Pfister, Leonid A. Mirny, Peter J. Park, Nils Gehlenborg
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-12 (2018)
Abstract We present HiGlass, an open source visualization tool built on web technologies that provides a rich interface for rapid, multiplex, and multiscale navigation of 2D genomic maps alongside 1D genomic tracks, allowing users to combine various
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/2c92e43c941a4abc808b8f0ebf34e423
Publikováno v:
F1000Research, Vol 8 (2019)
We present forgi, a Python library to analyze the tertiary structure of RNA secondary structure elements. Our representation of an RNA molecule is centered on secondary structure elements (stems, bulges and loops). By fitting a cylinder to the helix
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/8f825b7954274b878b5bfa5bbcb19a17
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.