Výsledky vyhledávání

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Cross-species protein sequence and gene structure prediction with fine-tuned Webscipio 2.0 and Scipio

Autor: Waack Stephan, Pillmann Holger, Hammesfahr Björn, Keller Oliver, Hatje Klas, Kollmar Martin

Publikováno v: BMC Research Notes, Vol 4, Iss 1, p 265 (2011)

Abstract Background Obtaining transcripts of homologs of closely related organisms and retrieving the reconstructed exon-intron patterns of the genes is a very important process during the analysis of the evolution of a protein family and the compara

Externí odkaz: https://doaj.org/article/f8e6a58fbc314ccaa96f5ad3d4cf0bf5

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

WebScipio: An online tool for the determination of gene structures using protein sequences

Autor: Waack Stephan, Keller Oliver, Pillmann Holger, Odronitz Florian, Kollmar Martin

Publikováno v: BMC Genomics, Vol 9, Iss 1, p 422 (2008)

Abstract Background Obtaining the gene structure for a given protein encoding gene is an important step in many analyses. A software suited for this task should be readily accessible, accurate, easy to handle and should provide the user with a cohere

Externí odkaz: https://doaj.org/article/2469e6c846d54a9395dcf67bb3364830

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

Scipio: Using protein sequences to determine the precise exon/intron structures of genes and their orthologs in closely related species

Autor: Kollmar Martin, Stanke Mario, Odronitz Florian, Keller Oliver, Waack Stephan

Publikováno v: BMC Bioinformatics, Vol 9, Iss 1, p 278 (2008)

Abstract Background For many types of analyses, data about gene structure and locations of non-coding regions of genes are required. Although a vast amount of genomic sequence data is available, precise annotation of genes is lacking behind. Finding

Externí odkaz: https://doaj.org/article/6c3156355f9644deb25f278eb1125fec

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

Score-based prediction of genomic islands in prokaryotic genomes using hidden Markov models

Autor: Surovcik Katharina, Fricke Wolfgang, Damm Carsten, Brodag Thomas, Asper Roman, Keller Oliver, Waack Stephan, Meinicke Peter, Merkl Rainer

Publikováno v: BMC Bioinformatics, Vol 7, Iss 1, p 142 (2006)

Abstract Background Horizontal gene transfer (HGT) is considered a strong evolutionary force shaping the content of microbial genomes in a substantial manner. It is the difference in speed enabling the rapid adaptation to changing environmental deman

Externí odkaz: https://doaj.org/article/b11f10e3e00146bebcf4addc26f7deca

Zobrazit plný text záznamu