Zobrazeno 1 - 10
of 153
pro vyhledávání: '"Kührová P"'
Autor:
Márkó Grabarics, Benjamín Mallada, Shayan Edalatmanesh, Alejandro Jiménez-Martín, Martin Pykal, Martin Ondráček, Petra Kührová, Weston B. Struwe, Pavel Banáš, Stephan Rauschenbach, Pavel Jelínek, Bruno de la Torre
Publikováno v:
Nature Communications, Vol 15, Iss 1, Pp 1-7 (2024)
Abstract Glycans, consisting of covalently linked sugar units, are a major class of biopolymers essential to all known living organisms. To better understand their biological functions and further applications in fields from biomedicine to materials
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/c78a95b1951d4b4bb0485e7c1bae5f49
Autor:
Fröhlking, Thorben, Mlýnský, Vojtěch, Janeček, Michal, Kührová, Petra, Krepl, Miroslav, Banáš, Pavel, Šponer, Jiří, Bussi, Giovanni
Publikováno v:
J. Chem. Theory Comput. 2022, 18, 7, 4490-4502
The capability of current force fields to reproduce RNA structural dynamics is limited. Several methods have been developed to take advantage of experimental data in order to enforce agreement with experiments. We herein extend an existing framework,
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2201.04078
Autor:
Šponer, Jiří, Bussi, Giovanni, Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Islam, Barira, Haider, Shozeb, Neidle, Stephen, Otyepka, Michal
Publikováno v:
BBA-Gen. Subjects 1861, 1246 (2017)
Background: Guanine quadruplexes (GQs) play vital roles in many cellular processes and are of much interest as drug targets. In contrast to the availability of many structural studies, there is still limited knowledge on GQ folding. Scope of review:
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1612.05882
Autor:
Kührová, Petra, Best, Robert B., Bottaro, Sandro, Bussi, Giovanni, Šponer, Jiří, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel
Publikováno v:
J. Chem. Theory Comput. 2016, 12 (9), pp 4534-4548
The computer-aided folding of biomolecules, particularly RNAs, is one of the most difficult challenges in computational structural biology. RNA tetraloops are fundamental RNA motifs playing key roles in RNA folding and RNA-RNA and RNA-protein interac
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1609.08276
Autor:
Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Koča, Jaroslav, Bussi, Giovanni, Trantírek, Lukáš, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří
Publikováno v:
Nucleic Acids Res. 43, 9626 (2015)
DNA G-hairpins are potential key structures participating in folding of human telomeric guanine quadruplexes (GQ). We examined their properties by standard MD simulations starting from the folded state and long T-REMD starting from the unfolded state
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1509.06511
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Krishna C. Suddala, Ian R. Price, Shiba S. Dandpat, Michal Janeček, Petra Kührová, Jiří Šponer, Pavel Banáš, Ailong Ke, Nils G. Walter
Publikováno v:
Nature Communications, Vol 10, Iss 1, Pp 1-16 (2019)
Riboswitches bind intracellular metabolites and control bacterial gene expression. Here, by using X-ray crystallography, molecular dynamics simulations, and single-molecule fluorescence resonance energy transfer, the authors show how a local Mn2+ ion
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/a105e074773f48059aba90c0f77a1c51
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.