Zobrazeno 1 - 10
of 106
pro vyhledávání: '"Kührová, Petra"'
Autor:
Fröhlking, Thorben, Mlýnský, Vojtěch, Janeček, Michal, Kührová, Petra, Krepl, Miroslav, Banáš, Pavel, Šponer, Jiří, Bussi, Giovanni
Publikováno v:
J. Chem. Theory Comput. 2022, 18, 7, 4490-4502
The capability of current force fields to reproduce RNA structural dynamics is limited. Several methods have been developed to take advantage of experimental data in order to enforce agreement with experiments. We herein extend an existing framework,
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2201.04078
Autor:
Grabarics, Márkó, Mallada, Benjamín, Edalatmanesh, Shayan, Jiménez-Martín, Alejandro, Pykal, Martin, Ondráček, Martin, Kührová, Petra, Struwe, Weston B., Banáš, Pavel, Rauschenbach, Stephan, Jelínek, Pavel, de la Torre, Bruno
Publikováno v:
Nature Communications; 11/2/2024, Vol. 15 Issue 1, p1-7, 7p
Autor:
Šponer, Jiří, Bussi, Giovanni, Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Islam, Barira, Haider, Shozeb, Neidle, Stephen, Otyepka, Michal
Publikováno v:
BBA-Gen. Subjects 1861, 1246 (2017)
Background: Guanine quadruplexes (GQs) play vital roles in many cellular processes and are of much interest as drug targets. In contrast to the availability of many structural studies, there is still limited knowledge on GQ folding. Scope of review:
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1612.05882
Autor:
Kührová, Petra, Best, Robert B., Bottaro, Sandro, Bussi, Giovanni, Šponer, Jiří, Otyepka, Michal, Banáš, Pavel
Publikováno v:
J. Chem. Theory Comput. 2016, 12 (9), pp 4534-4548
The computer-aided folding of biomolecules, particularly RNAs, is one of the most difficult challenges in computational structural biology. RNA tetraloops are fundamental RNA motifs playing key roles in RNA folding and RNA-RNA and RNA-protein interac
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1609.08276
Autor:
Stadlbauer, Petr, Kührová, Petra, Banáš, Pavel, Koča, Jaroslav, Bussi, Giovanni, Trantírek, Lukáš, Otyepka, Michal, Šponer, Jiří
Publikováno v:
Nucleic Acids Res. 43, 9626 (2015)
DNA G-hairpins are potential key structures participating in folding of human telomeric guanine quadruplexes (GQ). We examined their properties by standard MD simulations starting from the folded state and long T-REMD starting from the unfolded state
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1509.06511
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Flauzino, José M. R., Nalepa, Martin‐Alex, Chronopoulos, Demetrios D., Šedajová, Veronika, Panáček, David, Jakubec, Petr, Kührová, Petra, Pykal, Martin, Banáš, Pavel, Panáček, Aleš, Bakandritsos, Aristides, Otyepka, Michal
Publikováno v:
Small; 12/20/2023, Vol. 19 Issue 51, p1-10, 10p
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.