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Museomics illuminate the history of an extinct, paleoendemic plant lineage (Hesperelaea, Oleaceae) known from an 1875 collection from Guadalupe Island, Mexico
Autor: Zedane, L, Hong-Wa, C, Murienne, J, Jeziorski, C, Baldwin, BG, Besnard, G
Publikováno v: Biological Journal of the Linnean Society
Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2016, 117 (1), pp.44-57. ⟨10.1111/bij.12509⟩
Zedane, L; Hong-Wa, C; Murienne, J; Jeziorski, C; Baldwin, BG; & Besnard, G. (2016). Museomics illuminate the history of an extinct, paleoendemic plant lineage (Hesperelaea, Oleaceae) known from an 1875 collection from Guadalupe Island, Mexico. Biological Journal of the Linnean Society, 117(1), 44-57. doi: 10.1111/bij.12509. UC Berkeley: Retrieved from: http://www.escholarship.org/uc/item/1615g4rh
Biological Journal of the Linnean Society, 2016, 117 (1), pp.44-57. ⟨10.1111/bij.12509⟩
Biological Journal of the Linnean Society, vol 117, iss 1
© 2015 The Linnean Society of London. Museum collections are essential for understanding biodiversity and next-generation sequencing methods (NGS) offer new opportunities to generate genomic data on specimens of extinct species for phylogenetic and
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Meta-omics Provides Insights into the Impact of Hydrocarbon Contamination on Microbial Mat Functioning.
Autor: Aubé J; Environmental Microbiology, Universite de Pau et des Pays de l'Adour, E2S UPPA, CNRS, IPREM, Pau, France.; Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, UMR6197, IFREMER, CNRS, Université de Bretagne Occidentale, Plouzané, France., Senin P; Environmental Microbiology, Universite de Pau et des Pays de l'Adour, E2S UPPA, CNRS, IPREM, Pau, France.; Plateforme Bioinformatique Genotoul, UR875 Biométrie et Intelligence Artificielle, INRA, Castanet-Tolosan, France., Bonin P; Mediterranean Institute of Oceanography (MIO), Aix Marseille University, Université de Toulon, CNRS/INSU/IRD, UM 110, Marseille, France., Pringault O; UMR 9190 MARBEC IRD-Ifremer-CNRS, Université de Montpellier, Place Eugène Bataillon, Montpellier, France., Jeziorski C; GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville, Castanet-Tolosan, France., Bouchez O; GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville, Castanet-Tolosan, France., Klopp C; Plateforme Bioinformatique Genotoul, UR875 Biométrie et Intelligence Artificielle, INRA, Castanet-Tolosan, France., Guyoneaud R; Environmental Microbiology, Universite de Pau et des Pays de l'Adour, E2S UPPA, CNRS, IPREM, Pau, France., Goñi-Urriza M; Environmental Microbiology, Universite de Pau et des Pays de l'Adour, E2S UPPA, CNRS, IPREM, Pau, France. marisol.goni@univ-pau.fr.
Publikováno v: Microbial ecology [Microb Ecol] 2020 Aug; Vol. 80 (2), pp. 286-295. Date of Electronic Publication: 2020 Feb 19.
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Cytoplasmic genomes of Jasminum sambac reveal divergent sub-mitogenomic conformations and a large nuclear chloroplast-derived insertion.
Autor: Fang, Jingping1,2 (AUTHOR) jinphia@fjnu.edu.cn, Lin, Aiting3 (AUTHOR), Yan, Hansong3 (AUTHOR), Feng, Liqing1,4 (AUTHOR), Lin, Shaoqing1 (AUTHOR), Mason, Patrick2 (AUTHOR), Zhou, Linwei1 (AUTHOR), Xu, Xiuming3 (AUTHOR), Zhao, Kai1 (AUTHOR), Huang, Yongji4 (AUTHOR) scolandry@foxmail.com, Henry, Robert J.2 (AUTHOR) robert.henry@uq.edu.au
Publikováno v: BMC Plant Biology. 9/16/2024, Vol. 24 Issue 1, p1-23. 23p.
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Oyster transcriptome response to Alexandrium exposure is related to saxitoxin load and characterized by disrupted digestion, energy balance, and calcium and sodium signaling.
Autor: Mat AM; Ifremer, LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, CS 10070, 29280 Plouzané, France., Klopp C; INRA, Plate-forme Genotoul Bioinfo, UR875, Auzeville, France., Payton L; UMR 5805 EPOC, CNRS - Université de Bordeaux, F-33120 Arcachon, France., Jeziorski C; GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville, France., Chalopin M; Ifremer, LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, CS 10070, 29280 Plouzané, France., Amzil Z; Ifremer, Laboratoire Phycotoxines, rue de l'Ile d'Yeu, BP 21105, F-44311 Nantes, France., Tran D; UMR 5805 EPOC, CNRS - Université de Bordeaux, F-33120 Arcachon, France., Wikfors GH; Northeast Fisheries Science Center, NOAA National Marine Fisheries Service, 212 Rogers Avenue, Milford, CT 06460, USA., Hégaret H; LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, IUEM, rue Dumont d'Urville, 29280 Plouzané, France., Soudant P; LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, IUEM, rue Dumont d'Urville, 29280 Plouzané, France., Huvet A; Ifremer, LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, CS 10070, 29280 Plouzané, France., Fabioux C; LEMAR UMR 6539 CNRS/UBO/IRD/Ifremer, IUEM, rue Dumont d'Urville, 29280 Plouzané, France. Electronic address: caroline.fabioux@univ-brest.fr.
Publikováno v: Aquatic toxicology (Amsterdam, Netherlands) [Aquat Toxicol] 2018 Jun; Vol. 199, pp. 127-137. Date of Electronic Publication: 2018 Mar 27.
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Oral health status in historic population: Macroscopic and metagenomic evidence.
Autor: Willmann C; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France.; Service d'odontologie de l'Hôtel-Dieu, Toulouse, France., Mata X; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France., Hanghoej K; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France.; Centre for GeoGenetics, Natural History Museum of Denmark, Copenhagen, Denmark., Tonasso L; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France., Tisseyre L; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France., Jeziorski C; INRA, US 1426, GeT-PlaGe, Genotoul, Castanet-Tolosan, France., Cabot E; Institut National de Recherches Archéologiques Préventives, INRAP Grand Ouest, Cesson-Sévigné, France.; Anthropologie Bio-Culturelle, Droit, Ethique et Santé, Faculté de Médecine Site Nord (UMR 7268), Marseille, France., Chevet P; Institut National de Recherches Archéologiques Préventives, INRAP Grand Ouest, Cesson-Sévigné, France., Crubézy E; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France., Orlando L; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France.; Centre for GeoGenetics, Natural History Museum of Denmark, Copenhagen, Denmark., Esclassan R; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France.; Service d'odontologie de l'Hôtel-Dieu, Toulouse, France., Thèves C; Laboratoire d'Anthropologie Moléculaire et d'Imagerie de Synthèse UMR 5288, Université de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Toulouse, France.
Publikováno v: PloS one [PLoS One] 2018 May 16; Vol. 13 (5), pp. e0196482. Date of Electronic Publication: 2018 May 16 (Print Publication: 2018).
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Mitogenomics of Hesperelaea, an extinct genus of Oleaceae.
Autor: Van de Paer C; CNRS, Université de Toulouse, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Évolution & Diversité Biologique), 118 Route de Narbonne, 31062 Toulouse, France. Electronic address: vandepaer.celine@gmail.com., Hong-Wa C; Claude E. Phillips Herbarium, Delaware State University, 1200 N Dupont Hwy Dover, DE 19901-2277, USA., Jeziorski C; GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville, 31326 Castanet-Tolosan, France., Besnard G; CNRS, Université de Toulouse, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Évolution & Diversité Biologique), 118 Route de Narbonne, 31062 Toulouse, France. Electronic address: guillaume.besnard@univ-tlse3.fr.
Publikováno v: Gene [Gene] 2016 Dec 15; Vol. 594 (2), pp. 197-202. Date of Electronic Publication: 2016 Sep 04.
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Complete mitochondrial genome of Lutzomyia (Nyssomyia) umbratilis (Diptera: Psychodidae), the main vector of Leishmania guyanensis.
Autor: Kocher A; a CNRS, Université Toulouse III Paul Sabatier, ENFA; UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France., Gantier JC; b Laboratoire des Identifications Fongiques et Entomo-parasitologiques , Mennecy , France., Holota H; a CNRS, Université Toulouse III Paul Sabatier, ENFA; UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France., Jeziorski C; c INRA, UAR 1209 Département de génétique animale , INRA Auzeville , Castanet-Tolosan , France.; d GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville , Castanet-Tolosan , France., Coissac E; e Laboratoire d'Ecologie Alpine , CNRS UMR 5553, Université Joseph Fourier , Grenoble , France., Bañuls AL; f UMR MIVEGEC (IRD 224 - CNRS 5290), Université de Montpellier) , Montpellier , France , and., Girod R; g Medical Entomology Unit , Institut Pasteur de la Guyane , Cayenne Cedex , French Guiana., Gaborit P; g Medical Entomology Unit , Institut Pasteur de la Guyane , Cayenne Cedex , French Guiana., Murienne J; a CNRS, Université Toulouse III Paul Sabatier, ENFA; UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France.
Publikováno v: Mitochondrial DNA. Part A, DNA mapping, sequencing, and analysis [Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal] 2016 Nov; Vol. 27 (6), pp. 4219-4221. Date of Electronic Publication: 2015 May 22.
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PCR-free shotgun sequencing of the stone loach mitochondrial genome (Barbatula barbatula).
Autor: Murienne J; a CNRS, Université de Toulouse III Paul Sabatier, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France., Jeziorski C; b INRA, UAR1209, Département de Génétique Animale , INRA Auzeville , Castanet-Tolosan , France.; c GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville , Castanet-Tolosan , France., Holota H; a CNRS, Université de Toulouse III Paul Sabatier, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France., Coissac E; d Laboratoire d'Ecologie Alpine , CNRS UMR , Grenoble , France , and., Blanchet S; a CNRS, Université de Toulouse III Paul Sabatier, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France.; e Station Expérimentale du CNRS à Moulis, U.S.R , Moulis , France., Grenouillet G; a CNRS, Université de Toulouse III Paul Sabatier, ENFA, UMR5174 EDB (Laboratoire Evolution et Diversité Biologique) , Toulouse , France.
Publikováno v: Mitochondrial DNA. Part A, DNA mapping, sequencing, and analysis [Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal] 2016 Nov; Vol. 27 (6), pp. 4211-4212. Date of Electronic Publication: 2015 May 22.
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Metatranscriptomes of oil-contaminated marine coastal sediment affected by oil addition and/or by the bioturbating activity of the marine polychaete Hediste diversicolor: Who are the microbial players?
Autor: Militon C; Aix Marseille Université, CNRS, Université de Toulon, IRD, Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) UM 110, 13288, Marseille, France. Electronic address: cecile.militon@univ-amu.fr., Atkinson A; Aix Marseille Université, CNRS, Université de Toulon, IRD, Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) UM 110, 13288, Marseille, France., Michotey V; Aix Marseille Université, CNRS, Université de Toulon, IRD, Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) UM 110, 13288, Marseille, France., Jeziorski C; GeT-PlaGe, Genotoul, INRA Auzeville F31326, Castanet-Tolosan, France; INRA, UAR1209, INRA Auzeville F31326, Castanet-Tolosan, France., Cravo-Laureau C; Equipe Environnement et Microbiologie, MELODY group, Université de Pau et des Pays de l'Adour, IPREM UMR CNRS 5254, BP 1155, 64013 Pau Cedex, France., Duran R; Equipe Environnement et Microbiologie, MELODY group, Université de Pau et des Pays de l'Adour, IPREM UMR CNRS 5254, BP 1155, 64013 Pau Cedex, France., Bonin P; Aix Marseille Université, CNRS, Université de Toulon, IRD, Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) UM 110, 13288, Marseille, France., Cuny P; Aix Marseille Université, CNRS, Université de Toulon, IRD, Mediterranean Institute of Oceanography (MIO) UM 110, 13288, Marseille, France.
Publikováno v: Marine genomics [Mar Genomics] 2016 Oct; Vol. 29, pp. 55-59. Date of Electronic Publication: 2016 Jul 15.
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