Zobrazeno 1 - 10
of 125
pro vyhledávání: '"Holloway, Alisha K"'
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Next-generation sequencing technology enables the identification of thousands of gene regulatory sequences in many cell types and organisms. We consider the problem of testing if two such sequences differ in their number of binding site motifs for a
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1402.0042
Publikováno v:
Systematic Biology, 2001 Nov 01. 50(6), 978-982.
Externí odkaz:
https://www.jstor.org/stable/3070875
Publikováno v:
Evolution, 2008 Dec 01. 62(12), 2984-2994.
Externí odkaz:
https://www.jstor.org/stable/25483539
Publikováno v:
The American Naturalist, 2006 Apr 01. 167(4), E88-E101.
Externí odkaz:
https://www.jstor.org/stable/10.1086/501079
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Thomas, R; Thomas, S; Holloway, AK; & Pollard, KS. (2017). Features that define the best ChIP-seq peak calling algorithms. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 18(3), 441-450. doi: 10.1093/bib/bbw035. UC San Francisco: Retrieved from: http://www.escholarship.org/uc/item/497899kz
Briefings in bioinformatics, vol 18, iss 3
Briefings in bioinformatics, vol 18, iss 3
Chromatin immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-seq) is an important tool for studying gene regulatory proteins, such as transcription factors and histones. Peak calling is one of the first steps in the analysis of these data. Peak calling
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::7c1f8922bb65faca773d179b6f57b42f
http://www.escholarship.org/uc/item/497899kz
http://www.escholarship.org/uc/item/497899kz
Publikováno v:
PLoS Genetics. Apr2011, Vol. 7 Issue 4, p1-24. 24p.
Autor:
Begun, David J.1,2 djbegun@ucdavis.edu, Holloway, Alisha K.1,2 akholloway@ucdavis.edu, Stevens, Kristian1,2, Hillier, LaDeana W.3, Poh, Yu-Ping1,2,4,5, Hahn, Matthew W.6,7, Nista, Phillip M.6, Jones, Corbin D.8,9, Kern, Andrew D.1,2,10, Dewey, Colin N.11, Pachter, Lior12,13, Myers, Eugene13, Langley, Charles H.1,2 chlangley@ucdavis.edu
Publikováno v:
PLoS Biology. Nov2007, Vol. 5 Issue 11, pe310-2559. 26p. 3 Charts, 5 Graphs.
Autor:
Holloway, Alisha K.1,2 akholloway@ucdavis.edu, Lawniczak, Mara K. N.3, Mezey, Jason G.4, Begun, David J.1,2, Jones, Corbin D.5,6
Publikováno v:
PLoS Genetics. Oct2007, Vol. 3 Issue 10, pe187-2013. 7p. 1 Chart, 2 Graphs.