Zobrazeno 1 - 10
of 48
pro vyhledávání: '"Hillje, Roman"'
Autor:
Mucci, Adele, Lopez-Rodriguez, Elena, Hetzel, Miriam, Liu, Serena, Suzuki, Takuji, Happle, Christine, Ackermann, Mania, Kempf, Henning, Hillje, Roman, Kunkiel, Jessica, Janosz, Ewa, Brennig, Sebastian, Glage, Silke, Bankstahl, Jens P., Dettmer, Sabine, Rodt, Thomas, Gohring, Gudrun, Trapnell, Bruce, Hansen, Gesine, Trapnell, Cole, Knudsen, Lars, Lachmann, Nico, Moritz, Thomas
Publikováno v:
In Stem Cell Reports 11 September 2018 11(3):696-710
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Cheloni, Stefano1, Hillje, Roman1, Luzi, Lucilla1, Pelicci, Pier Giuseppe1,2 piergiuseppe.pelicci@ieo.it, Gatti, Elena1 elena.gatti@ieo.it
Publikováno v:
BMC Medical Genomics. 1/29/2021, Vol. 14 Issue 1, p1-7. 7p.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Additional file 4. Fig. S3. Characterization of cellular barcodes missed by XenoCell. Highlighted in red are the 54 (47 + 7) cellular barcodes that were missed after XenoCell preprocessing, which instead were expected to be scored according to the UM
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::09340a1fabe72721a27e85582d34f347
Additional file 2. Fig. S1. Comparison of barcode classification by XenoCell and Cell Ranger on a mixed human-mouse dataset. Both tools extract mostly the same human cells (~ 97% overlap), with only a few cells specific to each tool. Instead, all mur
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::c1863880f83ac4c5b7c3c36952281e24
Additional file 5. Fig. S4. Classification of cellular barcodes in the PDX dataset. The sequenced reads of the P3 sample in the public PDX dataset were classified and grouped by the cellular barcodes they are associated with. Then, cellular barcodes
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::b96fc49c1beb30da53924adef17e47cf
Additional file 1. Table S1. Computational resources needed to process public datasets. The table reports details regarding the setting of the analyzed datasets: 50:50 cell line mixed-species and a published Drop-Seq dataset from a real PDX scRNAseq
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::39e8b67edeba89cc7ad7445c3365fc2c
Additional file 3. Fig. S2. Correlation of transcripts per gene in XenoCell-filtered and unfiltered cells. The plots depict the perfect correlation of transcripts per genes counts calculated for both graft (hg19, left panel) and host (mm10, right pan
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::73f2b7250651c667655c78431f29994e