Zobrazeno 1 - 10
of 124
pro vyhledávání: '"Gyori, Benjamin M."'
Autor:
Lobentanzer, Sebastian, Aloy, Patrick, Baumbach, Jan, Bohar, Balazs, Charoentong, Pornpimol, Danhauser, Katharina, Doğan, Tunca, Dreo, Johann, Dunham, Ian, Fernandez-Torras, Adrià, Gyori, Benjamin M., Hartung, Michael, Hoyt, Charles Tapley, Klein, Christoph, Korcsmaros, Tamas, Maier, Andreas, Mann, Matthias, Ochoa, David, Pareja-Lorente, Elena, Popp, Ferdinand, Preusse, Martin, Probul, Niklas, Schwikowski, Benno, Sen, Bünyamin, Strauss, Maximilian T., Turei, Denes, Ulusoy, Erva, Wodke, Judith Andrea Heidrun, Saez-Rodriguez, Julio
Standardising the representation of biomedical knowledge among all researchers is an insurmountable task, hindering the effectiveness of many computational methods. To facilitate harmonisation and interoperability despite this fundamental challenge,
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2212.13543
The link prediction task on knowledge graphs without explicit negative triples in the training data motivates the usage of rank-based metrics. Here, we review existing rank-based metrics and propose desiderata for improved metrics to address lack of
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2203.07544
Autor:
Rozemberczki, Benedek, Hoyt, Charles Tapley, Gogleva, Anna, Grabowski, Piotr, Karis, Klas, Lamov, Andrej, Nikolov, Andriy, Nilsson, Sebastian, Ughetto, Michael, Wang, Yu, Derr, Tyler, Gyori, Benjamin M
In this paper, we introduce ChemicalX, a PyTorch-based deep learning library designed for providing a range of state of the art models to solve the drug pair scoring task. The primary objective of the library is to make deep drug pair scoring models
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2202.05240
Autor:
Matentzoglu, Nicolas, Balhoff, James P., Bello, Susan M., Bizon, Chris, Brush, Matthew, Callahan, Tiffany J., Chute, Christopher G, Duncan, William D., Evelo, Chris T., Gabriel, Davera, Graybeal, John, Gray, Alasdair, Gyori, Benjamin M., Haendel, Melissa, Harmse, Henriette, Harris, Nomi L., Harrow, Ian, Hegde, Harshad, Hoyt, Amelia L., Hoyt, Charles T., Jiao, Dazhi, Jiménez-Ruiz, Ernesto, Jupp, Simon, Kim, Hyeongsik, Koehler, Sebastian, Liener, Thomas, Long, Qinqin, Malone, James, McLaughlin, James A., McMurry, Julie A., Moxon, Sierra, Munoz-Torres, Monica C., Osumi-Sutherland, David, Overton, James A., Peters, Bjoern, Putman, Tim, Queralt-Rosinach, Núria, Shefchek, Kent, Solbrig, Harold, Thessen, Anne, Tudorache, Tania, Vasilevsky, Nicole, Wagner, Alex H., Mungall, Christopher J.
Despite progress in the development of standards for describing and exchanging scientific information, the lack of easy-to-use standards for mapping between different representations of the same or similar objects in different databases poses a major
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2112.07051
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
We introduce a framework for analyzing ordinary differential equation (ODE) models of biological networks using statistical model checking (SMC). A key aspect of our work is the modeling of single-cell variability by assigning a probability distribut
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1812.01091
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Gyori, Benjamin M., Bachman, John A.
Publikováno v:
In Current Opinion in Systems Biology December 2021 28
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Bachman, John A1 (AUTHOR), Gyori, Benjamin M1 (AUTHOR) benjamin_gyori@hms.harvard.edu, Sorger, Peter K1,2 (AUTHOR) peter_sorger@hms.harvard.edu
Publikováno v:
Molecular Systems Biology. 5/9/2023, Vol. 19 Issue 5, p1-26. 26p.