Zobrazeno 1 - 10
of 100
pro vyhledávání: '"Gkeka, Paraskevi"'
Autor:
Bussi, Giovanni, Bonomi, Massimiliano, Gkeka, Paraskevi, Sattler, Michael, Al-Hashimi, Hashim M., Auffinger, Pascal, Duca, Maria, Foricher, Yann, Incarnato, Danny, Jones, Alisha N., Kirmizialtin, Serdal, Krepl, Miroslav, Orozco, Modesto, Palermo, Giulia, Pasquali, Samuela, Salmon, Loïc, Schwalbe, Harald, Westhof, Eric, Zacharias, Martin
Publikováno v:
Structure 32, 1281 (2024)
Ribonucleic acids (RNA) are unique in that they can store genetic information, replicate and perform catalysis. Importantly, RNA molecules are highly dynamic, and thus determining the ensemble of conformations that they populate is crucial not only t
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2404.02789
Autor:
Belkacemi, Zineb, Bianciotto, Marc, Minoux, Herve, Lelievre, Tony, Stoltz, Gabriel, Gkeka, Paraskevi
The heat shock protein 90 (Hsp90) is a molecular chaperone that controls the folding and activation of client proteins using the free energy of ATP hydrolysis. The Hsp90 active site is in its N-terminal domain (NTD). Our goal is to characterize the d
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2306.02935
Free energy biasing methods have proven to be powerful tools to accelerate the simulation of important conformational changes of molecules by modifying the sampling measure. However, most of these methods rely on the prior knowledge of low-dimensiona
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2104.11061
Autor:
Gkeka, Paraskevi, Stoltz, Gabriel, Farimani, Amir Barati, Belkacemi, Zineb, Ceriotti, Michele, Chodera, John, Dinner, Aaron R., Ferguson, Andrew, Maillet, Jean-Bernard, Minoux, Hervé, Peter, Christine, Pietrucci, Fabio, Silveira, Ana, Tkatchenko, Alexandre, Trstanova, Zofia, Wiewiora, Rafal, Leliévre, Tony
Machine learning encompasses a set of tools and algorithms which are now becoming popular in almost all scientific and technological fields. This is true for molecular dynamics as well, where machine learning offers promises of extracting valuable in
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2004.06950
Autor:
Gkeka, Paraskevi
Peptide-membrane interactions play an important role in a number of biological processes, such as antimicrobial defence mechanisms, viral translocation, membrane fusion and functions ofmembrane proteins. In particular, amphipathic α-helical peptides
Externí odkaz:
http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.562994
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Journal of Chemical Theory & Computation; 1/11/2022, Vol. 18 Issue 1, p59-78, 20p
Autor:
Wodak, Shoshana J, Paci, Emanuele, Dokholyan, Nikolay V, Berezovsky, Igor N, Horovitz, Amnon, Li, Jing, Hilser, Vincent J, Bahar, Ivet, Karanicolas, John, Stock, Gerhard, Hamm, Peter, Stote, Roland H, Eberhardt, Jerome, Chebaro, Yassmine, Dejaegere, Annick, Cecchini, Marco, Changeux, Jean-Pierre, Bolhuis, Peter G, Vreede, Jocelyne, Faccioli, Pietro, Orioli, Simone, Ravasio, Riccardo, Yan, Le, Brito, Carolina, Wyart, Matthieu, Gkeka, Paraskevi, Rivalta, Ivan, Palermo, Giulia, McCammon, J Andrew, Panecka-Hofman, Joanna, et al
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od_______885::4a7c8ea12c0e66a2eb99994b672557b3
https://www.zora.uzh.ch/id/eprint/183165/
https://www.zora.uzh.ch/id/eprint/183165/