How the methodology of 3D structure preparation influences the quality of QSPR models?

Autor: Geidl Stanislav, Beránek Roman, Vařeková Radka, Bouchal Tomáš, Brumovský Miroslav, Kudera Michal, Skřehota Ondřej, Koča Jaroslav

Publikováno v: Journal of Cheminformatics, Vol 4, Iss Suppl 1, p P61 (2012)

Externí odkaz: https://doaj.org/article/c71c7ffb3fc945d4872ac2dd0a03db16

The Eighth Central European Conference 'Chemistry towards Biology'

Autor: Perczel, András, Atanasov, Atanas G., Sklenář, Vladimír, Nováček, Jiři, Papoušková, Veronika, Kadeřávek, Pavel, Žídek, Lukáš, Kozłowski, Henryk, Watły, Joanna, Hecel, Aleksandra, Kołkowska, Paulina, Koča, Jaroslav, Svobodová-Vařeková, Radka, Pravda, Lukáš, Sehnal, David, Horský, Vladimír, Geidl, Stanislav, Enriz, Ricardo D., Matějka, Pavel, Jeništová, Adéla, Dendisová, Marcela, Kokaislová, Alžběta, Weissig, Volkmar, Olsen, Mark, Coffey, Aidan, Ajuebor, Jude, Keary, Ruth, Sanz-Gaitero, Marta, Raaij, Mark J. van, McAuliffe, Olivia, Waltenberger, Birgit, Mocan, Andrei, Šmejkal, Karel, Heiss, Elke H., Diederich, Marc, Musioł, Robert, Košmrlj, Janez, Polański, Jarosław, Jampílek, Josef

Publikováno v: Molecules, vol. 21, no. 10, 1381, 2016.

The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology” was held in Brno, Czech Republic, on 28 August–1 September 2016 to bring together experts in biology, chemistry and design of bioactive compounds promote the exchange of scienti

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______3505::443c8d7d93a3218838606eb5388dabab
https://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-131275

High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications.

Autor: Geidl, Stanislav¹, Bouchal, Tomáš¹, Raèek, Tomáš^1,2, Vaøeková, Radka Svobodová¹, Hejret, Václav¹, Křenek, Aleš³, Abagyan, Ruben⁴, Koèa, Jaroslav¹ radka.svobodova@ceitec.muni.cz

Publikováno v: Journal of Cheminformatics. 12/2/2015, Vol. 7, p1-10. 10p.

Parametrizace ekvalizace elektronegativity metodou diferenciální evoluce

Autor: Pazúriková Jana, Raček Tomáš, Geidl Stanislav, Svobodová Vařeková Radka, Křenek Aleš

Publikováno v: ENBIK 2016

t formou posteru popisuje řešení parametrizace pro metodu ekvalizace elektronegativity pomocí metody diferenciální evoluce. Pomocí ní jsme dosáhli výrazně přesnějších výsledků i na heterogenních tréninkových sadách než se souča

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______3253::21c48c5a823407f24933202b41ed48b8
https://is.muni.cz/publication/1350828

Predicting pKa values from EEM atomic charges

Autor: Vařeková, Radka, Geidl, Stanislav, Ionescu, Crina-Maria, Skřehota, Ondřej, Bouchal, Tomáš, Sehnal, David, Abagyan, Ruben, Koča, Jaroslav

Publikováno v: Vařeková, Radka; Geidl, Stanislav; Ionescu, Crina-Maria; Skřehota, Ondřej; Bouchal, Tomáš; Sehnal, David; et al.(2013). Predicting pKa values from EEM atomic charges. Journal of Cheminformatics, 5(1), 18. doi: http://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-18. Retrieved from: http://www.escholarship.org/uc/item/8h4327bd

The acid dissociation constant p K a is a very important molecular property, and there is a strong interest in the development of reliable and fast methods for p K a prediction. We have evaluated the p K a prediction capabilities of QSPR models based

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od_______325::a865246b9ef5ea788f358b01c2b57798
http://www.escholarship.org/uc/item/8h4327bd