Clinical outcomes and molecular characterization of drug-resistant tuberculosis in pre- and extensively drug-resistant disease based on line probe assays

Autor: Araújo, Lauane G., Garcia, Márcia T., Zaccariotto, Tânia R., Moretti, Maria Luiza, Levy, Carlos E., Resende, Mariângela R. ^*

Publikováno v: In Brazilian Journal of Infectious Diseases January-February 2021 25(1)

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Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil.

Autor: Candido DS; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Claro IM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., de Jesus JG; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Souza WM; Centro de Pesquisa em Virologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, Brazil., Moreira FRR; Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Dellicour S; Spatial Epidemiology Lab, Université Libre de Bruxelles, Brussels, Belgium.; Department of Microbiology, Immunology and Transplantation, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Mellan TA; MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK., du Plessis L; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Pereira RHM; Institute for Applied Economic Research, Brasília, Brazil., Sales FCS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Manuli ER; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Thézé J; Université Clermont Auvergne, INRAE, VetAgro Sup, UMR EPIA, Saint-Genès-Champanelle, France., Almeida L; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Menezes MT; Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Voloch CM; Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Fumagalli MJ; Centro de Pesquisa em Virologia, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, Brazil., Coletti TM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., da Silva CAM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Ramundo MS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Amorim MR; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Hoeltgebaum HH; Department of Mathematics, Imperial College London, London, UK., Mishra S; MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK., Gill MS; Department of Microbiology, Immunology and Transplantation, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Carvalho LM; Escola de Matemática Aplicada (EMAp), Fundação Getúlio Vargas, Rio de Janeiro, Brazil., Buss LF; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Prete CA Jr; Department of Electronic Systems Engineering, University of São Paulo, São Paulo, Brazil., Ashworth J; Usher Institute, University of Edinburgh, Edinburgh, UK., Nakaya HI; Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences, University of São Paulo, São Paulo, Brazil., Peixoto PS; Departamento de Matemática Aplicada, Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Brady OJ; Department of Infectious Disease Epidemiology, Faculty of Epidemiology and Population Health, London School of Hygiene & Tropical Medicine, London, UK.; Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases, London School of Hygiene & Tropical Medicine, London, UK., Nicholls SM; Institute for Microbiology and Infection, University of Birmingham, Birmingham, UK., Tanuri A; Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Rossi ÁD; Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Braga CKV; Institute for Applied Economic Research, Brasília, Brazil., Gerber AL; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., de C Guimarães AP; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Gaburo N Jr; DB Diagnósticos do Brasil, São Paulo, Brazil., Alencar CS; LIM 03 Laboratório de Medicina Laboratorial, Hospital das Clínicas Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Ferreira ACS; Instituto Hermes Pardini, Belo Horizonte, Brazil., Lima CX; Departamento de Cirurgia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.; Simile Instituto de Imunologia Aplicada Ltda, Belo Horizonte, Brazil., Levi JE; Laboratório DASA, São Paulo, Brazil., Granato C; Laboratório Fleury, São Paulo, Brazil., Ferreira GM; Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, Brazil., Francisco RS Jr; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Granja F; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil.; Centro de Estudos da Biodiversidade, Universidade Federal de Roraima, Boa Vista, Brazil., Garcia MT; Divisão de Doenças Infecciosas, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Moretti ML; Divisão de Doenças Infecciosas, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Perroud MW Jr; Hospital Estadual Sumaré, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Castiñeiras TMPP; Departamento de Doenças Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Lazari CS; Divisão de Laboratório Central do Hospital das Clínicas, da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Hill SC; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.; Department of Pathobiology and Population Sciences, Royal Veterinary College, Hatfield, UK., de Souza Santos AA; University of Oxford, Latin American Centre, Oxford School of Global and Area Studies, Oxford, UK., Simeoni CL; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Forato J; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Sposito AC; Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Schreiber AZ; Departamento de Patologia Clínica, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Santos MNN; Departamento de Patologia Clínica, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., de Sá CZ; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Souza RP; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Resende-Moreira LC; Departamento de Botânica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Teixeira MM; Departamento de Bioquímica e Imunologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Hubner J; Departamento de Biologia Celular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Leme PAF; Centro de Saúde da Comunidade, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Moreira RG; Centro de Laboratórios Multiusuários, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Nogueira ML; Laboratório de Pesquisas em Virologia, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil., Ferguson NM; MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK., Costa SF; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Proenca-Modena JL; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Vasconcelos ATR; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Bhatt S; MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK., Lemey P; Department of Microbiology, Immunology and Transplantation, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Wu CH; Mathematical Sciences, University of Southampton, Southampton, UK., Rambaut A; Institute of Evolutionary Biology, University of Edinburgh, Edinburgh, UK., Loman NJ; Institute for Microbiology and Infection, University of Birmingham, Birmingham, UK., Aguiar RS; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil., Pybus OG; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Sabino EC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil. sabinoec@usp.br nfaria@ic.ac.uk.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Faria NR; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK. sabinoec@usp.br nfaria@ic.ac.uk.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, J-IDEA, Imperial College London, London, UK.

Publikováno v: Science (New York, N.Y.) [Science] 2020 Sep 04; Vol. 369 (6508), pp. 1255-1260. Date of Electronic Publication: 2020 Jul 23.