Evaluation of a whole-exome sequencing pipeline and benchmarking of causal germline variant prioritizers.

Autor: Tosco-Herrera E; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain., Muñoz-Barrera A; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain.; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Jáspez D; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Rubio-Rodríguez LA; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain.; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Mendoza-Alvarez A; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain., Rodriguez-Perez H; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain., Jou J; Department of Surgery, University of Illinois College of Medicine, Peoria, Illinois, USA., Iñigo-Campos A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Corrales A; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., Ciuffreda L; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Martinez-Bugallo F; Clinical Analysis Service, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Prieto-Morin C; Clinical Analysis Service, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain., García-Olivares V; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., González-Montelongo R; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Lorenzo-Salazar JM; Escuela de Doctorado y Estudios de Posgrado de la Universidad de La Laguna (EDEPULL), Universidad de La Laguna (ULL), San Cristóbal de La Laguna, Spain.; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain., Marcelino-Rodriguez I; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Flores C; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (HUNSC), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Granadilla de Abona, Spain.; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.; Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Fernando Pessoa Canarias, Las Palmas de Gran Canaria, Spain.

Publikováno v: Human mutation [Hum Mutat] 2022 Dec; Vol. 43 (12), pp. 2010-2020. Date of Electronic Publication: 2022 Sep 12.

Climate drives community-wide divergence within species over a limited spatial scale: evidence from an oceanic island.

Autor: Salces-Castellano A; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain.; School of Doctoral and Postgraduate Studies, University of La Laguna, 38200, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., Patiño J; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain.; Plant Conservation and Biogeography Group, Department of Botany, Ecology and Plant Physiology, University of La Laguna, C/ Astrofísico Francisco Sánchez, 38206, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., Alvarez N; Natural History Museum of Geneva, 1 route de Malagnou, 1208, Geneva, Switzerland., Andújar C; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain., Arribas P; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain., Braojos-Ruiz JJ; Tenerife Insular Water Council (CIATF), C/ Leoncio Rodríguez 2, 38003, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Del Arco-Aguilar M; Plant Conservation and Biogeography Group, Department of Botany, Ecology and Plant Physiology, University of La Laguna, C/ Astrofísico Francisco Sánchez, 38206, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., García-Olivares V; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain.; School of Doctoral and Postgraduate Studies, University of La Laguna, 38200, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., Karger DN; Swiss Federal Research Institute WSL, Zürcherstrasse 111, 8903, Birmensdorf, Switzerland., López H; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain., Manolopoulou I; Department of Statistical Science, University College London, London, UK., Oromí P; Department of Animal Biology, Edaphology and Geology, University of Laguna, C/ Astrofísico Francisco Sánchez, 38206, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., Pérez-Delgado AJ; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain.; School of Doctoral and Postgraduate Studies, University of La Laguna, 38200, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, Spain., Peterman WE; School of Environmental and Natural Resources, The Ohio State University, Columbus, OH, USA., Rijsdijk KF; Institute for Biodiversity and Ecosystem Dynamics, University of Amsterdam, Amsterdam, Netherlands., Emerson BC; Island Ecology and Evolution Research Group, Institute of Natural Products and Agrobiology (IPNA-CSIC), C/Astrofísico Francisco Sánchez 3, La Laguna, Tenerife, Canary Islands, 38206, Spain.

Publikováno v: Ecology letters [Ecol Lett] 2020 Feb; Vol. 23 (2), pp. 305-315. Date of Electronic Publication: 2019 Nov 25.

Digging into the admixture strata of current-day Canary Islanders based on mitogenomes.

Autor: García-Olivares V; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Plataforma Genómica de Alto Rendimiento para el Estudio de la Biodiversidad, Instituto de Productos Naturales y Agrobiología (IPNA), Consejo Superior de Investigaciones Científicas, San Cristóbal de La Laguna, Spain., Rubio-Rodríguez LA; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Muñoz-Barrera A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Díaz-de Usera A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Jáspez D; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Iñigo-Campos A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., Rodríguez Pérez MDC; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Cabrera de León A; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Área de Medicina Preventiva y Salud Pública, Universidad de La Laguna, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Lorenzo-Salazar JM; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain., González-Montelongo R; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Plataforma Genómica de Alto Rendimiento para el Estudio de la Biodiversidad, Instituto de Productos Naturales y Agrobiología (IPNA), Consejo Superior de Investigaciones Científicas, San Cristóbal de La Laguna, Spain., Cabrera VM; Freelance Researcher, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Flores C; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Plataforma Genómica de Alto Rendimiento para el Estudio de la Biodiversidad, Instituto de Productos Naturales y Agrobiología (IPNA), Consejo Superior de Investigaciones Científicas, San Cristóbal de La Laguna, Spain.; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife, Spain.; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.; Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Fernando de Pessoa Canarias, Las Palmas de Gran Canaria, Spain.

Publikováno v: IScience [iScience] 2022 Dec 29; Vol. 26 (1), pp. 105907. Date of Electronic Publication: 2022 Dec 29 (Print Publication: 2023).

Developing CIRdb as a catalog of natural genetic variation in the Canary Islanders.

Autor: Díaz-de Usera A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Rubio-Rodríguez LA; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Muñoz-Barrera A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Lorenzo-Salazar JM; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Guillen-Guio B; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Jáspez D; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Corrales A; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain.; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, 28029, Madrid, Spain., Íñigo-Campos A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., García-Olivares V; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Rodríguez Pérez MDC; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Marcelino-Rodríguez I; Área de Medicina Preventiva y Salud Pública, Universidad de La Laguna, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Cabrera de León A; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain.; Área de Medicina Preventiva y Salud Pública, Universidad de La Laguna, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain., González-Montelongo R; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain., Flores C; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables (ITER), 38600, Santa Cruz de Tenerife, Spain. cflores@ull.edu.es.; Research Unit, Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria, 38010, Santa Cruz de Tenerife, Spain. cflores@ull.edu.es.; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, 28029, Madrid, Spain. cflores@ull.edu.es.; Facultad de Ciencias de La Salud, Universidad Fernando Pessoa Canarias, 35450, Las Palmas de Gran Canaria, Spain. cflores@ull.edu.es.

Publikováno v: Scientific reports [Sci Rep] 2022 Sep 27; Vol. 12 (1), pp. 16132. Date of Electronic Publication: 2022 Sep 27.

Monitoring the rise of the SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in Tenerife (Spain) since mid-December 2020.

Autor: Alcoba-Florez J; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain. Electronic address: juliaalcoba@gmail.com., Lorenzo-Salazar JM; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife 38600, Spain. Electronic address: jlorsal@gmail.com., Gil-Campesino H; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain. Electronic address: helegc@hotmail.com., Íñigo-Campos A; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife 38600, Spain. Electronic address: ainigo@iter.es., Martínez de Artola DG; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain. Electronic address: diegogarciamartinezdeartola@gmail.com., García-Olivares V; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife 38600, Spain. Electronic address: vgarcia@iter.es., Díez-Gil O; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain. Electronic address: odiegil@gobiernodecanarias.org., Valenzuela-Fernández A; Laboratorio de Inmunología Celular y Viral, Unidad de Farmacología, Facultad de Medicina, Universidad de La Laguna, San Cristóbal de La Laguna 38200, Spain. Electronic address: avalenzu@ull.edu.es., Ciuffreda L; Research Unit, Unidad de Investigación, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Carretera del Rosario s/n, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain. Electronic address: laura.ciuffreda1988@gmail.com., González-Montelongo R; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife 38600, Spain. Electronic address: rgonzalezmontelongo@iter.es., Flores C; Genomics Division, Instituto Tecnológico y de Energías Renovables, Santa Cruz de Tenerife 38600, Spain; Research Unit, Unidad de Investigación, Hospital Universitario N. S. de Candelaria, Carretera del Rosario s/n, Santa Cruz de Tenerife 38010, Spain; CIBER de Enfermedades Respiratorias, Instituto de Salud Carlos III, Madrid 28029, Spain; Instituto de Tecnologías Biomédicas (ITB) Universidad de La Laguna, San Cristóbal de La Laguna 38200, Spain. Electronic address: cflores@ull.edu.es.

Publikováno v: The Journal of infection [J Infect] 2021 Jun; Vol. 82 (6), pp. e1-e3. Date of Electronic Publication: 2021 Apr 20.