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Plasmids are found across bacteria, archaea, and eukaryotes and play an important role in evolution. Plasmids exist at different copy numbers, the number of copies of the plasmid per cell, ranging from a single plasmid per cell to hundreds of plasmid
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https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::94ff8e7f25c9e31d00cf5e49dc3e96cb
https://doi.org/10.1101/594879
https://doi.org/10.1101/594879
Autor:
Pan, Rosalind Wenshan1 (AUTHOR) phillips@pboc.caltech.edu, Röschinger, Tom1 (AUTHOR), Faizi, Kian1 (AUTHOR), Garcia, Hernan G.2,3,4,5 (AUTHOR), Phillips, Rob1,6 (AUTHOR) phillips@pboc.caltech.edu
Publikováno v:
PLoS Computational Biology. 12/26/2024, Vol. 20 Issue 12, p1-34. 34p.
Autor:
Ledesma-Dominguez, Leonardo1,2 (AUTHOR) leonardoledd@ciencias.unam.mx, Carbajal-Degante, Erik3 (AUTHOR), Moreno-Hagelsieb, Gabriel4 (AUTHOR), Pérez-Rueda, Ernesto5 (AUTHOR) ernesto.perez@iimas.unam.mx
Publikováno v:
Scientific Reports. 11/14/2024, Vol. 12 Issue 1, p1-11. 11p.
Autor:
Ireland WT; Department of Physics, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Beeler SM; Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Flores-Bautista E; Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States., McCarty NS; Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Röschinger T; Division of Chemistry and Chemical Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Belliveau NM; Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Sweredoski MJ; Proteome Exploration Laboratory, Division of Biology and Biological Engineering, Beckman Institute, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Moradian A; Proteome Exploration Laboratory, Division of Biology and Biological Engineering, Beckman Institute, California Institute of Technology, Pasadena, United States., Kinney JB; Simons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, United States., Phillips R; Department of Physics, California Institute of Technology, Pasadena, United States.; Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, United States.
Publikováno v:
ELife [Elife] 2020 Sep 21; Vol. 9. Date of Electronic Publication: 2020 Sep 21.
Autor:
Flores-Bautista E; Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Universidad Nacional Autónoma de México, Unidad Académica Yucatán, Mérida, Yucatán, México., Hernandez-Guerrero R; Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Universidad Nacional Autónoma de México, Unidad Académica Yucatán, Mérida, Yucatán, México., Huerta-Saquero A; Centro de Nanociencias y Nanotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Ensenada, Baja California, México., Tenorio-Salgado S; Tecnológico Nacional de México, Instituto Tecnológico de Mérida, Mérida, Yucatán, México., Rivera-Gomez N; Instituto Nacional de Salud Pública, Cuernavaca, Morelos, México., Romero A; Microbiota Host Interactions and Clostridia Research Group, Universidad Nacional Andrés Bello, Santiago de Chile, Chile., Ibarra JA; Laboratorio de Genética Microbiana, Departamento de Microbiología, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, Ciudad de México, México., Perez-Rueda E; Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Universidad Nacional Autónoma de México, Unidad Académica Yucatán, Mérida, Yucatán, México.; Centro de Genómica y Bioinformática, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, Santiago, Chile.
Publikováno v:
PloS one [PLoS One] 2020 Aug 21; Vol. 15 (8), pp. e0237135. Date of Electronic Publication: 2020 Aug 21 (Print Publication: 2020).
Autor:
Flores-Bautista E; Facultad de Ingenieria Química, Universidad Autónoma de Yucatán, Mexico.; Laboratorio de Ecogenómica, Unidad Académica de Ciencias y Tecnología de Yucatán, Facultad de Ciencias, UNAM, Mérida, Yucatán, Mexico., Cronick CL; Departamento de Ciencias Básicas, Universidad Jorge Tadeo Lozano, Bogotá, Colombia., Fersaca AR; Facultad de Ciencias, Universidad Antonio Nariño, Bogotá, Colombia., Martinez-Nuñez MA; Laboratorio de Ecogenómica, Unidad Académica de Ciencias y Tecnología de Yucatán, Facultad de Ciencias, UNAM, Mérida, Yucatán, Mexico., Perez-Rueda E; Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Universidad Nacional Autónoma de México, Unidad Académica Yucatán, C.P. 97302 Mérida, Yucatán, Mexico.; Departamento de Ingenieria Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, UNAM, Cuernavaca C.P. 62210, Morelos, Mexico.
Publikováno v:
Computational and structural biotechnology journal [Comput Struct Biotechnol J] 2018 Mar 27; Vol. 16, pp. 157-166. Date of Electronic Publication: 2018 Mar 27 (Print Publication: 2018).
Autor:
Soria, Sandra1,2 (AUTHOR) lasobiotc@gmail.com, Carreón-Rodríguez, Ofelia E.1 (AUTHOR) efelio2000@gmail.com, de Anda, Ramón1 (AUTHOR) daramon.h@gmail.com, Flores, Noemí1 (AUTHOR) noemi.flores@ibt.unam.mx, Escalante, Adelfo1 (AUTHOR) adelfo.escalante@ibt.unam.mx, Bolívar, Francisco1 (AUTHOR) adelfo.escalante@ibt.unam.mx
Publikováno v:
BioTech. Jun2024, Vol. 13 Issue 2, p10. 22p.
Autor:
Qiu, Sizhe1 (AUTHOR), Wan, Xinlong1 (AUTHOR), Liang, Yueshan1 (AUTHOR), Lamoureux, Cameron1 (AUTHOR), Akbari, Amir1 (AUTHOR), Palsson, Bernhard O.1,2 (AUTHOR), Zielinski, Daniel C.1 (AUTHOR) dczielin@ucsd.edu
Publikováno v:
PLoS Computational Biology. 1/22/2024, Vol. 20 Issue 1, p1-16. 16p.
Autor:
Meade, Rachel K.1,2, Long, Jarukit E.3,4, Jinich, Adrian5, Rhee, Kyu Y.5, Ashbrook, David G.6, Williams, Robert W.6, Sassetti, Christopher M.3, Smith, Clare M.1,2 clare.m.smith@duke.edu
Publikováno v:
G3: Genes | Genomes | Genetics. Sep2023, Vol. 13 Issue 9, p1-15. 15p.
Publikováno v:
Molecular Biology & Evolution; Sep2024, Vol. 41 Issue 9, p1-17, 17p