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Akademický článek
Identification of Effectors: Precipitation of Supernatant Material.
Autor: Flaugnatti N; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM, UMR7255), Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix Marseille Univ, CNRS, Marseille, France.; Laboratory of Molecular Microbiology, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Journet L; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM, UMR7255), Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix Marseille Univ, CNRS, Marseille, France. ljournet@imm.cnrs.fr.
Publikováno v: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) [Methods Mol Biol] 2024; Vol. 2715, pp. 533-538.
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The tip protein PAAR is required for the function of the type VI secretion system.
Autor: Beauvois SG; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7255 , Marseille, France., Flaugnatti N; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7255 , Marseille, France., Ilbert M; Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7281 , Marseille, France., Boyer M; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7255 , Marseille, France., Gavello-Fernandez E; Institut Européen de Chimie et Biologie, University of Bordeaux , Pessac, France.; CNRS UMR 5234 Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité , Bordeaux, France., Fronzes R; Institut Européen de Chimie et Biologie, University of Bordeaux , Pessac, France.; CNRS UMR 5234 Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité , Bordeaux, France., Jurėnas D; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7255 , Marseille, France., Journet L; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université - CNRS UMR7255 , Marseille, France.
Publikováno v: Microbiology spectrum [Microbiol Spectr] 2023 Dec 12; Vol. 11 (6), pp. e0147823. Date of Electronic Publication: 2023 Oct 06.
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Activity and Crystal Structure of the Adherent-Invasive Escherichia coli Tle3/Tli3 T6SS Effector/Immunity Complex Determined Using an AlphaFold2 Predicted Model.
Autor: Le TTH; Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, Aix Marseille University and CNRS, 13288 Marseille, France., Kellenberger C; Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, Aix Marseille University and CNRS, 13288 Marseille, France., Boyer M; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Santucci P; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Flaugnatti N; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Cascales E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Roussel A; Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, Aix Marseille University and CNRS, 13288 Marseille, France.; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Canaan S; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Journet L; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie, Aix Marseille University and CNRS, 13009 Marseille, France., Cambillau C; Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, Aix Marseille University and CNRS, 13288 Marseille, France.; AlphaGraphix, 66210 Formiguères, France.; School of Microbiology, University College Cork, T12 K8AF Cork, Ireland.
Publikováno v: International journal of molecular sciences [Int J Mol Sci] 2023 Jan 16; Vol. 24 (2). Date of Electronic Publication: 2023 Jan 16.
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Human commensal gut Proteobacteria withstand type VI secretion attacks through immunity protein-independent mechanisms.
Autor: Flaugnatti N; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Isaac S; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Lemos Rocha LF; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Stutzmann S; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Rendueles O; Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, CNRS, UMR3525, 75015, Paris, France., Stoudmann C; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Vesel N; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Garcia-Garcera M; Department of Fundamental Microbiology, University of Lausanne, Lausanne, Switzerland., Buffet A; Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, CNRS, UMR3525, 75015, Paris, France., Sana TG; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland.; LIPME, Université de Toulouse, INRAE, CNRS, 31320, Castanet-Tolosan, France., Rocha EPC; Microbial Evolutionary Genomics, Institut Pasteur, CNRS, UMR3525, 75015, Paris, France., Blokesch M; Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland. melanie.blokesch@epfl.ch.
Publikováno v: Nature communications [Nat Commun] 2021 Oct 01; Vol. 12 (1), pp. 5751. Date of Electronic Publication: 2021 Oct 01.
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Structural basis for loading and inhibition of a bacterial T6SS phospholipase effector by the VgrG spike.
Autor: Flaugnatti N; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Rapisarda C; Institut Européen de Chimie et Biologie, University of Bordeaux, Pessac, France.; CNRS UMR 5234 Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, Bordeaux, France., Rey M; Mass Spectrometry for Biology Unit, Institut Pasteur, CNRS USR 2000, CITECH, Paris, France., Beauvois SG; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Nguyen VA; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Canaan S; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Durand E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Chamot-Rooke J; Mass Spectrometry for Biology Unit, Institut Pasteur, CNRS USR 2000, CITECH, Paris, France., Cascales E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France., Fronzes R; Institut Européen de Chimie et Biologie, University of Bordeaux, Pessac, France.; CNRS UMR 5234 Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité, Bordeaux, France., Journet L; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Institut de Microbiologie de la Méditerranée, Aix-Marseille Université-CNRS UMR7255, Marseille, France.
Publikováno v: The EMBO journal [EMBO J] 2020 Jun 02; Vol. 39 (11), pp. e104129. Date of Electronic Publication: 2020 Apr 30.
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TssL2 of T6SS2 is required for mobility, biofilm formation, wrinkly phenotype formation, and virulence of Vibrio parahaemolyticus SH112.
Autor: Bai XR; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China.; Department of Animal Science and Technology, Shanghai Vocational College of Agriculture and Forestry, Shanghai, 201699, China., Liu PX; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China., Wang WC; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China., Jin YH; Institute of Veterinary Medicine, Xinjiang Academy of Animal Sciences, Urumqi, 830013, China., Wang Q; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China., Qi Y; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China., Zhang XY; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China., Sun WD; College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China., Fang WH; Institute of Preventive Veterinary Medicine and Zhejiang Provincial Key Laboratory of Preventive Veterinary Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, 310058, China., Han XG; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China. hanxgan@163.com.; Engineering Research Center for the Prevention and Control of Animal Original Zoonosis, Longyan University, Longyan, 364012, China. hanxgan@163.com., Jiang W; Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shanghai, 200241, China. jiangweijw99@163.com.
Publikováno v: Applied microbiology and biotechnology [Appl Microbiol Biotechnol] 2024 Dec 17; Vol. 108 (1), pp. 537. Date of Electronic Publication: 2024 Dec 17.
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Pleiotropic regulatory function of the RNA chaperone Hfq in the Pseudomonas protegens FD6.
Autor: Wen, Deyu1 (AUTHOR), Hu, Jieyu1 (AUTHOR), Gao, Ziying1 (AUTHOR), Xing, Chenglin1 (AUTHOR), Xiao, Yao1 (AUTHOR), Wu, Tao1 (AUTHOR), Wu, Xiaogang2 (AUTHOR), Zhang, Qingxia1 (AUTHOR) zqx817@sina.com
Publikováno v: Phytopathology Research. 10/24/2024, Vol. 6 Issue 1, p1-13. 13p.
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Structure and Activity of the Type VI Secretion System.
Autor: Cherrak Y; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Aix-Marseille Université, CNRS, UMR 7255, 13402 Marseille Cedex 20, France.; Y.C. and N.F. contributed equally to this review., Flaugnatti N; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Aix-Marseille Université, CNRS, UMR 7255, 13402 Marseille Cedex 20, France.; Y.C. and N.F. contributed equally to this review.; Present address: Laboratory of Molecular Microbiology, Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland., Durand E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Aix-Marseille Université, CNRS, UMR 7255, 13402 Marseille Cedex 20, France., Journet L; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Aix-Marseille Université, CNRS, UMR 7255, 13402 Marseille Cedex 20, France., Cascales E; Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Aix-Marseille Université, CNRS, UMR 7255, 13402 Marseille Cedex 20, France.
Publikováno v: Microbiology spectrum [Microbiol Spectr] 2019 Jul; Vol. 7 (4).
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Identification of type VI secretion system effector-immunity pairs using structural bioinformatics.
Autor: Geller, Alexander M1 (AUTHOR), Shalom, Maor1 (AUTHOR), Zlotkin, David1 (AUTHOR), Blum, Noam1 (AUTHOR), Levy, Asaf1 (AUTHOR) alevy@mail.huji.ac.il
Publikováno v: Molecular Systems Biology. Jun2024, Vol. 20 Issue 6, p702-718. 17p.
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