Zobrazeno 1 - 10
of 35
pro vyhledávání: '"Fass, Josh"'
Autor:
Madin, Owen C., Boothroyd, Simon, Messerly, Richard A., Chodera, John D., Fass, Josh, Shirts, Michael R.
A high level of physical detail in a molecular model improves its ability to perform high accuracy simulations, but can also significantly affect its complexity and computational cost. In some situations, it is worthwhile to add additional complexity
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2105.07863
Autor:
Wang, Yuanqing, Fass, Josh, Kaminow, Benjamin, Herr, John E., Rufa, Dominic, Zhang, Ivy, Pulido, Iván, Henry, Mike, Chodera, John D.
Molecular mechanics (MM) potentials have long been a workhorse of computational chemistry. Leveraging accuracy and speed, these functional forms find use in a wide variety of applications in biomolecular modeling and drug discovery, from rapid virtua
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2010.01196
Atomic partial charges are crucial parameters for Molecular Dynamics (MD) simulations, molecular mechanics calculations, and virtual screening, as they determine the electrostatic contributions to interaction energies. Current methods for calculating
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1909.07903
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Fass, Josh1,2 josh.fass@choderalab.org, Sivak, David A.3 dsivak@sfu.ca, Crooks, Gavin E.4 gec@threeplusone.com, Beauchamp, Kyle A.5 kyleabeauchamp@gmail.com, Leimkuhler, Benedict6 B.Leimkuhler@ed.ac.uk, Chodera, John D.2 john.chodera@choderalab.org
Publikováno v:
Entropy. May2018, Vol. 20 Issue 5, p318. 28p.
Autor:
Chodera, John D., Shirts, Michael R., Fass, Josh, Madin, Owen, Stern, Chaya, Messerly, Richard
Use of Bayesian inference in force field parameterization presented at Open Force Field Consortium Workshop in San Diego, Jan 7 2019.
This work is in part funded by Open Force Field Consortium.
This work is in part funded by Open Force Field Consortium.
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::9829f7849c3d155622a4537fe4edfe05
Autor:
Boothroyd, Simon, Chodera, John D., Fass, Josh, Madin, Owen, Messerly, Richard, Mobley, David L., Shirts, Michael R., Slochower, David, Wagner, Jeffrey R., Wang, Lee Ping
John Chodera and Michael Shirts describe condensed phase property calculation using the SMIRNOFF force field and property calculator software project at the Open Force Field Consortium Workshop in San Diego, Jan 8 2019.
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::1e7f9ee7386ebb709be3a941ae2edd0b