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An emerging clade of Chikungunya West African genotype discovered in real-time during 2023 outbreak in Senegal.

Autor: Padane A; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Tegally H; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Ramphal Y; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Seyni N; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Sarr M; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diop MM; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diedhiou CK; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Mboup A; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diouf ND; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Souaré A; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diagne ND; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Aza-Gnandji M; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Dabo NA; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Dia YA; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diaw NA; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Leye N; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diaw PA; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Ahouidi A; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Cissé B; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diallo AS; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diop O; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Diallo AA; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Ndoye S; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal., Sanko TJ; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Baxter C; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Wilkinson E; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., San JE; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Tshabuila D; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Naidoo Y; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Pillay S; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), Nelson R Mandela School of Medicine, University of KwaZulu-Natal, Durban 4001, South Africa., Lessells R; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), Nelson R Mandela School of Medicine, University of KwaZulu-Natal, Durban 4001, South Africa., Cissé K; District of Kédougou, Kédougou, Senegal., Leye A; District of Kédougou, Kédougou, Senegal., Mbaye KA; District of Kédougou, Kédougou, Senegal., Kania D; Centre MURAZ,Bobo-Dioulasso, Burkina Faso., Tinto B; Centre MURAZ,Bobo-Dioulasso, Burkina Faso., Traoré I; Centre MURAZ,Bobo-Dioulasso, Burkina Faso., Kagone ST; Centre MURAZ,Bobo-Dioulasso, Burkina Faso., Ouedraogo AS; Centre MURAZ,Bobo-Dioulasso, Burkina Faso., Gifford RJ; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa., Lourenço J; Universidade Católica Portuguesa, Faculty of Medicine, Biomedical Research Centre, Lisbon, Portugal., Giovanetti M; Instituto Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Minas Gerais, Brazil., Giandhari J; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), Nelson R Mandela School of Medicine, University of KwaZulu-Natal, Durban 4001, South Africa., de Oliveira T; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University, Stellenbosch 7600, South Africa.; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), Nelson R Mandela School of Medicine, University of KwaZulu-Natal, Durban 4001, South Africa., Mboup S; Institut de Recherche en Santé, de Surveillance Épidémiologique et de Formation (IRESSEF), Dakar, Senegal.

Publikováno v: MedRxiv : the preprint server for health sciences [medRxiv] 2023 Nov 15. Date of Electronic Publication: 2023 Nov 15.