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Holistic integration of omics data reveals the drivers that shape the ecology of microbial meat spoilage scenarios.
Autor: Poirier S; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Coeuret G; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Champomier-Vergès MC; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Desmonts MH; Aerial, Illkirch-Graffenstaden, France., Werner D; Aerial, Illkirch-Graffenstaden, France., Feurer C; IFIP-Institut du Porc, Le Rheu, France., Frémaux B; IFIP-Institut du Porc, Le Rheu, France., Guillou S; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Luong NM; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Rué O; INRAE, MaIAGE, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Loux V; INRAE, MaIAGE, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Zagorec M; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Chaillou S; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France.
Publikováno v: Frontiers in microbiology [Front Microbiol] 2023 Oct 18; Vol. 14, pp. 1286661. Date of Electronic Publication: 2023 Oct 18 (Print Publication: 2023).
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Contribution of omics to biopreservation: Toward food microbiome engineering.
Autor: Borges F; Université de Lorraine, LIBio, Nancy, France., Briandet R; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Jouy-en-Josas, France., Callon C; Université Clermont Auvergne, INRAE, VetAgro Sup, UMR 545 Fromage, Aurillac, France., Champomier-Vergès MC; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Jouy-en-Josas, France., Christieans S; ADIV, Clermont-Ferrand, France., Chuzeville S; ACTALIA, Pôle d'Expertise Analytique, Unité Microbiologie Laitière, La Roche sur Foron, France., Denis C; ACTALIA, Sécurité des Aliments, Saint Lô, France., Desmasures N; Normandie Univ, UNICAEN, UNIROUEN, ABTE, Caen, France., Desmonts MH; Aerial, Illkirch, France., Feurer C; IFIP, Institut de la Filière Porcine, Le Rheu, France., Leroi F; Ifremer, MASAE, Laboratoire EM3B, Nantes, France., Leroy S; Université Clermont Auvergne, INRAE, MEDIS, Clermont-Ferrand, France., Mounier J; Univ Brest, Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne, Plouzané, France., Passerini D; Ifremer, MASAE, Laboratoire EM3B, Nantes, France., Pilet MF; Oniris, INRAE, SECALIM, Nantes, France., Schlusselhuber M; Normandie Univ, UNICAEN, UNIROUEN, ABTE, Caen, France., Stahl V; Aerial, Illkirch, France., Strub C; Qualisud, Univ Montpellier, Avignon Université, CIRAD, Institut Agro, IRD, Université de La Réunion, Montpellier, France., Talon R; Université Clermont Auvergne, INRAE, MEDIS, Clermont-Ferrand, France., Zagorec M; Oniris, INRAE, SECALIM, Nantes, France.
Publikováno v: Frontiers in microbiology [Front Microbiol] 2022 Aug 02; Vol. 13, pp. 951182. Date of Electronic Publication: 2022 Aug 02 (Print Publication: 2022).
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Application of a path-modelling approach for deciphering causality relationships between microbiota, volatile organic compounds and off-odour profiles during meat spoilage.
Autor: Luong NM; Secalim, INRAE, Oniris, Nantes, France., Membré JM; Secalim, INRAE, Oniris, Nantes, France. Electronic address: jeanne-marie.membre@oniris-nantes.fr., Coroller L; Univ Brest, Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), UMT Alter'ix, Quimper, France. Electronic address: louis.coroller@univ-brest.fr., Zagorec M; Secalim, INRAE, Oniris, Nantes, France. Electronic address: monique.zagorec@oniris-nantes.fr., Poirier S; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, F78352 Jouy-en-Josas, France. Electronic address: simon.poirier@ifpen.fr., Chaillou S; Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, F78352 Jouy-en-Josas, France. Electronic address: stephane.chaillou@inrae.fr., Desmonts MH; Aerial, Illkirch, France. Electronic address: mh.Desmonts@Aerial-Crt.Com., Werner D; Aerial, Illkirch, France. Electronic address: da.werner@aerial-crt.com., Cariou V; StatSC, Oniris, INRAE, Nantes, France. Electronic address: veronique.cariou@oniris-nantes.fr., Guillou S; Secalim, INRAE, Oniris, Nantes, France. Electronic address: sandrine.guillou@inrae.fr.
Publikováno v: International journal of food microbiology [Int J Food Microbiol] 2021 Jun 16; Vol. 348, pp. 109208. Date of Electronic Publication: 2021 Apr 28.
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Spoilage of fresh turkey and pork sausages: Influence of potassium lactate and modified atmosphere packaging.
Autor: Luong NM; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France., Jeuge S; IFIP, Paris, France., Coroller L; Univ de Brest, Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne, UMT Alter'ix, F-29334 Quimper, France., Feurer C; IFIP, Le Rheu, France., Desmonts MH; Aerial, Illkirch, France., Moriceau N; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France., Anthoine V; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France., Gavignet S; Aerial, Illkirch, France., Rapin A; Aerial, Illkirch, France., Frémaux B; IFIP, Paris, France., Robieu E; IFIP, Paris, France., Zagorec M; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France., Membré JM; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France., Guillou S; INRAE, Oniris, Secalim, route de Gachet, CS 40706, F-44307 Nantes, France.
Publikováno v: Food research international (Ottawa, Ont.) [Food Res Int] 2020 Nov; Vol. 137, pp. 109501. Date of Electronic Publication: 2020 Jul 04.
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Large-scale multivariate dataset on the characterization of microbiota diversity, microbial growth dynamics, metabolic spoilage volatilome and sensorial profiles of two industrially produced meat products subjected to changes in lactate concentration and packaging atmosphere.
Autor: Poirier S; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, 78350, Jouy-en-Josas, France., Luong NM; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Anthoine V; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Guillou S; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Membré JM; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Moriceau N; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Rezé S; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Zagorec M; INRAE, UMR1014 Secalim, Oniris, Nantes, France., Feurer C; IFIP-Institut du Porc, Maisons-Alfort et Le Rheu, France., Frémaux B; IFIP-Institut du Porc, Maisons-Alfort et Le Rheu, France., Jeuge S; IFIP-Institut du Porc, Maisons-Alfort et Le Rheu, France., Robieu E; IFIP-Institut du Porc, Maisons-Alfort et Le Rheu, France., Champomier-Vergès M; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, 78350, Jouy-en-Josas, France., Coeuret G; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, 78350, Jouy-en-Josas, France., Cauchie E; Veterinary Medicine Faculty, Food Sciences, Université de Liège, FARAH, 4000 Liège, Belgium., Daube G; Veterinary Medicine Faculty, Food Sciences, Université de Liège, FARAH, 4000 Liège, Belgium., Korsak N; Veterinary Medicine Faculty, Food Sciences, Université de Liège, FARAH, 4000 Liège, Belgium., Coroller L; Université de Bretagne Occidentale, EA3882 Lubem, Quimper, France., Desriac N; Université de Bretagne Occidentale, EA3882 Lubem, Quimper, France., Desmonts MH; Aerial, 67412 Illkirch, France., Gohier R; Aerial, 67412 Illkirch, France., Werner D; Aerial, 67412 Illkirch, France., Loux V; INRAE, MaIAGE, Université Paris-Saclay, 78350 Jouy-en-Josas, France.; INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, Université Paris-Saclay, 78350 Jouy-en-Josas, France., Rué O; INRAE, MaIAGE, Université Paris-Saclay, 78350 Jouy-en-Josas, France.; INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, Université Paris-Saclay, 78350 Jouy-en-Josas, France., Dohollou MH; Cooperl, 22403 Lamballe, Armor, France., Defosse T; Cellule Recherche et Innovation, Groupe LDC, Sablé sur Sarthe, France., Chaillou S; INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Université Paris-Saclay, 78350, Jouy-en-Josas, France.
Publikováno v: Data in brief [Data Brief] 2020 Mar 20; Vol. 30, pp. 105453. Date of Electronic Publication: 2020 Mar 20 (Print Publication: 2020).
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Reducing Salt in Raw Pork Sausages Increases Spoilage and Correlates with Reduced Bacterial Diversity.
Autor: Fougy L; Micalis Institute, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France.; Aérial, Parc d'Innovation, Illkirch, France., Desmonts MH; Aérial, Parc d'Innovation, Illkirch, France., Coeuret G; Micalis Institute, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Fassel C; Aérial, Parc d'Innovation, Illkirch, France., Hamon E; Aérial, Parc d'Innovation, Illkirch, France., Hézard B; Aérial, Parc d'Innovation, Illkirch, France., Champomier-Vergès MC; Micalis Institute, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France., Chaillou S; Micalis Institute, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, France stephane.chaillou@jouy.inra.fr.
Publikováno v: Applied and environmental microbiology [Appl Environ Microbiol] 2016 Jun 13; Vol. 82 (13), pp. 3928-3939. Date of Electronic Publication: 2016 Jun 13 (Print Publication: 2016).
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Origin and ecological selection of core and food-specific bacterial communities associated with meat and seafood spoilage.
Autor: Chaillou S; 1] INRA, UMR1319 Micalis, Lactic Acid Bacteria & Meat Microbial Ecosystems Laboratory, Paris, France [2] AgroParisTech, UMR Micalis, Paris, France., Chaulot-Talmon A; 1] INRA, UMR1319 Micalis, Lactic Acid Bacteria & Meat Microbial Ecosystems Laboratory, Paris, France [2] AgroParisTech, UMR Micalis, Paris, France., Caekebeke H; Plate-Forme d'Innovations Nouvelles Vagues, Boulogne-sur-mer, France., Cardinal M; Ifremer, Nantes, France., Christieans S; ADIV, Clermont-Ferrand, France., Denis C; ACTALIA, Villers Bocage, France., Desmonts MH; Aérial, Strasbourg, France., Dousset X; 1] INRA, UMR1014 Secalim, Nantes, France [2] LUNAM Université, Oniris, Nantes, France., Feurer C; IFIP, Paris, France., Hamon E; Aérial, Strasbourg, France., Joffraud JJ; Ifremer, Nantes, France., La Carbona S; ACTALIA, Villers Bocage, France., Leroi F; Ifremer, Nantes, France., Leroy S; INRA, UR454 Microbiologie, Saint-Genès-Champanelle, France., Lorre S; Biocéane, Nantes, France., Macé S; 1] INRA, UMR1014 Secalim, Nantes, France [2] LUNAM Université, Oniris, Nantes, France., Pilet MF; 1] INRA, UMR1014 Secalim, Nantes, France [2] LUNAM Université, Oniris, Nantes, France., Prévost H; 1] INRA, UMR1014 Secalim, Nantes, France [2] LUNAM Université, Oniris, Nantes, France., Rivollier M; ADIV, Clermont-Ferrand, France., Roux D; Plate-Forme d'Innovations Nouvelles Vagues, Boulogne-sur-mer, France., Talon R; INRA, UR454 Microbiologie, Saint-Genès-Champanelle, France., Zagorec M; 1] INRA, UMR1014 Secalim, Nantes, France [2] LUNAM Université, Oniris, Nantes, France., Champomier-Vergès MC; 1] INRA, UMR1319 Micalis, Lactic Acid Bacteria & Meat Microbial Ecosystems Laboratory, Paris, France [2] AgroParisTech, UMR Micalis, Paris, France.
Publikováno v: The ISME journal [ISME J] 2015 May; Vol. 9 (5), pp. 1105-18. Date of Electronic Publication: 2014 Oct 21.
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Effect of ball-milling and Fe-/Al-doping on the structural aspect and visible light photocatalytic activity of TiO2 towards Escherichia coli bacteria abatement.
Autor: Schlur L; Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg IPCMS, UMR 7504, CNRS-ECPM-Université de Strasbourg, 23 rue du loess BP 43 67034 Strasbourg cedex 2, France., Begin-Colin S; Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg IPCMS, UMR 7504, CNRS-ECPM-Université de Strasbourg, 23 rue du loess BP 43 67034 Strasbourg cedex 2, France., Gilliot P; Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg IPCMS, UMR 7504, CNRS-ECPM-Université de Strasbourg, 23 rue du loess BP 43 67034 Strasbourg cedex 2, France., Gallart M; Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg IPCMS, UMR 7504, CNRS-ECPM-Université de Strasbourg, 23 rue du loess BP 43 67034 Strasbourg cedex 2, France., Carré G; Institut de Chimie et Procédés pour l'Énergie, l'Environnement et la Santé (ICPEES), CNRS, Université de Strasbourg, 25 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France; Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie, UMR 7213, CNRS-Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, CS 60024, 67401 Illkirch Cedex, France., Zafeiratos S; Institut de Chimie et Procédés pour l'Énergie, l'Environnement et la Santé (ICPEES), CNRS, Université de Strasbourg, 25 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France., Keller N; Institut de Chimie et Procédés pour l'Énergie, l'Environnement et la Santé (ICPEES), CNRS, Université de Strasbourg, 25 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France., Keller V; Institut de Chimie et Procédés pour l'Énergie, l'Environnement et la Santé (ICPEES), CNRS, Université de Strasbourg, 25 rue Becquerel, 67087 Strasbourg, France., André P; Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie, UMR 7213, CNRS-Université de Strasbourg, 74 route du Rhin, CS 60024, 67401 Illkirch Cedex, France., Greneche JM; LUNAM, Université du Maine, Institut des Molécules et Matériaux du Mans IMMM, UMR, CNRS 6283, 72085 Le Mans Cedex 9, France., Hezard B; Aérial, Parc d'Innovation, rue Laurent Fries, F-67412 Illkirch, France., Desmonts MH; Aérial, Parc d'Innovation, rue Laurent Fries, F-67412 Illkirch, France., Pourroy G; Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg IPCMS, UMR 7504, CNRS-ECPM-Université de Strasbourg, 23 rue du loess BP 43 67034 Strasbourg cedex 2, France. Electronic address: pourroy@ipcms.unistra.fr.
Publikováno v: Materials science & engineering. C, Materials for biological applications [Mater Sci Eng C Mater Biol Appl] 2014 May 01; Vol. 38, pp. 11-9. Date of Electronic Publication: 2014 Jan 22.
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