Zobrazeno 1 - 10 of 3 808 pro vyhledávání: '"Deconvolution software"'
1
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
2
Report
cellanneal: A User-Friendly Deconvolution Software for Omics Data
Autor: Buchauer, Lisa, Itzkovitz, Shalev
We introduce cellanneal, a python-based software for deconvolving bulk RNA sequencing data. cellanneal relies on the optimization of Spearman's rank correlation coefficient between experimental and computational mixture gene expression vectors using
Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/2110.08209
Zobrazit plný text záznamu
3
Akademický článek
Guidelines for cell-type heterogeneity quantification based on a comparative analysis of reference-free DNA methylation deconvolution software
Autor: Clémentine Decamps, Florian Privé, Raphael Bacher, Daniel Jost, Arthur Waguet, HADACA consortium, Eugene Andres Houseman, Eugene Lurie, Pavlo Lutsik, Aleksandar Milosavljevic, Michael Scherer, Michael G. B. Blum, Magali Richard
Publikováno v: BMC Bioinformatics, Vol 21, Iss 1, Pp 1-15 (2020)
Abstract Background Cell-type heterogeneity of tumors is a key factor in tumor progression and response to chemotherapy. Tumor cell-type heterogeneity, defined as the proportion of the various cell-types in a tumor, can be inferred from DNA methylati
Externí odkaz: https://doaj.org/article/33510f0e09a647fc969cdf1e7068af53
Zobrazit plný text záznamu
4
Akademický článek
Guidelines for cell-type heterogeneity quantification based on a comparative analysis of reference-free DNA methylation deconvolution software.
Autor: Decamps, Clémentine1 (AUTHOR), Privé, Florian1 (AUTHOR), Bacher, Raphael1 (AUTHOR), Jost, Daniel1 (AUTHOR), Waguet, Arthur1 (AUTHOR), HADACA consortium (AUTHOR), Achard, Sophie (AUTHOR), Amblard, Elise (AUTHOR), Bergmann, Fabian (AUTHOR), Blum, Michael (AUTHOR), Blum, Yuna (AUTHOR), Bottaz-Bosson, Guillaume (AUTHOR), Broseus, Lucile (AUTHOR), Chuffart, Florent (AUTHOR), Devijver, Emilie (AUTHOR), Durif, Ghislain (AUTHOR), Feofanov, Vassili (AUTHOR), Houseman, Eugene Andres2 (AUTHOR), Gallopin, Melina (AUTHOR), Jedynak, Paulina (AUTHOR)
Publikováno v: BMC Bioinformatics. 1/13/2020, Vol. 21 Issue 1, p1-15. 15p. 1 Diagram, 7 Graphs.
Zobrazit plný text záznamu
5
Akademický článek
An open-source deconvolution software package for 3-D quantitative fluorescence microscopy imaging.
Autor: SUN, Y.1 michael-mackey@uiowa.edu, DAVIS, P.1, KOSMACEK, E. A.1, IANZINI, F.1,2,3, MACKEY, M. A.1,2 michael-mackey@uiowa.edu
Publikováno v: Journal of Microscopy. Dec2009, Vol. 236 Issue 3, p180-193. 14p.
Zobrazit plný text záznamu
6
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
7
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
9
MOESM2 of Guidelines for cell-type heterogeneity quantification based on a comparative analysis of reference-free DNA methylation deconvolution software
Autor: Decamps, Clémentine, Privé, Florian, Bacher, Raphael, Jost, Daniel, Waguet, Arthur, Houseman, Eugene, Lurie, Eugene, Lutsik, Pavlo, Milosavljevic, Aleksandar, Scherer, Michael, Blum, Michael, Richard, Magali
Additional file 2: Table S1. Number of remaining probes in Fig. 3. Table S2. Number of remaining probes in Additional file 1: Figure S8. Table S3. Mean execution time in Fig. 7 (minutes). Table S4. Table of cells used for simulations. Table S5. Infor
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::5fd2d3fa9f2d65740728b200dfc0b30d
Zobrazit plný text záznamu
10
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Vyhledávací nástroje:

Upřesnit hledání

Omezení vyhledávání
Plný text Recenzováno Digitální knihovna AV ČR
Zdroje