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Autor:
Torsten Houwaart, Stephan Scholz, Nicholas R. Pollock, William H. Palmer, Katherine M. Kichula, Daniel Strelow, Duyen B. Le, Dana Belick, Lisanna Hülse, Tobias Lautwein, Thorsten Wachtmeister, Tassilo E. Wollenweber, Birgit Henrich, Karl Köhrer, Peter Parham, Lisbeth A. Guethlein, Paul J. Norman, Alexander T. Dilthey
Publikováno v:
HLA.
Autor:
Torsten, Houwaart, Samir, Belhaj, Emran, Tawalbeh, Dirk, Nagels, Yara, Fröhlich, Patrick, Finzer, Pilar, Ciruela, Aurora, Sabrià, Mercè, Herrero, Cristina, Andrés, Andrés, Antón, Assia, Benmoumene, Dounia, Asskali, Hussein, Haidar, Janina, von Dahlen, Jessica, Nicolai, Mygg, Stiller, Jacqueline, Blum, Christian, Lange, Carla, Adelmann, Britta, Schroer, Ute, Osmers, Christiane, Grice, Phillipp P, Kirfel, Hassan, Jomaa, Daniel, Strelow, Lisanna, Hülse, Moritz, Pigulla, Pascal, Kreuzer, Alona, Tyshaieva, Jonas, Weber, Tobias, Wienemann, Malte, Kohns Vasconcelos, Katrin, Hoffmann, Nadine, Lübke, Sandra, Hauka, Marcel, Andree, Claus Jürgen, Scholz, Nathalie, Jazmati, Klaus, Göbels, Rainer, Zotz, Klaus, Pfeffer, Jörg, Timm, Lutz, Ehlkes, Andreas, Walker, Alexander T, Dilthey, John, Ziebuhr
Publikováno v:
Scientia
Background Tracking person-to-person SARS-CoV-2 transmission in the population is important to understand the epidemiology of community transmission and may contribute to the containment of SARS-CoV-2. Neither contact tracing nor genomic surveillance
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::ba7fed7b55ba7e4d7f760617b8722d2d
https://hdl.handle.net/11351/8539
https://hdl.handle.net/11351/8539
Autor:
Jessica Nicolai, Alona Tyshaieva, Marcel Andree, Klaus Pfeffer, Maximilian Damagnez, Lisanna Hülse, Lutz Ehlkes, Nadine Lübke, Patrick Finzer, Malte Kohns Vasconcelos, Klaus Göbels, Alexander Thielen, Teresa Tamayo, Rainer Zotz, Susanne Kolbe-Busch, Ashley Duplessis, Martin Däumer, Sandra Hauka, Tobias Wienemann, Jörg Timm, Katrin Hoffmann, Alexander T Dilthey, Daniel Strelow, Torsten Houwaart, Andreas Walker
Publikováno v:
Clinical Infectious Diseases: An Official Publication of the Infectious Diseases Society of America
Background Tracing of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) transmission chains is still a major challenge for public health authorities, when incidental contacts are not recalled or are not perceived as potential risk contacts
Autor:
Torsten Houwaart, Stephan Scholz, Nicholas R Pollock, William H. Palmer, Katherine M. Kichula, Daniel Strelow, Duyen B Le, Dana Belick, Tobias Lautwein, Thorsten Wachtmeister, Birgit Henrich, Karl Köhrer, Peter Parham, Lisbeth A Guethlein, Paul J Norman, Alexander T Dilthey
Accurate and comprehensive immunogenetic reference panels are key to the successful implementation of population-scale immunogenomics. The 5Mbp Major Histocompatibility Complex (MHC) is the most polymorphic region of the human genome and associated w
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::b949c057de0bd12e8182828f96d650cf
https://doi.org/10.1101/2022.04.28.489875
https://doi.org/10.1101/2022.04.28.489875
Publikováno v:
Systematics and Biodiversity. 18:228-236
About a thousand described species of Myxomycetes, colloquially named slime moulds, are present in most terrestrial habitats. Molecular environmental sampling has revealed that a significant proportion of sequences could not be assigned to known spec
Autor:
Emran Tawalbeh, Christian M. Lange, German Covid Omics Initiative, Ute Osmers, Alona Tyshaieva, Marcel Andree, Sandra Hauka, Samir Belhaj, Pascal Kreuzer, Nadine Lübke, Jacqueline Blum, Jörg Timm, Klaus Göbels, Tobias Wienemann, Andreas Walker, Janina K. von Dahlen, Phillipp P. Kirfel, Klaus Pfeffer, Claus Jürgen Scholz, Jonas F Weber, Carla Adelmann, Christiane Grice, Katrin Hoffmann, Dounia Asskali, Dirk Nagels, Alexander T. Dilthey, Torsten Houwaart, Rainer Zotz, Daniel Strelow, Lisanna Hülse, Yara Fröhlich, Moritz Pigulla, Malte Kohns Vasconcelos, Jessica Nicolai, Lisa Stiller, Hassan Jomaa, Hussein Haidar, Nathalie Jazmati, Lutz Ehlkes, Britta Schroer, Assia Benmoumene, Patrick Finzer
Integration of genomic surveillance with contact tracing provides a powerful tool for the reconstruction of person-to-person pathogen transmission chains. We report two large clusters of SARS-CoV-2 cases (“Delta” clade, 110 cases combined) detect
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::6b27f8c1b2a131b66b1048308489431d
https://doi.org/10.1101/2021.10.18.21264530
https://doi.org/10.1101/2021.10.18.21264530
Autor:
Sandra Hauka, Jörg Timm, Ashley Duplessis, Martin Däumer, Susanne Kolbe-Busch, Nadine Lübke, Jessica Nicolai, Torsten Houwaart, Teresa Tamayo, Rainer Zotz, Malte Kohns Vasconcelos, Alexander Thielen, Lutz Ehlkes, Andreas Walker, Alexander T Dilthey, Lisanna Hülse, Daniel Strelow, Katrin Hoffmann, Klaus Pfeffer, Marcel Andree, Patrick Finzer, Maximilian Damagnez, Klaus Göbels, Tobias Wienemann, German Covid Omics Initiative, Alona Tyshaieva
Viral genome sequencing can address key questions about SARS-CoV-2 evolution and viral transmission. Here, we present an integrated system of genomic surveillance in the German city of Düsseldorf, combining a) viral surveillance sequencing, b) genet
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::a4f0d5058302ea97c1bf23b06924edcb
https://doi.org/10.1101/2021.02.13.21251678
https://doi.org/10.1101/2021.02.13.21251678
Autor:
Sandra Hauka, Jörg Timm, Malte Kohns Vasconcelos, Lisanna Hülse, Detlef Kindgen-Milles, Tobias Wienemann, Verena Keitel, Klaus Pfeffer, Andreas Walker, Björn Jensen, Tina Senff, Ortwin Adams, Torsten Feldt, Daniel Strelow, Alexander T. Dilthey, Torsten Houwaart, Marcel Andree
Publikováno v:
Eurosurveillance
We whole-genome sequenced 55 SARS-CoV-2 isolates from Germany to investigate SARS-CoV-2 outbreaks in 2020 in the Heinsberg district and Düsseldorf. While the genetic structure of the Heinsberg outbreak indicates a clonal origin, reflecting superspre
Autor:
Alexander T. Dilthey, Torsten Houwaart, Tobias Wienemann, Daniel Strelow, Verena Keitel, Malte Kohns Vasconcelos, Klaus Pfeffer, Lisanna Hülse, Marcel Andree, Sandra Hauka, Tina Senff, Jörg Timm, Torsten Feldt, Detlef Kindgen-Milles, Ortwin Adams, Andreas Walker, Björn-Erik Ole Jensen
We whole-genome sequenced 55 SARS-CoV-2 isolates from Western Germany and investigated the genetic structure of SARS-CoV-2 outbreaks in the Heinsberg district and Düsseldorf. While the genetic structure of the Heinsberg outbreak indicates a clonal o
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::2711ec26e16887d921f4d053c41fe730
Autor:
Alm E., Broberg E.K., Connor T., Hodcroft E.B., Komissarov A.B., Maurer-Stroh S., Melidou A., Neher R.A., O'Toole A., Pereyaslov D., Beerenwinkel N., Posada-Cespedes S., Jablonski K.P., Ferreira P.F., Topolsky I., Avsic-Zupanc T., Korva M., Poljak M., Zakotnik S., Zorec T.M., Bragstad K., Hungnes O., Stene-Johansen K., Reusken C., Meijer A., Vennema H., Ruiz-Roldan L., Bracho M.A., Garcia-Gonzalez N., Chiner-Oms A., Cancino-Munoz I., Comas I., Goig G.A., Torres-Puente M., Lopez M.G., Martinez-Priego L., D'Auria G., Ruiz-Hueso P., Ferrus-Abad L., de Marco G., Galan-Vendrell I., Carbo-Ramirez S., Ruiz-Rodriguez P., Coscolla M., Polackova K., Kramna L., Cinek O., Richter J., Krashias G., Tryfonos C., Bashiardes S., Koptides D., Christodoulou C., Bartolini B., Gruber C.E., Di Caro A., Castilletti C., Stefani F., Rimoldi S.G., Romeri F., Salerno F., Polesello S., Nagy A., Jirincova H., Vecerova J., Novakova L., Cordey S., Murtskhvaladze M., Kotaria N., Schar T., Beisel C., Vugrek O., Rokic F., Trgovec-Greif L., Jurak I., Rukavina T., Sucic N., Schonning K., Karst S.M., Kirkegaard R.H., Michaelsen T.Y., Sorensen E.A., Knutson S., Brandt J., Le-Quy V., Sorensen T., Petersen C., Pedersen M.S., Larsen S.L., Skov M.N., Rasmussen M., Fonager J., Fomsgaard A., Maksyutov R.A., Gavrilova E.V., Pyankov O.V., Bodnev S.A., Tregubchak T.V., Shvalov A.N., Antonets D.V., Resende P.C., Goya S., Perrin A., Lee R.T., Yadahalli S., Han A.X., Russell C.A., Schmutz S., Zaheri M., Kufner V., Huber M., Trkola A., Antwerpen M., Walter M.C., van der Werf S., Gambaro F., Behillil S., Enouf V., Donati F., Ustinova M., Rovite V., Klovins J., Savicka O., Wienecke-Baldacchino A.K., Ragimbeau C., Fournier G., Mossong J., Aberle S.W., Haukland M., Enkirch T., Advani A., Karlberg M.L., Lindsjo O.K., Broddesson S., Slavikova M., Lickova M., Klempa B., Staronova E., Ticha E., Szemes T., Rusnakova D., Stadler T., Quer J., Anton A., Andres C., Pinana M., Garcia-Cehic D., Pumarola T., Izopet J., Gioula G., Exindari M., Papa A., Chatzidimitriou D., Metallidis S., Pappa S., Macek M., Geryk J., Broz P., Briksi A., Hubacek P., Drevinek P., Zajac M., Kvapil P., Holub M., Kvapilova K., Novotny A., Kasny M., Klempt P., Vapalahti O., Smura T., Sironen T., Selhorst P., Anthony C., Arien K., Simon-Loriere E., Rabalski L., Bienkowska-Szewczyk K., Borges V., Isidro J., Gomes J.P., Guiomar R., Pechirra P., Costa I., Duarte S., Vieira L., Pyrc K., Zuckerman N.S., Turdikulova S., Abdullaev A., Dalimova D., Abdurakhimov A., Tagliabracci A., Alessandrini F., Melchionda F., Onofri V., Turchi C., Bagnarelli P., Menzo S., Caucci S., Di Sante L., Popa A., Genger J.-W., Agerer B., Lercher A., Endler L., Smyth M., Penz T., Schuster M., Senekowitsch M., Laine J., Bock C., Bergthaler A., Shevtsov A., Kalendar R., Ramanculov Y., Graf A., Muenchhoff M., Keppler O.T., Krebs S., Blum H., Marcello A., Licastro D., D'Agaro P., Laubscher F., Vidanovic D., Tesovic B., Volkening J., Clementi N., Mancini N., Rupnik M., Mahnic A., Walker A., Houwaart T., Wienemann T., Vasconcelos M.K., Strelow D., Jensen B.-E.O., Senff T., Hulse L., Adams O., Andree M., Hauka S., Feldt T., Keitel V., Kindgen-Milles D., Timm J., Pfeffer K., Dilthey A.T., Moore C., Ozdarendeli A., Pavel S.T.I., Yetiskin H., Aydin G., Holyavkin C., Uygut M.A., Cevik C., Shchetinin A., Gushchin V., Dinler-Doganay G., Doganay L., Kizilboga-Akgun T., Karacan I., Pancer K., Maes P., Marti-Carreras J., Wawina-Bokalanga T., Vanmechelen B., Thurmer A., Wedde M., Durrwald R., von Kleist M., Drechsel O., Wolff T., Fuchs S., Kmiecinski R., Michel J., Nitsche A., Casas I., Caballero M.I., Zaballos A., Jimenez P., Jimenez M., Fernandez S.M., Fernandez S.V., de la Plaza I.C., Fadeev A., Ivanova A., Sergeeva M., Stefanelli P., Estee Torok M., Hall G., da Silva Filipe A., Turtle L., Afifi S., McCluggage K., Beer R., Ledesma J., Maksimovic J., Spellman K., Hamilton W.L., Marchbank A., Southgate J.A., Underwood A., Taylor B., Yeats C., Abudahab K., Gemmell M.R., Eccles R., Lucaci A., Nelson C.A., Rainbow L., Whitehead M., Gregory R., Haldenby S., Paterson S., Hughes M.A., Curran M.D., Baker D., Tucker R., Green L.R., Feltwell T., Halstead F.D., Wyles M., Jahun A.S., Ahmad S.S.Y., Georgana I., Goodfellow I., Yakovleva A., Meredith L.W., Gavriil A., Awan A.R., Fisher C., Edgeworth J., Lynch J., Moore N., Williams R., Kidd S.P., Cortes N., Brunker K., McCrone J.T., Quick J., Duckworth N., Walsh S., Sloan T., Ludden C., George R.P., Eltringham G., Brown J.R., Aranday-Cortes E., Shepherd J.G., Hughes J., Li K.K., Williams T.C., Johnson N., Jesudason N., Mair D., Thomson E., Shah R., Parr Y.A., Carmichael S., Robertson D.L., Nomikou K., Broos A., Niebel M., Smollett K., Tong L., Miah S., Wittner A., Phillips N., Payne B., Dewar R., Holmes A., Bolt F., Price J.R., Mookerjee S., Sethi D.K., Potter W., Stanley R., Prakash R., Dervisevic S., Graham J.C., Nelson A., Smith D., Young G.R., Yew W.C., Todd J.A., Trebes A., Andersson M., Bull M., Watkins J., Birchley A., Gatica-Wilcox B., Gilbert L., Kumziene-Summerhayes S., Rey S., Chauhan A., Butcher E., Bicknell K., Elliott S., Glaysher S., Lackenby A., Bibby D., Platt S., Mohamed H., Machin N.W., Mbisa J.L., Evans J., Perry M., Pacchiarini N., Corden S., Adams A.G., Gaskin A., Coombs J., Graham L.J., Cottrell S., Morgan M., Gifford L., Kolyva A., Rudder S.J., Trotter A.J., Mather A.E., Aydin A., Page A.J., Kay G.L., de Oliveira Martins L., Yasir M., Alikhan N.-F., Thomson N.M., Gilroy R., Kingsley R.A., O'Grady J., Gutierrez A.V., Diaz M., Viet T.L., Tedim A.P., Adriaenssens E.M., Patrick Mcclure C., Sang F., Clark G., Howson-Wells H.C., Debebe J., Ball J., Chappell J., Khakh M., Carlile M., Loose M., Lister M.M., Holmes N., Tsoleridis T., Fleming V.M., Wright V., Smith W., Gallagher M.D., Parker M., Partridge D.G., Evans C., Baker P., Essex S., Liggett S., Keeley A.J., Bashton M., Rooke S., Dervisavic S., Meader E.J., Lopez C.E.B., Angyal A., Kristiansen M., Tutill H.J., Findlay J., Mestek-Boukhibar L., Forrest L., Dyal P., Williams R.J., Panchbhaya Y., Williams C.A., Roy S., Pandey S., Stockton J., Loman N.J., Poplawski R., Nicholls S., Rowe W.P.M., Khokhar F., Pinckert M.L., Hosmillo M., Chaudhry Y., Caller L.G., Davidson R.K., Griffith L., Rambaut A., Jackson B., Colquhoun R., Hill V., Nichols J., Asamaphan P., Darby A., Jackson K.A., Iturriza-Gomara M., Vamos E.E., Green A., Aanensen D., Bonsall D., Buck D., Macintyre-Cockett G., de Cesare M., Pybus O., Golubchik T., Scarlett G., Loveson K.F., Robson S.C., Beckett A., Lindsey B., Groves D.C., Parsons P.J., McHugh M.P., Barnes J.D., Manso C.F., Grammatopoulos D., Menger K.E., Harrison E., Gunson R., Peacock S.J., Gonzalez G., Carr M., Mihaela L., Popovici O., Brytting M., Bresner C., Fuller W., Workman T., Mentis A.F., Kossyvakis A., Karamitros T., Pogka V., Kalliaropoulos A., Horefti E., Kontou A., Martinez-Gonzalez B., Labropoulou V., Voulgari-Kokota A., Evangelidou M., Bizta P., Belimezi M., Lambrechts L., Doymaz M.Z., Yazici M.K., Cetin N.S., Karaaslan E., Kallio-Kokko H., Virtanen J., Suvanto M., Nguyen P.T., Ellonen P., Hannula S., Kangas H., Sreenu V.B., Burian K., Terhes G., Gombos K., Gyenesei A., Urban P., Herczeg R., Jakab F., Kemenesi G., Toth G.E., Somogyi B., Zana B., Zeghbib S., Kuczmog A., Foldes F., Lanszki Z., Madai M., Papp H., Pereszlenyi C.I., Babinszky G.C., Dudas G., Csoma E., Abou Tayoun A.N., Alsheikh-Ali A.A., Loney T., Nowotny N., Abdul-Wahab O., Gonzalez-Candelas F., Andersen M.H., Taylor S.
Publikováno v:
Alm, Erik Broberg, Eeva K. Connor, Thomas Hodcroft, Emma Komissarov, Andrey B. Maurer-Stroh, Sebastian Melidou, Angeliki Neher, Richard O'Toole, Áine Pereyaslov, Dmitriy Beerenwinkel, Niko Posada-Céspedes, Susana Philipp. Kim Jablonski Falé Ferreira, Pedro Topolsky, Iván Nowotny, Norbert Abdul-Wahab, Osama González Candelas, Fernando Andersen, Martín H Taylor, Sarah 2020 Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 Eurosurveillance 25 32 1 8
RODERIC. Repositorio Institucional de la Universitat de Valéncia
instname
Euro surveillance, 25(32):2001410. Centre Europeen pour la Surveillance Epidemiologique du SIDA
Eurosurveillance
Eurosurveillance : European communicable disease bulletin
Alm, E, Broberg, E K, Connor, T, Hodcroft, E B, Komissarov, A B, Maurer-Stroh, S, Melidou, A, Neher, R A, O’Toole, Á, Pereyaslov, D & The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group 2020, ' Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 ', Eurosurveillance, vol. 25, no. 32, 2001410 . https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
RODERIC: Repositorio Institucional de la Universitat de Valéncia
Eurosurveillance, 25 (32)
Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin
Eurosurveillance, 2020, 25 (32), pp.2001410. ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410⟩
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2020, 25 (32), pp.2001410. ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410⟩
Euro surveillance 25 (2020): 2001410. doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
info:cnr-pdr/source/autori:Alm E.; Broberg E.K.; Connor T.; Hodcroft E.B.; Komissarov A.B.; Maurer-Stroh S.; Melidou A.; Neher R.A.; O'Toole A.; Pereyaslov D.; Beerenwinkel N.; Posada-Cespedes S.; Jablonski K.P.; Ferreira P.F.; Topolsky I.; Avsic-Zupanc T.; Korva M.; Poljak M.; Zakotnik S.; Zorec T.M.; Bragstad K.; Hungnes O.; Stene-Johansen K.; Reusken C.; Meijer A.; Vennema H.; Ruiz-Roldan L.; Bracho M.A.; Garcia-Gonzalez N.; Chiner-Oms A.; Cancino-Munoz I.; Comas I.; Goig G.A.; Torres-Puente M.; Lopez M.G.; Martinez-Priego L.; D'Auria G.; Ruiz-Hueso P.; Ferrus-Abad L.; de Marco G.; Galan-Vendrell I.; Carbo-Ramirez S.; Ruiz-Rodriguez P.; Coscolla M.; Polackova K.; Kramna L.; Cinek O.; Richter J.; Krashias G.; Tryfonos C.; Bashiardes S.; Koptides D.; Christodoulou C.; Bartolini B.; Gruber C.E.; Di Caro A.; Castilletti C.; Stefani F.; Rimoldi S.G.; Romeri F.; Salerno F.; Polesello S.; Nagy A.; Jirincova H.; Vecerova J.; Novakova L.; Cordey S.; Murtskhvaladze M.; Kotaria N.; Schar T.; Beisel C.; Vugrek O.; Rokic F.; Trgovec-Greif L.; Jurak I.; Rukavina T.; Sucic N.; Schonning K.; Karst S.M.; Kirkegaard R.H.; Michaelsen T.Y.; Sorensen E.A.; Knutson S.; Brandt J.; Le-Quy V.; Sorensen T.; Petersen C.; Pedersen M.S.; Larsen S.L.; Skov M.N.; Rasmussen M.; Fonager J.; Fomsgaard A.; Maksyutov R.A.; Gavrilova E.V.; Pyankov O.V.; Bodnev S.A.; Tregubchak T.V.; Shvalov A.N.; Antonets D.V.; Resende P.C.; Goya S.; Perrin A.; Lee R.T.; Yadahalli S.; Han A.X.; Russell C.A.; Schmutz S.; Zaheri M.; Kufner V.; Huber M.; Trkola A.; Antwerpen M.; Walter M.C.; van der Werf S.; Gambaro F.; Behillil S.; Enouf V.; Donati F.; Ustinova M.; Rovite V.; Klovins J.; Savicka O.; Wienecke-Baldacchino A.K.; Ragimbeau C.; Fournier G.; Mossong J.; Aberle S.W.; Haukland M.; Enkirch T.; Advani A.; Karlberg M.L.; Lindsjo O.K.; Broddesson S.; Slavikova M.; Lickova M.; Klempa B.; Staronova E.; Ticha E.; Szemes T.; Rusnakova D.; Stadler T.; Quer J.; Anton A.; Andres C.; Pinana M.; Garcia-Cehic D.; Pumarola T.; Izopet J.; Gioula G.; Exindari M.; Papa A.; Chatzidimitriou D.; Metallidis S.; Pappa S.; Macek M.; Geryk J.; Broz P.; Briksi A.; Hubacek P.; Drevinek P.; Zajac M.; Kvapil P.; Holub M.; Kvapilova K.; Novotny A.; Kasny M.; Klempt P.; Vapalahti O.; Smura T.; Sironen T.; Selhorst P.; Anthony C.; Arien K.; Simon-Loriere E.; Rabalski L.; Bienkowska-Szewczyk K.; Borges V.; Isidro J.; Gomes J.P.; Guiomar R.; Pechirra P.; Costa I.; Duarte S.; Vieira L.; Pyrc K.; Zuckerman N.S.; Turdikulova S.; Abdullaev A.; Dalimova D.; Abdurakhimov A.; Tagliabracci A.; Alessandrini F.; Melchionda F.; Onofri V.; Turchi C.; Bagnarelli P.; Menzo S.; Caucci S.; Di Sante L.; Popa A.; Genger J.-W.; Agerer B.; Lercher A.; Endler L.; Smyth M.; Penz T.; Schuster M.; Senekowitsch M.; Laine J.; Bock C.; Bergthaler A.; Shevtsov A.; Kalendar R.; Ramanculov Y.; Graf A.; Muenchhoff M.; Keppler O.T.; Krebs S.; Blum H.; Marcello A.; Licastro D.; D'Agaro P.; Laubscher F.; Vidanovic D.; Tesovic B.; Volkening J.; Clementi N.; Mancini N.; Rupnik M.; Mahnic A.; Walker A.; Houwaart T.; Wienemann T.; Vasconcelos M.K.; Strelow D.; Jensen B.-E.O.; Senff T.; Hulse L.; Adams O.; Andree M.; Hauka S.; Feldt T.; Keitel V.; Kindgen-Milles D.; Timm J.; Pfeffer K.; Dilthey A.T.; Moore C.; Ozdarendeli A.; Pavel S.T.I.; Yetiskin H.; Aydin G.; Holyavkin C.; Uygut M.A.; Cevik C.; Shchetinin A.; Gushchin V.; Dinler-Doganay G.; Doganay L.; Kizilboga-Akgun T.; Karacan I.; Pancer K.; Maes P.; Marti-Carreras J.; Wawina-Bokalanga T.; Vanmechelen B.; Thurmer A.; Wedde M.; Durrwald R.; von Kleist M.; Drechsel O.; Wolff T.; Fuchs S.; Kmiecinski R.; Michel J.; Nitsche A.; Casas I.; Caballero M.I.; Zaballos A.; Jimenez P.; Jimenez M.; Fernandez S.M.; Fernandez S.V.; de la Plaza I.C.; Fadeev A.; Ivanova A.; Sergeeva M.; Stefanelli P.; Estee Torok M.; Hall G.; da Silva Filipe A.; Turtle L.; Afifi S.; McCluggage K.; Beer R.; Ledesma J.; Maksimovic J.; Spellman K.; Hamilton W.L.; Marchbank A.; Southgate J.A.; Underwood A.; Taylor B.; Yeats C.; Abudahab K.; Gemmell M.R.; Eccles R.; Lucaci A.; Nelson C.A.; Rainbow L.; Whitehead M.; Gregory R.; Haldenby S.; Paterson S.; Hughes M.A.; Curran M.D.; Baker D.; Tucker R.; Green L.R.; Feltwell T.; Halstead F.D.; Wyles M.; Jahun A.S.; Ahmad S.S.Y.; Georgana I.; Goodfellow I.; Yakovleva A.; Meredith L.W.; Gavriil A.; Awan A.R.; Fisher C.; Edgeworth J.; Lynch J.; Moore N.; Williams R.; Kidd S.P.; Cortes N.; Brunker K.; McCrone J.T.; Quick J.; Duckworth N.; Walsh S.; Sloan T.; Ludden C.; George R.P.; Eltringham G.; Brown J.R.; Aranday-Cortes E.; Shepherd J.G.; Hughes J.; Li K.K.; Williams T.C.; Johnson N.; Jesudason N.; Mair D.; Thomson E.; Shah R.; Parr Y.A.; Carmichael S.; Robertson D.L.; Nomikou K.; Broos A.; Niebel M.; Smollett K.; Tong L.; Miah S.; Wittner A.; Phillips N.; Payne B.; Dewar R.; Holmes A.; Bolt F.; Price J.R.; Mookerjee S.; Sethi D.K.; Potter W.; Stanley R.; Prakash R.; Dervisevic S.; Graham J.C.; Nelson A.; Smith D.; Young G.R.; Yew W.C.; Todd J.A.; Trebes A.; Andersson M.; Bull M.; Watkins J.; Birchley A.; Gatica-Wilcox B.; Gilbert L.; Kumziene-Summerhayes S.; Rey S.; Chauhan A.; Butcher E.; Bicknell K.; Elliott S.; Glaysher S.; Lackenby A.; Bibby D.; Platt S.; Mohamed H.; Machin N.W.; Mbisa J.L.; Evans J.; Perry M.; Pacchiarini N.; Corden S.; Adams A.G.; Gaskin A.; Coombs J.; Graham L.J.; Cottrell S.; Morgan M.; Gifford L.; Kolyva A.; Rudder S.J.; Trotter A.J.; Mather A.E.; Aydin A.; Page A.J.; Kay G.L.; de Oliveira Martins L.; Yasir M.; Alikhan N.-F.; Thomson N.M.; Gilroy R.; Kingsley R.A.; O'Grady J.; Gutierrez A.V.; Diaz M.; Viet T.L.; Tedim A.P.; Adriaenssens E.M.; Patrick Mcclure C.; Moore C.; Sang F.; Clark G.; Howson-Wells H.C.; Debebe J.; Ball J.; Chappell J.; Khakh M.; Carlile M.; Loose M.; Lister M.M.; Holmes N.; Tsoleridis T.; Fleming V.M.; Wright V.; Smith W.; Gallagher M.D.; Parker M.; Partridge D.G.; Evans C.; Baker P.; Essex S.; Liggett S.; Keeley A.J.; Bashton M.; Rooke S.; Dervisavic S.; Meader E.J.; Lopez C.E.B.; Angyal A.; Kristiansen M.; Tutill H.J.; Findlay J.; Mestek-Boukhibar L.; Forrest L.; Dyal P.; Williams R.J.; Panchbhaya Y.; Williams C.A.; Roy S.; Pandey S.; Stockton J.; Loman N.J.; Poplawski R.; Nicholls S.; Rowe W.P.M.; Khokhar F.; Pinckert M.L.; Hosmillo M.; Chaudhry Y.; Caller L.G.; Davidson R.K.; Griffith L.; Rambaut A.; Jackson B.; Colquhoun R.; Hill V.; Nichols J.; Asamaphan P.; Darby A.; Jackson K.A.; Iturriza-Gomara M.; Vamos E.E.; Green A.; Aanensen D.; Bonsall D.; Buck D.; Macintyre-Cockett G.; de Cesare M.; Pybus O.; Golubchik T.; Scarlett G.; Loveson K.F.; Robson S.C.; Beckett A.; Lindsey B.; Groves D.C.; Parsons P.J.; McHugh M.P.; Barnes J.D.; Manso C.F.; Grammatopoulos D.; Menger K.E.; Harrison E.; Gunson R.; Peacock S.J.; Gonzalez G.; Carr M.; Mihaela L.; Popovici O.; Brytting M.; Bresner C.; Fuller W.; Workman T.; Mentis A.F.; Kossyvakis A.; Karamitros T.; Pogka V.; Kalliaropoulos A.; Horefti E.; Kontou A.; Martinez-Gonzalez B.; Labropoulou V.; Voulgari-Kokota A.; Evangelidou M.; Bizta P.; Belimezi M.; Lambrechts L.; Doymaz M.Z.; Yazici M.K.; Cetin N.S.; Karaaslan E.; Kallio-Kokko H.; Virtanen J.; Suvanto M.; Nguyen P.T.; Ellonen P.; Hannula S.; Kangas H.; Sreenu V.B.; Burian K.; Terhes G.; Gombos K.; Gyenesei A.; Urban P.; Herczeg R.; Jakab F.; Kemenesi G.; Toth G.E.; Somogyi B.; Zana B.; Zeghbib S.; Kuczmog A.; Foldes F.; Lanszki Z.; Madai M.; Papp H.; Nagy A.; Pereszlenyi C.I.; Babinszky G.C.; Dudas G.; Csoma E.; Abou Tayoun A.N.; Alsheikh-Ali A.A.; Loney T.; Nowotny N.; Abdul-Wahab O.; Gonzalez-Candelas F.; Andersen M.H.; Taylor S./titolo:Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020/doi:10.2807%2F1560-7917.ES.2020.25.32.2001410/rivista:Euro surveillance/anno:2020/pagina_da:2001410/pagina_a:/intervallo_pagine:2001410/volume:25
The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group, Robson, S, Scarlett, G, Loveson, K & Beckett, A H 2020, ' Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 ', Eurosurveillance, vol. 25, no. 32 . https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
RODERIC. Repositorio Institucional de la Universitat de Valéncia
instname
Euro surveillance, 25(32):2001410. Centre Europeen pour la Surveillance Epidemiologique du SIDA
Eurosurveillance
Eurosurveillance : European communicable disease bulletin
Alm, E, Broberg, E K, Connor, T, Hodcroft, E B, Komissarov, A B, Maurer-Stroh, S, Melidou, A, Neher, R A, O’Toole, Á, Pereyaslov, D & The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group 2020, ' Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 ', Eurosurveillance, vol. 25, no. 32, 2001410 . https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
RODERIC: Repositorio Institucional de la Universitat de Valéncia
Eurosurveillance, 25 (32)
Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin
Eurosurveillance, 2020, 25 (32), pp.2001410. ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410⟩
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2020, 25 (32), pp.2001410. ⟨10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410⟩
Euro surveillance 25 (2020): 2001410. doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
info:cnr-pdr/source/autori:Alm E.; Broberg E.K.; Connor T.; Hodcroft E.B.; Komissarov A.B.; Maurer-Stroh S.; Melidou A.; Neher R.A.; O'Toole A.; Pereyaslov D.; Beerenwinkel N.; Posada-Cespedes S.; Jablonski K.P.; Ferreira P.F.; Topolsky I.; Avsic-Zupanc T.; Korva M.; Poljak M.; Zakotnik S.; Zorec T.M.; Bragstad K.; Hungnes O.; Stene-Johansen K.; Reusken C.; Meijer A.; Vennema H.; Ruiz-Roldan L.; Bracho M.A.; Garcia-Gonzalez N.; Chiner-Oms A.; Cancino-Munoz I.; Comas I.; Goig G.A.; Torres-Puente M.; Lopez M.G.; Martinez-Priego L.; D'Auria G.; Ruiz-Hueso P.; Ferrus-Abad L.; de Marco G.; Galan-Vendrell I.; Carbo-Ramirez S.; Ruiz-Rodriguez P.; Coscolla M.; Polackova K.; Kramna L.; Cinek O.; Richter J.; Krashias G.; Tryfonos C.; Bashiardes S.; Koptides D.; Christodoulou C.; Bartolini B.; Gruber C.E.; Di Caro A.; Castilletti C.; Stefani F.; Rimoldi S.G.; Romeri F.; Salerno F.; Polesello S.; Nagy A.; Jirincova H.; Vecerova J.; Novakova L.; Cordey S.; Murtskhvaladze M.; Kotaria N.; Schar T.; Beisel C.; Vugrek O.; Rokic F.; Trgovec-Greif L.; Jurak I.; Rukavina T.; Sucic N.; Schonning K.; Karst S.M.; Kirkegaard R.H.; Michaelsen T.Y.; Sorensen E.A.; Knutson S.; Brandt J.; Le-Quy V.; Sorensen T.; Petersen C.; Pedersen M.S.; Larsen S.L.; Skov M.N.; Rasmussen M.; Fonager J.; Fomsgaard A.; Maksyutov R.A.; Gavrilova E.V.; Pyankov O.V.; Bodnev S.A.; Tregubchak T.V.; Shvalov A.N.; Antonets D.V.; Resende P.C.; Goya S.; Perrin A.; Lee R.T.; Yadahalli S.; Han A.X.; Russell C.A.; Schmutz S.; Zaheri M.; Kufner V.; Huber M.; Trkola A.; Antwerpen M.; Walter M.C.; van der Werf S.; Gambaro F.; Behillil S.; Enouf V.; Donati F.; Ustinova M.; Rovite V.; Klovins J.; Savicka O.; Wienecke-Baldacchino A.K.; Ragimbeau C.; Fournier G.; Mossong J.; Aberle S.W.; Haukland M.; Enkirch T.; Advani A.; Karlberg M.L.; Lindsjo O.K.; Broddesson S.; Slavikova M.; Lickova M.; Klempa B.; Staronova E.; Ticha E.; Szemes T.; Rusnakova D.; Stadler T.; Quer J.; Anton A.; Andres C.; Pinana M.; Garcia-Cehic D.; Pumarola T.; Izopet J.; 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Birchley A.; Gatica-Wilcox B.; Gilbert L.; Kumziene-Summerhayes S.; Rey S.; Chauhan A.; Butcher E.; Bicknell K.; Elliott S.; Glaysher S.; Lackenby A.; Bibby D.; Platt S.; Mohamed H.; Machin N.W.; Mbisa J.L.; Evans J.; Perry M.; Pacchiarini N.; Corden S.; Adams A.G.; Gaskin A.; Coombs J.; Graham L.J.; Cottrell S.; Morgan M.; Gifford L.; Kolyva A.; Rudder S.J.; Trotter A.J.; Mather A.E.; Aydin A.; Page A.J.; Kay G.L.; de Oliveira Martins L.; Yasir M.; Alikhan N.-F.; Thomson N.M.; Gilroy R.; Kingsley R.A.; O'Grady J.; Gutierrez A.V.; Diaz M.; Viet T.L.; Tedim A.P.; Adriaenssens E.M.; Patrick Mcclure C.; Moore C.; Sang F.; Clark G.; Howson-Wells H.C.; Debebe J.; Ball J.; Chappell J.; Khakh M.; Carlile M.; Loose M.; Lister M.M.; Holmes N.; Tsoleridis T.; Fleming V.M.; Wright V.; Smith W.; Gallagher M.D.; Parker M.; Partridge D.G.; Evans C.; Baker P.; Essex S.; Liggett S.; Keeley A.J.; Bashton M.; Rooke S.; Dervisavic S.; Meader E.J.; Lopez C.E.B.; Angyal A.; Kristiansen M.; Tutill H.J.; Findlay J.; Mestek-Boukhibar L.; Forrest L.; Dyal P.; Williams R.J.; Panchbhaya Y.; Williams C.A.; Roy S.; Pandey S.; Stockton J.; Loman N.J.; Poplawski R.; Nicholls S.; Rowe W.P.M.; Khokhar F.; Pinckert M.L.; Hosmillo M.; Chaudhry Y.; Caller L.G.; Davidson R.K.; Griffith L.; Rambaut A.; Jackson B.; Colquhoun R.; Hill V.; Nichols J.; Asamaphan P.; Darby A.; Jackson K.A.; Iturriza-Gomara M.; Vamos E.E.; Green A.; Aanensen D.; Bonsall D.; Buck D.; Macintyre-Cockett G.; de Cesare M.; Pybus O.; Golubchik T.; Scarlett G.; Loveson K.F.; Robson S.C.; Beckett A.; Lindsey B.; Groves D.C.; Parsons P.J.; McHugh M.P.; Barnes J.D.; Manso C.F.; Grammatopoulos D.; Menger K.E.; Harrison E.; Gunson R.; Peacock S.J.; Gonzalez G.; Carr M.; Mihaela L.; Popovici O.; Brytting M.; Bresner C.; Fuller W.; Workman T.; Mentis A.F.; Kossyvakis A.; Karamitros T.; Pogka V.; Kalliaropoulos A.; Horefti E.; Kontou A.; Martinez-Gonzalez B.; Labropoulou V.; Voulgari-Kokota A.; Evangelidou M.; Bizta P.; Belimezi M.; Lambrechts L.; Doymaz M.Z.; Yazici M.K.; Cetin N.S.; Karaaslan E.; Kallio-Kokko H.; Virtanen J.; Suvanto M.; Nguyen P.T.; Ellonen P.; Hannula S.; Kangas H.; Sreenu V.B.; Burian K.; Terhes G.; Gombos K.; Gyenesei A.; Urban P.; Herczeg R.; Jakab F.; Kemenesi G.; Toth G.E.; Somogyi B.; Zana B.; Zeghbib S.; Kuczmog A.; Foldes F.; Lanszki Z.; Madai M.; Papp H.; Nagy A.; Pereszlenyi C.I.; Babinszky G.C.; Dudas G.; Csoma E.; Abou Tayoun A.N.; Alsheikh-Ali A.A.; Loney T.; Nowotny N.; Abdul-Wahab O.; Gonzalez-Candelas F.; Andersen M.H.; Taylor S./titolo:Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020/doi:10.2807%2F1560-7917.ES.2020.25.32.2001410/rivista:Euro surveillance/anno:2020/pagina_da:2001410/pagina_a:/intervallo_pagine:2001410/volume:25
The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group, Robson, S, Scarlett, G, Loveson, K & Beckett, A H 2020, ' Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 ', Eurosurveillance, vol. 25, no. 32 . https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410
8 páginas, 3 figuras
We show the distribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three genomic nomencl
We show the distribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three genomic nomencl