In silico analysis of non-structural protein 12 sequences from SARS-COV-2 found in Manaus, Amazonas, Brazil, reveals mutations linked to higher transmissibility.

Autor: Zanchi FB; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Unidade Rondônia, Laboratório de Bioinformática e Química Medicinal, Rua da Beira, 7671, 76812-245 Porto Velho, RO, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Fundação Universidade Federal de Rondônia (UNIR), Av. Pres. Dutra, 2965, 76801-058 Porto Velho, RO, Brazil.; Instituto Nacional de Epidemiologia na Amazônia Ocidental - EPIAMO, Rua da Beira, 7401, 76812-245 Porto Velho, RO, Brazil., Ferreira GEM; Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Fundação Universidade Federal de Rondônia (UNIR), Av. Pres. Dutra, 2965, 76801-058 Porto Velho, RO, Brazil.; Fundação Oswaldo Cruz Rondônia/Fiocruz, Laboratório de Epidemiologia Genética, Rua da Beira, 7671, 76812-245 Porto Velho, RO, Brazil., Mariúba LAM; Programa Multi-institucional de Pós-Graduação em Biotecnologia, Universidade Federal do Amazonas (PPGBIOTEC-UFAM), Av. Gen. Rodrigo Octávio Jordão Ramos, 3000, 69067-005 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Universidade Federal do Amazonas (PPGIBA-UFAM), Av. Gen. Rodrigo Octávio Jordão Ramos, 3000, 69067-005 Manaus, AM Brazil.; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365, 21040-360 Rio de Janeiro, RJ, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Glória JC; Programa Multi-institucional de Pós-Graduação em Biotecnologia, Universidade Federal do Amazonas (PPGBIOTEC-UFAM), Av. Gen. Rodrigo Octávio Jordão Ramos, 3000, 69067-005 Manaus, AM, Brazil.; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Nascimento VAD; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365, 21040-360 Rio de Janeiro, RJ, Brazil.; Rede Genômica de Vigilância em Saúde do Estado do Amazonas, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Souza VC; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365, 21040-360 Rio de Janeiro, RJ, Brazil.; Rede Genômica de Vigilância em Saúde do Estado do Amazonas, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Corado ALG; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365, 21040-360 Rio de Janeiro, RJ, Brazil., Nascimento FOD; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Costa ÁKAD; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Duarte DCG; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Silva GAVD; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Mejía MDCC; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Pessoa KP; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Gonçalves LMF; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas, Av. Torquato Tapajós, 4010, 69093-018 Manaus, AM, Brazil., Brandão MJP; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Jesus MS; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil., Silva MSD; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas, Av. Torquato Tapajós, 4010, 69093-018 Manaus, AM, Brazil., Costa CFD; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas, Av. Torquato Tapajós, 4010, 69093-018 Manaus, AM, Brazil., Naveca FG; Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Universidade Federal do Amazonas (PPGIBA-UFAM), Av. Gen. Rodrigo Octávio Jordão Ramos, 3000, 69067-005 Manaus, AM Brazil.; Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD-FIOCRUZ), Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Oswaldo Cruz, Av. Brasil, 4365, 21040-360 Rio de Janeiro, RJ, Brazil.; Rede Genômica de Vigilância em Saúde do Estado do Amazonas, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro, Fundação Oswaldo Cruz/Fiocruz, Instituto Leônidas e Maria Deane, Rua Teresina, 476, 69057-070 Manaus, AM, Brazil.

Publikováno v: Anais da Academia Brasileira de Ciencias [An Acad Bras Cienc] 2024 May 10; Vol. 96 (2), pp. e20231336. Date of Electronic Publication: 2024 May 10 (Print Publication: 2024).