Zobrazeno 1 - 10
of 2 187
pro vyhledávání: '"Chaos game representation"'
Autor:
Young, Stephanie, Gilles, Jerome
Publikováno v:
Journal of Theoretical Biology, Vol.596, 111972, 2025
A 3D chaos game is shown to be a useful way for encoding DNA sequences. Since matching subsequences in DNA converge in space in 3D chaos game encoding, a DNA sequence's 3D chaos game representation can be used to compare DNA sequences without prior a
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2411.05266
This study proposes CGRclust, a novel combination of unsupervised twin contrastive clustering of Chaos Game Representations (CGR) of DNA sequences, with convolutional neural networks (CNNs). To the best of our knowledge, CGRclust is the first method
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2407.02538
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Veevers, Ruth, MacLean, Dan
Protein-protein interactions drive many biological processes, including the detection of phytopathogens by plants' R-Proteins and cell surface receptors. Many machine learning studies have attempted to predict protein-protein interactions but perform
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2310.14764
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Thomas, Annie
A new three dimensional approach to the chaos game representation of protein sequences is explored in this thesis. The basics of DNA, the synthesis of proteins from DNA, protein structure and functionality and sequence alignment techniques are presen
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2303.09683
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Motivation: As viruses that mainly infect bacteria, phages are key players across a wide range of ecosystems. Analyzing phage proteins is indispensable for understanding phages' functions and roles in microbiomes. High-throughput sequencing enables u
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2301.12422
Publikováno v:
Frontiers in Microbiology, Vol 15 (2024)
Traditional alignment-based methods meet serious challenges in genome sequence comparison and phylogeny reconstruction due to their high computational complexity. Here, we propose a new alignment-free method to analyze the phylogenetic relationships
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/b32e1f93e89b46b48f793831f1f6c00b
