Zobrazeno 1 - 9
of 9
pro vyhledávání: '"Cell type hierarchy"'
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 25, Iss 1, Pp 1-25 (2024)
Abstract Targeted spatial transcriptomics hold particular promise in analyzing complex tissues. Most such methods, however, measure only a limited panel of transcripts, which need to be selected in advance to inform on the cell types or processes bei
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/5400b0ad82bd43918520150a06bfd4c4
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 24, Iss 1, Pp 1-26 (2023)
Abstract Bulk high-throughput omics data contain signals from a mixture of cell types. Recent developments of deconvolution methods facilitate cell type-specific inferences from bulk data. Our real data exploration suggests that differential expressi
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ddad74b737574b1f9bc0f802d6cabac9
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Yingxin Lin, Yue Cao, Hani Jieun Kim, Agus Salim, Terence P Speed, David M Lin, Pengyi Yang, Jean Yee Hwa Yang
Publikováno v:
Molecular Systems Biology, Vol 16, Iss 6, Pp 1-16 (2020)
Abstract Automated cell type identification is a key computational challenge in single‐cell RNA‐sequencing (scRNA‐seq) data. To capitalise on the large collection of well‐annotated scRNA‐seq datasets, we developed scClassify, a multiscale c
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/71435eb9e5d94b0db1e8fa3e180304ab
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
David M. Lin, Yue Cao, Agus Salim, Yingxin Lin, Pengyi Yang, Jean Yee Hwa Yang, Terence P. Speed, Hani Jieun Kim
Publikováno v:
Molecular Systems Biology
Molecular Systems Biology, Vol 16, Iss 6, Pp n/a-n/a (2020)
Molecular Systems Biology, Vol 16, Iss 6, Pp n/a-n/a (2020)
Automated cell type identification is a key computational challenge in single‐cell RNA‐sequencing (scRNA‐seq) data. To capitalise on the large collection of well‐annotated scRNA‐seq datasets, we developed scClassify, a multiscale classifica
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::7fdc0a70945211c0d19fff24594b4a38
http://europepmc.org/articles/PMC7306901
http://europepmc.org/articles/PMC7306901
Kniha
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Zhang Y; Department of Biomedical Informatics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.; Department of Neurobiology, Duke University, Durham, NC, USA., Petukhov V; Department of Biomedical Informatics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA., Biederstedt E; Department of Biomedical Informatics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA., Que R; Department of Bioengineering, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA., Zhang K; Department of Bioengineering, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA.; San Diego Institute of Science, Altos Labs, San Diego, CA, USA., Kharchenko PV; Department of Biomedical Informatics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.; San Diego Institute of Science, Altos Labs, San Diego, CA, USA.
Publikováno v:
BioRxiv : the preprint server for biology [bioRxiv] 2023 Mar 24. Date of Electronic Publication: 2023 Mar 24.