Brownian Dynamics Simulations of Proteins in the Presence of Surfaces: Long-range Electrostatics and Mean-field Hydrodynamics

Autor: Reinhardt, Martin, Bruce, Neil J., Kokh, Daria B., Wade, Rebecca C.

Simulations of macromolecular diffusion and adsorption in confined environments can offer valuable mechanistic insights into numerous biophysical processes. In order to model solutes at atomic detail on relevant time scales, Brownian Dynamics simulat

Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/2012.09248

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Identification of Rare Lewis Oligosaccharide Conformers in Aqueous Solution Using Enhanced Sampling Molecular Dynamics

Autor: Bruce Neil J., Alibay Irfan, Burusco Kepa K., Bryce Richard A.

Publikováno v: Alibay, I, Burusco-Goni, K, Bruce, N & Bryce, R 2018, ' Identification of Rare Lewis Oligosaccharide Conformers in Aqueous Solution using Enhanced Sampling Molecular Dynamics ', The Journal of Physical Chemistry Part B, vol. 122, no. 9, pp. 2462-2474 . https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b09841

Determining the conformations accessible to carbohydrate ligands in aqueous solution is important for understanding their biological action. In this work, we evaluate the conformational free energy surfaces of Lewis oligosaccharides in explicit aqueo

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::a1047cdc6e501612a6a8b6601fd7f84e
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b09841

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.