Zobrazeno 1 - 10
of 93
pro vyhledávání: '"Brejova Brona"'
Publikováno v:
Lecture Notes in Computer Science, vol 12813. Springer, 2021, p.227-236
In this article, we review existing probabilistic models for modeling abundance of fixed-length strings (k-mers) in DNA sequencing data. These models capture dependence of the abundance on various phenomena, such as the size and repeat content of the
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2112.15107
Autor:
Medo, Matus, Suster, Martin, Bodova, Katarina, Brazinova, Alexandra, Brejova, Brona, Kollar, Richard, Leksa, Vladimir, Lindbloom, Jana, Nosek, Jozef, Vinar, Tomas
Pavelka et al. (Science, Reports, 7 May 2021) claim that a single round of population-wide antigen testing in Slovakia reduced the observed COVID-19 prevalence by 58%, and that it played a substantial role in curbing the pandemic. We argue that this
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2105.13633
In nanopore sequencing, electrical signal is measured as DNA molecules pass through the sequencing pores. Translating these signals into DNA bases (base calling) is a highly non-trivial task, and its quality has a large impact on the sequencing accur
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2105.07520
Autor:
Brejová, Broňa, Hodorová, Viktória, Boršová, Kristína, Čabanová, Viktória, Reizigová, Lenka, Paul, Evan D., Čekan, Pavol, Klempa, Boris, Nosek, Jozef, Vinař, Tomáš
SARS-CoV-2 mutants carrying the $\Delta$H69/$\Delta$V70 deletion in the amino terminal domain of the Spike protein emerged independently in at least six lineages of the virus (namely, B.1.1.7, B.1.1.298, B.1.160, B.1.177, B.1.258, B.1.375). Routine R
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2102.04689
We developed a new base caller DeepNano-coral for nanopore sequencing, which is optimized to run on the Coral Edge Tensor Processing Unit, a small USB-attached hardware accelerator. To achieve this goal, we have designed new versions of two key compo
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2011.04312
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Zhu Sheng, Cao You-Zhi, Jiang Cong, Tan Bi-Yue, Wang Zhong, Feng Sisi, Zhang Liang, Su Xiao-Hua, Brejova Brona, Vinar Tomas, Xu Meng, Wang Ming-Xiu, Zhang Shou-Gong, Huang Min-Ren, Wu Rongling, Zhou Yan
Publikováno v:
BMC Genomics, Vol 13, Iss 1, p 382 (2012)
Abstract Background The fungus Marssonina brunnea is a causal pathogen of Marssonina leaf spot that devastates poplar plantations by defoliating susceptible trees before normal fall leaf drop. Results We sequence the genome of M. brunnea with a size
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/502c5f56d51044208c1fb6f0f5989963
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
We investigate usage of dynamic time warping (DTW) algorithm for aligning raw signal data from MinION sequencer. DTW is mostly using for fast alignment for selective sequencing to quickly determine whether a read comes from sequence of interest. We s
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1705.01620
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.