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Akademický článek
Long-read sequencing of an advanced cancer cohort resolves rearrangements, unravels haplotypes, and reveals methylation landscapes.
Autor: O'Neill K; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Pleasance E; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Fan J; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Akbari V; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Chang G; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Dixon K; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Csizmok V; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., MacLennan S; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Porter V; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Galbraith A; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Grisdale CJ; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Culibrk L; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Dupuis JH; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Corbett R; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Hopkins J; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Bowlby R; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Pandoh P; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Smailus DE; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Cheng D; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Wong T; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Frey C; Department of Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Shen Y; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Lewis E; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Paulin LF; Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA., Sedlazeck FJ; Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA., Nelson JMT; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Chuah E; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Mungall KL; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Moore RA; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Coope R; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Mungall AJ; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., McConechy MK; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Williamson LM; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Schrader KA; Hereditary Cancer Program, BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Yip S; Department of Pathology and Laboratory Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Marra MA; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada; Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada., Laskin J; Department of Medical Oncology, BC Cancer, Vancouver, BC, Canada., Jones SJM; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, Vancouver, BC, Canada; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada. Electronic address: sjones@bcgsc.ca.
Publikováno v: Cell genomics [Cell Genom] 2024 Nov 13; Vol. 4 (11), pp. 100674. Date of Electronic Publication: 2024 Oct 14.
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A high-throughput pipeline for DNA/RNA/small RNA purification from tissue samples for sequencing.
Autor: Xu J; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Pandoh PK; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Corbett RD; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Smailus D; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Bowlby R; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Brooks D; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., McDonald H; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Haile S; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Chahal S; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Bilobram S; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Mungall KL; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Mungall AJ; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Coope R; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Moore RA; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Zhao Y; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Jones SJ; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada., Marra MA; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre at BC Cancer, 570 W 7th Ave, Vancouver, Canada.; Department of Medical Genetics, University of British Columbia, 2329 West Mall, Vancouver, Canada.
Publikováno v: BioTechniques [Biotechniques] 2023 Aug; Vol. 75 (2), pp. 47-55. Date of Electronic Publication: 2023 Aug 08.
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Author Correction: Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples
Autor: Bailey M. H., Meyerson W. U., Dursi L. J., Wang L. -B., Dong G., Liang W. -W., Weerasinghe A., Li S., Li Y., Kelso S., Akbani R., Anur P., Buchanan A., Chiotti K., Covington K., Creason A., Ding L., Ellrott K., Fan Y., Foltz S., Getz G., Hale W., Haussler D., Hess J. M., Hutter C. M., Kandoth C., Kasaian K., Kasapi M., Larson D., Leshchiner I., Letaw J., Ma S., McLellan M. D., Men Y., Mills G. B., Niu B., Peto M., Radenbaugh A., Reynolds S. M., Saksena G., Sofia H., Stewart C., Struck A. J., Stuart J. M., Wang W., Weinstein J. N., Wheeler D. A., Wong C. K., Xi L., Ye K., Bieg M., Boutros P. C., Buchhalter I., Butler A. P., Chen K., Chong Z., Drechsel O., Jonathan Dursi L., Eils R., Espiritu S. M. G., Fulton R. S., Gao S., Gelpi J. L., Gerstein M. B., Gonzalez S., Gut I. G., Hach F., Heinold M. C., Hinton J., Hu T., Huang V., Huang Y., Hutter B., Jones D. R., Jung J., Jager N., Kim H. -L., Kleinheinz K., Kumar S., Kumar Y., Lalansingh C. M., Letunic I., Livitz D., Ma E. Z., Maruvka Y. E., Mashl R. J., Menzies A., Milovanovic A., Nielsen M. M., Ossowski S., Paramasivam N., Pedersen J. S., Perry M. D., Puiggros M., Raine K. M., Rheinbay E., Royo R., Sahinalp S. C., Sarrafi I., Schlesner M., Simpson J. T., Stebbings L., Stobbe M. D., Teague J. W., Tiao G., Torrents D., Wala J. A., Wang J., Waszak S. M., Weischenfeldt J., Wendl M. C., Werner J., Wu Z., Xue H., Yakneen S., Yamaguchi T. N., Yellapantula V. D., Yung C. K., Zhang J., Aaltonen L. A., Abascal F., Abeshouse A., Aburatani H., Adams D. J., Agrawal N., Ahn K. S., Ahn S. -M., Aikata H., Akdemir K. C., Al-Ahmadie H., Al-Sedairy S. T., Al-Shahrour F., Alawi M., Albert M., Aldape K., Alexandrov L. B., Ally A., Alsop K., Alvarez E. G., Amary F., Amin S. B., Aminou B., Ammerpohl O., Anderson M. J., Ang Y., Antonello D., Aparicio S., Appelbaum E. L., Arai Y., Aretz A., Arihiro K., Ariizumi S. -I., Armenia J., Arnould L., Asa S., Assenov Y., Atwal G., Aukema S., Auman J. T., Aure M. 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Publikováno v: Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-1 (2020)
Nature communications, vol 11, iss 1
Weitere Nicht-UDE-Autoren sind nicht genannt. Originalpublikation: 10.1038/s41467-020-18151-y. CA extern The original version of this Article omitted from the author list the 9th author Yize Li, who is from the ‘The McDonnell Genome Institute at Wa
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::58a5f62c8099f02a9addd94129605a52
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/33257764
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