Human-aided dispersal and population bottlenecks facilitate parasitism escape in the most invasive mosquito species.

Autor: Girard M; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Martin E; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Vallon L; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Tran Van V; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Da Silva Carvalho C; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Sack J; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Bontemps Z; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France.; Department of Medical Biochemistry and Microbiology, Science for Life Laboratories, Uppsala University, 752 37 Uppsala, Sweden., Balteneck J; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France.; Université de Lyon, INSA Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR 5240 MAP, Microbiologie, Adaptation, Pathogénie, F-69622 Villeurbanne, France., Colin F; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Duval P; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Malassigné S; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Hennessee I; Rollins School of Public Health, Emory University, Atlanta, GA 30322, USA., Vizcaino L; Entomology Branch, Division of Parasitic Diseases and Malaria, Center for Global Health, US Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA 30333, USA., Romer Y; Emory College of Arts and Science, Emory University, Atlanta, GA 30322, USA., Dada N; Centre de Recherche pour la lutte contre les Maladies Infectieuses Tropicales/Tropicales Infectious Diseases Research Centre, Université d'Abomey-Calavi, Cotonou, Benin.; School of Life Sciences, Arizona State University, Tempe, AZ 85281, USA., Ly Huynh Kim K; Department of Medical Entomology and Zoonotics, Pasteur Institute, 722700 Ho Chi Minh City, Vietnam., Huynh Thi Thuy T; Department of Medical Entomology and Zoonotics, Pasteur Institute, 722700 Ho Chi Minh City, Vietnam., Bellet C; Entente Interdépartementale Rhône-Alpes pour la Démoustication, 73310 Chindrieux, France., Lambert G; Entente Interdépartementale de Démoustication du Littoral Méditerranéen, 34000 Montpellier, France., Nantenaina Raharimalala F; Pasteur Institute, Antananarivo, Madagascar., Jupatanakul N; National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), 12120 Pathum Thani, Thailand., Goubert C; Canadian Centre for Computational Genomics, McGill Genome Centre, Human Genetics, McGill University, QC H3A0G1 Montreal, Canada., Boulesteix M; Laboratoire de Biométrie et de Biologie Evolutive, Université de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UMR CNRS 5558, VetAgro Sup, F-69622 Villeurbanne, France., Mavingui P; UMR PIMIT, Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical, CNRS 9192, INSERM U1187, IRD 249, Université de La Réunion, 97490 Sainte-Clotilde, La Réunion, France., Desouhant E; Laboratoire de Biométrie et de Biologie Evolutive, Université de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UMR CNRS 5558, VetAgro Sup, F-69622 Villeurbanne, France., Luis P; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Cazabet R; Univ de Lyon, CNRS, Université Lyon 1, LIRIS, UMR5205, F-69622 Villeurbanne, France., Hay AE; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Valiente Moro C; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France., Minard G; University of Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, INRAe, VetAgro Sup, UMR Ecologie Microbienne, F-69622 Villeurbanne, France.

Publikováno v: PNAS nexus [PNAS Nexus] 2024 Apr 30; Vol. 3 (5), pp. pgae175. Date of Electronic Publication: 2024 Apr 30 (Print Publication: 2024).

Evaluating the essentiality of the primary endosymbiont of the rice weevil Sitophilus oryzae through genome analysis

Autor: Vargas-Chavez, Carlos, Parisot, Nicolas, Goubert, C., Baa-Puyoulet, Patrice, Balmand, Severine, Boulesteix, M., Burlet, Nelly, Callaerts, Patrick, Charles, Hubert, Colella, Stefano, Febvay, Gérard, Gabaldon, Toni, Jacquin-Joly, Emmanuelle, Loska, Damian, Maire, Justin, MASSON, Florent, Meslin, Camille, montagné, N, Moya, Andres, Vincent-Monégat, Carole, Rebollo, Rita, Vallier, Agnès, Vigneron, Aurélien, Zaidman-Rémy, A., Calevro, Federica, Vieira, Cristina, Latorre, Amparo, Heddi, Abdelaziz

Publikováno v: VI Meeting of the Spanish Society for Evolutionary Biology (SESBE)
VI Meeting of the Spanish Society for Evolutionary Biology (SESBE), Jan 2018, Palma de Mallorca, Spain

International audience; The rice weevil Sitophilus oryzae is a pest insect responsible for great economic losses to the agriculture, particularly in developing countries where the damage can exceed 40% of the cereal production. This pest harbors an e

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::8f3f8f85eefa3f8a0b3146616e28575a
https://hal.inrae.fr/hal-03514015

The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae.

Autor: Parisot N; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Vargas-Chávez C; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; Institute for Integrative Systems Biology (I2SySBio), Universitat de València and Spanish Research Council (CSIC), València, Spain.; Present Address: Institute of Evolutionary Biology (IBE), CSIC-Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain., Goubert C; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France.; Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, 526 Campus Rd, Ithaca, New York, 14853, USA.; Present Address: Human Genetics, McGill University, Montreal, QC, Canada., Baa-Puyoulet P; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Balmand S; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Beranger L; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Blanc C; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Bonnamour A; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Boulesteix M; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France., Burlet N; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France., Calevro F; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Callaerts P; Department of Human Genetics, Laboratory of Behavioral and Developmental Genetics, KU Leuven, University of Leuven, B-3000, Leuven, Belgium., Chancy T; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Charles H; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; ERABLE European Team, INRIA, Rhône-Alpes, France., Colella S; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; Present Address: LSTM, Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes, IRD, CIRAD, INRAE, SupAgro, Univ Montpellier, Montpellier, France., Da Silva Barbosa A; INRAE, Sorbonne Université, CNRS, IRD, UPEC, Université de Paris, Institute of Ecology and Environmental Sciences of Paris, Versailles, France., Dell'Aglio E; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Di Genova A; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France.; ERABLE European Team, INRIA, Rhône-Alpes, France.; Instituto de Ciencias de la Ingeniería, Universidad de O'Higgins, Rancagua, Chile., Febvay G; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Gabaldón T; Life Sciences, Barcelona Supercomputing Centre (BSC-CNS), Barcelona, Spain.; Mechanisms of Disease, Institute for Research in Biomedicine (IRB), Barcelona, Spain.; Institut Catalan de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), Barcelona, Spain., Galvão Ferrarini M; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Gerber A; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Gillet B; Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS UMR 5242, Lyon, France., Hubley R; Institute for Systems Biology, Seattle, WA, USA., Hughes S; Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, CNRS UMR 5242, Lyon, France., Jacquin-Joly E; INRAE, Sorbonne Université, CNRS, IRD, UPEC, Université de Paris, Institute of Ecology and Environmental Sciences of Paris, Versailles, France., Maire J; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; Present Address: School of BioSciences, The University of Melbourne, Parkville, VIC, 3010, Australia., Marcet-Houben M; Life Sciences, Barcelona Supercomputing Centre (BSC-CNS), Barcelona, Spain., Masson F; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; Present Address: Global Health Institute, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), 1015, Lausanne, Switzerland., Meslin C; INRAE, Sorbonne Université, CNRS, IRD, UPEC, Université de Paris, Institute of Ecology and Environmental Sciences of Paris, Versailles, France., Montagné N; INRAE, Sorbonne Université, CNRS, IRD, UPEC, Université de Paris, Institute of Ecology and Environmental Sciences of Paris, Versailles, France., Moya A; Institute for Integrative Systems Biology (I2SySBio), Universitat de València and Spanish Research Council (CSIC), València, Spain.; Foundation for the Promotion of Sanitary and Biomedical Research of Valencian Community (FISABIO), València, Spain., Ribeiro de Vasconcelos AT; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Brazil., Richard G; IGEPP, INRAE, Institut Agro, Université de Rennes, Domaine de la Motte, 35653, Le Rheu, France., Rosen J; Institute for Systems Biology, Seattle, WA, USA., Sagot MF; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France.; ERABLE European Team, INRIA, Rhône-Alpes, France., Smit AFA; Institute for Systems Biology, Seattle, WA, USA., Storer JM; Institute for Systems Biology, Seattle, WA, USA., Vincent-Monegat C; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Vallier A; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Vigneron A; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France.; Present Address: Department of Evolutionary Ecology, Institute for Organismic and Molecular Evolution, Johannes Gutenberg University, 55128, Mainz, Germany., Zaidman-Rémy A; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Zamoum W; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France., Vieira C; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR5558, Université Lyon 1, Université Lyon, Villeurbanne, France. cristina.vieira@univ-lyon1.fr.; ERABLE European Team, INRIA, Rhône-Alpes, France. cristina.vieira@univ-lyon1.fr., Rebollo R; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France. rita.rebollo@inrae.fr., Latorre A; Institute for Integrative Systems Biology (I2SySBio), Universitat de València and Spanish Research Council (CSIC), València, Spain. amparo.latorre@uv.es.; Foundation for the Promotion of Sanitary and Biomedical Research of Valencian Community (FISABIO), València, Spain. amparo.latorre@uv.es., Heddi A; Univ Lyon, INSA Lyon, INRAE, BF2I, UMR 203, 69621 Villeurbanne, France. abdelaziz.heddi@insa-lyon.fr.

Publikováno v: BMC biology [BMC Biol] 2021 Nov 09; Vol. 19 (1), pp. 241. Date of Electronic Publication: 2021 Nov 09.

Transposable elements in Drosophila montana from harsh cold environments.

Autor: Tahami, Mohadeseh S.¹ (AUTHOR), Vargas-Chavez, Carlos² (AUTHOR), Poikela, Noora^1,3 (AUTHOR), Coronado-Zamora, Marta^2,4 (AUTHOR), González, Josefa^2,4 (AUTHOR) josefa.gonzalez@csic.es, Kankare, Maaria¹ (AUTHOR) maaria.kankare@jyu.fi

Publikováno v: Mobile DNA. 10/1/2024, Vol. 15 Issue 1, p1-21. 21p.

A Transposon Story: From TE Content to TE Dynamic Invasion of Drosophila Genomes Using the Single-Molecule Sequencing Technology from Oxford Nanopore.

Autor: Mohamed M; Institute of Human Genetics, UMR9002, CNRS and Montpellier University, 34396 Montpellier, France., Dang NT; IRD/UM UMR DIADE, 911 avenue Agropolis BP64501, 34394 Montpellier, France., Ogyama Y; Institute of Human Genetics, UMR9002, CNRS and Montpellier University, 34396 Montpellier, France., Burlet N; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Mugat B; Institute of Human Genetics, UMR9002, CNRS and Montpellier University, 34396 Montpellier, France., Boulesteix M; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Mérel V; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Veber P; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Salces-Ortiz J; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France.; Institute of Evolutionary Biology (IBE), CSIC-Universitat Pompeu Fabra, 08003 Barcelona, Spain., Severac D; MGX-Montpellier GenomiX, c/o Institut de Génomique Fonctionnelle, CNRS, INSERM, Université de Montpellier, 34094 Montpellier, France., Pélisson A; Institute of Human Genetics, UMR9002, CNRS and Montpellier University, 34396 Montpellier, France., Vieira C; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Sabot F; IRD/UM UMR DIADE, 911 avenue Agropolis BP64501, 34394 Montpellier, France., Fablet M; Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR 5558, 69622 Villeurbanne, France., Chambeyron S; Institute of Human Genetics, UMR9002, CNRS and Montpellier University, 34396 Montpellier, France.

Publikováno v: Cells [Cells] 2020 Jul 25; Vol. 9 (8). Date of Electronic Publication: 2020 Jul 25.