Genomic monitoring unveil the early detection of the SARS-CoV-2 B.1.351 lineage (20H/501Y.V2) in Brazil

Autor: Sandra Coccuzzo Sampaio, Bibiana Santos, Vincent Louis Viala, Svetoslav Nanev Slavov, R. Haddad, Maria Carolina Elias, Simone Kashima, Paulo Kitajima J, Leister Patané Js, Elaine Cristina Marqueze, Antonio Jorge Martins, Fonseca, Evandra Strazza Rodrigues, Erika L. Freitas, Dimas Tadeu Covas, Débora Botéquio Moretti, Raul Machado Neto, dos Santos Barros Cr, Flávia Figueira Aburjaile, Marta Giovanetti, Rodrigo T. Calado, dos Santos Ev, David Schlesinger, Santos Bezerra Rd, de Alcantara Lcj

Sao Paulo State, the most populous area in Brazil, currently experiences a second wave of the COVID-19 pandemic which overwhelmed the healthcare system. Recently, due to the paucity of SARS-CoV-2 complete genome sequences, we established a Network fo

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::6942cf8cf4ae5f9cd718fa90af11e47a
https://doi.org/10.1101/2021.03.30.21254591

Epidemiology of the SARS-CoV-2 Omicron Variant Emergence in the Southeast Brazilian Population.

Autor: Rodrigues ES; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Slavov SN; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., de La Roque DGL; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Santos EV; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Borges JS; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Evaristo M; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., da Costa PNM; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., de Matos Maçonetto J; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Marques AA; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Baccarin AD; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Oliveira RAM; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Junior WL; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Benincasa BI; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., de Andrade da Cruz LM; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Lima ARJ; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Ribeiro G; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Viala VL; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., de Lima LPO; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Martins AJ; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Dos Santos Barros CR; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Marqueze EC; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., de Souza Todao Bernardino J; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Grotto RMT; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, SP, Brazil., Souza-Neto JA; Department of Diagnostic Medicine/Pathobiology, Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory College of Veterinary Medicine, Kansas State University, Manhattan, KS 66506, USA., Fonseca V; Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília 70075-900, DF, Brazil., Nogueira ML; Medicine School of São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto 15090-000, SP, Brazil., Fukumasu H; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of São Paulo, Pirassununga 05508-270, SP, Brazil., Coutinho LL; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, SP, Brazil., Calado RT; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil., Covas DT; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil.; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Giovanetti M; Laboratorio de Flavivirus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro 21040-360, RJ, Brazil.; Department of Science and Technology for Humans and the Environment, University of Campus Bio-Medico di Roma, 00128 Rome, Italy., Alcantara LCJ; Laboratorio de Flavivirus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro 21040-360, RJ, Brazil., Sampaio SC; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Elias MC; Butantan Institute, São Paulo 05585-000, SP, Brazil., Kashima S; Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, SP, Brazil.

Publikováno v: Microorganisms [Microorganisms] 2024 Feb 23; Vol. 12 (3). Date of Electronic Publication: 2024 Feb 23.

Retrospective Insights of the COVID-19 Epidemic in the Major Latin American City, São Paulo, Southeastern Brazil.

Autor: Assato PA; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, Brazil., Clemente LG; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Giovanetti M; Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro 21040-360, Brazil.; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil.; Department of Science and Technology for Humans and the Environment, University of Campus Bio-Medico di Roma, 00128 Rome, Italy., Ribeiro G; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Lima ARJ; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Palmieri M; Health Surveillance Coordination, Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Vigilância em Saúde-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., de Moraes LN; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, Brazil., Kashima S; Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil., Fukumasu H; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil., Nogueira ML; Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto 15090-000, Brazil., Alcantara LCJ; Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro 21040-360, Brazil.; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil., Nicolodelli AL; Primary Care Coordination/Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Atenção Básica-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., Martins AJ; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Petry B; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Banho CA; Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto 15090-000, Brazil., Dos Santos Barros CR; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Moncau-Gadbem CT; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Moretti DB; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., De La Roque DGL; Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil., Marqueze EC; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Mattos EC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil., Silva FEVD; Primary Care Coordination/Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Atenção Básica-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., Da Costa FADS; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, Brazil., Cacherik G; Primary Care Coordination/Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Atenção Básica-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., De Souza Todao Bernardino J; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Lesbon JCC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil., Sacchetto L; Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto 15090-000, Brazil., De Lima LPO; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Caldeira LAV; Health Surveillance Coordination, Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Vigilância em Saúde-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., Martininghi M; Health Surveillance Coordination, Sao Paulo Municipal Health Department-Coordenadoria de Vigilância em Saúde-Secretaria Municipal de São Paulo, Sao Paulo 05579-000, Brazil., Moraes MM; Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto 15090-000, Brazil., Poleti MD; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga 13635-900, Brazil., Cattony Neto PQ; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Cassano RLRC; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Brassaloti RA; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Slavov SN; Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil., Viala VL; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Coutinho LL; Centro de Genômica Funcional da ESALQ, University of São Paulo, Piracicaba 13418-900, Brazil., Grotto RMT; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, Brazil.; Genomic Surveillance Network, São Paulo State University (UNESP), Sao Paulo 01049-010, Brazil., Neto RM; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Covas DT; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil.; Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, University of São Paulo, Ribeirão Preto 14051-140, Brazil., Sampaio SC; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Elias MC; Butantan Institute, Sao Paulo 05508-040, Brazil., Souza-Neto JA; School of Agricultural Sciences, São Paulo State University (UNESP), Botucatu 18610-034, Brazil.; Genomic Surveillance Network, São Paulo State University (UNESP), Sao Paulo 01049-010, Brazil.

Publikováno v: Viruses [Viruses] 2023 Jan 24; Vol. 15 (2). Date of Electronic Publication: 2023 Jan 24.

Genomic epidemiology reveals the impact of national and international restrictions measures on the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil.

Autor: Giovanetti M; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Slavov SN; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil.; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Fonseca V; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde, Ministério da Saúde (CGLAB/SVS-MS) Brasília, Distrito Federal, Brazil.; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, College of Health Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University; Stellenbosch, South Africa., Wilkinson E; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, College of Health Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University; Stellenbosch, South Africa., Tegally H; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, College of Health Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University; Stellenbosch, South Africa., Patané JSL; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Viala VL; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., San JE; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, College of Health Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University; Stellenbosch, South Africa., Rodrigues ES; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Santos EV; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Aburjaile F; Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Xavier J; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Fritsch H; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Adelino TER; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Pereira F; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., Leal A; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., de Melo Iani FC; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., de Carvalho Pereira G; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Vazquez C; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Mercedes Estigarribia Sanabria G; Universidad Nacional del Caaguazú, Instituto Regional de Investigación en Salud.; Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Regional de Coronel Oviedo.; Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social., de Oliveira EC; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso, Cuiabá, Brazil., Demarchi L; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil., Croda J; Universidade Federal de Mato Grosso do Sul., Dos Santos Bezerra R; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., de Lima LPO; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Martins AJ; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Dos Santos Barros CR; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Marqueze EC; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., de Souza Todao Bernardino J; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Moretti DB; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Brassaloti RA; University of São Paulo, Centro de Genômica Funcional da ESALQ, Piracicaba, SP, Brazil., de Lello Rocha Campos Cassano R; University of São Paulo, Centro de Genômica Funcional da ESALQ, Piracicaba, SP, Brazil., Mariani PDSC; NGS Soluções Genômicas, Piracicaba, SP, Brazil., Kitajima JP; Mendelics Análise Genômica., Santos B; Mendelics Análise Genômica., Proto-Siqueira R; Instituto de Biologia Molecular, Laboratório Antonello, Rio Grande do Sul, Brazil., Cantarelli VV; Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre (UFCSPA), Universidade Feevale, Grupo Exame Laboratórios, Rio Grande do Sul, Brazil., Tosta S; Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., Nardy VB; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., de Oliveira da Silva LR; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., Kelly Astete Gómez M; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., Lima JG; Laboratorio Central de Saude Publica da Bahia-LACEN-BA, Salvador, Bahia, Brazil., Ribeiro AA; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Guimarães NR; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais, Fundac ão Ezequiel Dias, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Watanabe LT; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso, Cuiabá, Brazil., Da Silva LB; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso, Cuiabá, Brazil., da Silva Ferreira R; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso, Cuiabá, Brazil., da Penha MPF; Vigilância em Saúde do Estado de Mato Grosso, Cuiabá, Brazil., Ortega MJ; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., de la Fuente AG; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Villalba S; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Torales J; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Gamarra ML; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Aquino C; Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción, Paraguay., Martínez Figueredo GP; Universidad Nacional del Caaguazú, Instituto Regional de Investigación en Salud.; Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Regional de Coronel Oviedo.; Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social., Fava WS; Universidade Federal de Mato Grosso do Sul., Motta-Castro ARC; Universidade Federal de Mato Grosso do Sul., Venturini J; Universidade Federal de Mato Grosso do Sul., de Oliveira SMDVL; Universidade Federal de Mato Grosso do Sul., Gonçalves CCM; Secretaria de Saúde do Estado do Mato Grosso do Sul., do Carmo Debur Rossa M; Laboratório Central do Estado do Paraná (Lacen/PR)., Becker GN; Laboratório Central do Estado do Paraná (Lacen/PR)., Presibella MM; Laboratório Central do Estado do Paraná (Lacen/PR)., Marques NQ; Laboratório Central do Estado do Paraná (Lacen/PR)., Riediger IN; Laboratório Central do Estado do Paraná (Lacen/PR)., Raboni S; Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná, Curitiba, PR., Coelho GM; Laboratório de Virologia Molecular - Instituto Carlos Chagas/Fiocruz PR, Curitiba, PR., Cataneo AHD; Laboratório de Virologia Molecular - Instituto Carlos Chagas/Fiocruz PR, Curitiba, PR., Zanluca C; Laboratório de Virologia Molecular - Instituto Carlos Chagas/Fiocruz PR, Curitiba, PR., Dos Santos CND; Laboratório de Virologia Molecular - Instituto Carlos Chagas/Fiocruz PR, Curitiba, PR., Assato PA; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., da Costa FADS; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., Poleti MD; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, São Paulo, Brazil., Lesbon JCC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, São Paulo, Brazil., Mattos EC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, São Paulo, Brazil., Banho CA; Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto., Sacchetto L; Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto., Moraes MM; Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto., Grotto RMT; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil.; Molecular Biology Laboratory, Applied Biotechnology Laboratory, Clinical Hospital of the Botucatu Medical School, Brazil., Souza-Neto JA; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., Nogueira ML; Laboratório de Pesquisas em Virologia, Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto., Fukumasu H; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, São Paulo, Brazil., Coutinho LL; University of São Paulo, Centro de Genômica Funcional da ESALQ, Piracicaba, SP, Brazil., Calado RT; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Neto RM; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., de Filippis AMB; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil., da Cunha RV; Fundação Oswaldo Cruz, Bio-Manguinhos, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Freitas C; Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde, Ministério da Saúde (CGLAB/SVS-MS) Brasília, Distrito Federal, Brazil., Peterka CRL; Coordenação Geral das Arboviroses, Secretaria de Vigilaçncia em Saúde/Ministério da Saúde (CGARB/SVS-MS), Brasília, Distrito Federal, Brazil., de Fátima Rangel Fernandes C; Departamento de Imunização e Doenças Transmissíveisa/Secretaria de Vigilância em Saúde, Ministério da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil., de Araújo WN; Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil., do Carmo Said RF; Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil., Almiron M; Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil., de Albuquerque E Melo CFC; Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde, Brasília, Distrito Federal, Brazil., Lourenço J; Department of Zoology, Peter Medawar Building, University of Oxford, Oxford, UK.; Biosystems and Integrative Sciences Institute, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal., de Oliveira T; KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, College of Health Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI), School of Data Science and Computational Thinking, Stellenbosch University; Stellenbosch, South Africa.; Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa (CAPRISA), Durban, South Africa.; Department of Global Health, University of Washington, Seattle, WA, USA., Holmes EC; Sydney Institute for Infectious Diseases, School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences, University of Sydney, Sydney, NSW, Australia., Haddad R; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Sampaio SC; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Elias MC; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Kashima S; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., de Alcantara LCJ; Laboratório de Flavivírus, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brazil.; Laboratório de Genética Celular e Molecular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Covas DT; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil.; Butantan Institute, São Paulo, Brazil.

Publikováno v: MedRxiv : the preprint server for health sciences [medRxiv] 2022 Mar 28. Date of Electronic Publication: 2022 Mar 28.

Genomic monitoring of the SARS-CoV-2 B1.1.7 (WHO VOC Alpha) in the Sao Paulo state, Brazil.

Autor: Slavov SN; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil; Butantan Institute, São Paulo, Brazil. Electronic address: svetoslav.slavov@hemocentro.fmrp.usp.br., Bezerra RDS; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Rodrigues ES; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Santos EV; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Borges JS; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., de la Roque DGL; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Patané JSL; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Lima ARJ; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Ribeiro G; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Viala VL; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., de Lima LPO; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Martins AJ; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Dos Santos Barros CR; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Marqueze EC; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Bernardino JST; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Moretti DB; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Brassaloti RA; University of São Paulo, Centro de Genômica Funcional da ESALQ, Piracicaba, SP, Brazil., Cassano RLRC; University of São Paulo, Centro de Genômica Funcional da ESALQ, Piracicaba, SP, Brazil., Mariani PDSC; NGS Soluções Genômicas, Piracicaba, SP, Brazil., Kitajima JP; Mendelics Análise Genômica SA, Sao Paulo, Brazil., Santos B; Mendelics Análise Genômica SA, Sao Paulo, Brazil., Assato PA; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., da Silva da Costa FA; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., Poleti MD; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Sao Paulo, Brazil., Lesbon JCC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Sao Paulo, Brazil., Mattos EC; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Sao Paulo, Brazil., Banho CA; Medicine School of São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, São Paulo 15090-000, Brazil., Sacchetto L; Medicine School of São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, São Paulo 15090-000, Brazil., Moraes MM; Medicine School of São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, São Paulo 15090-000, Brazil., Grotto RMT; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil; Molecular Biology Laboratory, Applied Biotechnology Laboratory, Clinical Hospital of the Botucatu Medical School, Brazil., Souza-Neto JA; São Paulo State University (UNESP), School of Agricultural Sciences, Department of Bioprocesses and Biotechnology, Botucatu, Brazil., Giovanetti M; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil; Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., de Alcantara LCJ; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil; Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Nogueira ML; Medicine School of São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, São Paulo 15090-000, Brazil., Fukumasu H; Department of Veterinary Medicine, School of Animal Science and Food Engineering, University of Sao Paulo, Pirassununga, Sao Paulo, Brazil., Coutinho LL; NGS Soluções Genômicas, Piracicaba, SP, Brazil., Calado RT; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Neto RM; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Covas DT; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil; Butantan Institute, São Paulo, Brazil; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Ribeirão Preto, SP, Brazil., Coccuzzo Sampaio S; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Elias MC; Butantan Institute, São Paulo, Brazil., Kashima S; University of São Paulo, Ribeirão Preto Medical School, Blood Center of Ribeirão Preto, Ribeirão Preto, SP, Brazil.

Publikováno v: Virus research [Virus Res] 2022 Jan 15; Vol. 308, pp. 198643. Date of Electronic Publication: 2021 Nov 27.