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Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential.

Autor: Faria NR; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK. nuno.faria@zoo.ox.ac.uk luiz.alcantara@ioc.fiocruz.br oliver.pybus@zoo.ox.ac.uk., Kraemer MUG; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.; Computational Epidemiology Lab, Boston Children's Hospital, Boston, MA, USA.; Department of Pediatrics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA., Hill SC; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Goes de Jesus J; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Aguiar RS; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Iani FCM; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Xavier J; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Quick J; Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, Birmingham, UK., du Plessis L; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Dellicour S; Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Thézé J; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Carvalho RDO; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Baele G; Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Wu CH; Department of Statistics, University of Oxford, Oxford, UK., Silveira PP; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Arruda MB; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Pereira MA; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Pereira GC; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Lourenço J; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Obolski U; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Abade L; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK.; The Global Health Network, University of Oxford, Oxford, UK., Vasylyeva TI; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Giovanetti M; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil.; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Yi D; Department of Statistics, Harvard University, Cambridge, MA, USA., Weiss DJ; Malaria Atlas Project, Big Data Institute, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK., Wint GRW; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK., Shearer FM; Malaria Atlas Project, Big Data Institute, Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oxford, UK., Funk S; Faculty of Epidemiology and Population Health, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK., Nikolay B; Mathematical Modelling of Infectious Diseases and Center of Bioinformatics, Institut Pasteur, Paris, France.; CNRS UMR2000: Génomique Évolutive, Modélisation et Santé, Institut Pasteur, Paris, France., Fonseca V; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.; KwaZulu-Natal Research, Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa., Adelino TER; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Oliveira MAA; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Silva MVF; Laboratório Central de Saúde Pública, Instituto Octávio Magalhães, FUNED, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Sacchetto L; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Figueiredo PO; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Rezende IM; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Mello EM; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Said RFC; Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Santos DA; Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Ferraz ML; Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Brito MG; Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Santana LF; Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Menezes MT; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Brindeiro RM; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Tanuri A; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Dos Santos FCP; Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil., Cunha MS; Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil., Nogueira JS; Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil., Rocco IM; Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil., da Costa AC; Instituto de Medicina Tropical e Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Komninakis SCV; Retrovirology Laboratory, Federal University of São Paulo, São Paulo, Brazil.; School of Medicine of ABC (FMABC), Clinical Immunology Laboratory, Santo André, São Paulo, Brazil., Azevedo V; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Chieppe AO; Coordenação de Vigilância Epidemiológica do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Araujo ESM; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Mendonça MCL; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Dos Santos CC; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Dos Santos CD; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Mares-Guia AM; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Nogueira RMR; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Sequeira PC; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Abreu RG; Departamento de Vigilância das Doenças Transmissíveis da Secretaria de Vigilância em Saúde, Ministério da Saúde, Brasília-DF, Brazil., Garcia MHO; Departamento de Vigilância das Doenças Transmissíveis da Secretaria de Vigilância em Saúde, Ministério da Saúde, Brasília-DF, Brazil., Abreu AL; Secretaria de Vigilância em Saúde, Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública, Ministério da Saúde, Brasília-DF, Brazil., Okumoto O; Secretaria de Vigilância em Saúde, Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública, Ministério da Saúde, Brasília-DF, Brazil., Kroon EG; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., de Albuquerque CFC; Organização Pan - Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde - (OPAS/OMS), Brasília-DF, Brazil., Lewandowski K; Public Health England, National Infections Service, Porton Down, Salisbury, UK., Pullan ST; Public Health England, National Infections Service, Porton Down, Salisbury, UK., Carroll M; NIHR HPRU in Emerging and Zoonotic Infections, Public Health England, London, UK., de Oliveira T; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil.; KwaZulu-Natal Research, Innovation and Sequencing Platform (KRISP), School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, University of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa.; Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa (CAPRISA), Durban, South Africa., Sabino EC; Instituto de Medicina Tropical e Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Souza RP; Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil., Suchard MA; Department of Biostatistics, UCLA Fielding School of Public Health, University of California, Los Angeles, CA, USA.; Department of Biomathematics and Human Genetics, David Geffen School of Medicine at UCLA, University of California, Los Angeles, CA, USA., Lemey P; Department of Microbiology and Immunology, Rega Institute, KU Leuven, Leuven, Belgium., Trindade GS; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Drumond BP; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Filippis AMB; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil., Loman NJ; Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, Birmingham, UK., Cauchemez S; Mathematical Modelling of Infectious Diseases and Center of Bioinformatics, Institut Pasteur, Paris, France.; CNRS UMR2000: Génomique Évolutive, Modélisation et Santé, Institut Pasteur, Paris, France., Alcantara LCJ; Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brazil. nuno.faria@zoo.ox.ac.uk luiz.alcantara@ioc.fiocruz.br oliver.pybus@zoo.ox.ac.uk.; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Pybus OG; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK. nuno.faria@zoo.ox.ac.uk luiz.alcantara@ioc.fiocruz.br oliver.pybus@zoo.ox.ac.uk.

Publikováno v: Science (New York, N.Y.) [Science] 2018 Aug 31; Vol. 361 (6405), pp. 894-899. Date of Electronic Publication: 2018 Aug 23.