Zobrazeno 1 - 10
of 69
pro vyhledávání: '"Abreu, Charlles R. A."'
Autor:
Eastman, Peter, Galvelis, Raimondas, Peláez, Raúl P., Abreu, Charlles R. A., Farr, Stephen E., Gallicchio, Emilio, Gorenko, Anton, Henry, Michael M., Hu, Frank, Huang, Jing, Krämer, Andreas, Michel, Julien, Mitchell, Joshua A., Pande, Vijay S., Rodrigues, João PGLM, Rodriguez-Guerra, Jaime, Simmonett, Andrew C., Swails, Jason, Zhang, Ivy, Chodera, John D., De Fabritiis, Gianni, Markland, Thomas E.
Machine learning plays an important and growing role in molecular simulation. The newest version of the OpenMM molecular dynamics toolkit introduces new features to support the use of machine learning potentials. Arbitrary PyTorch models can be added
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2310.03121
Publikováno v:
J. Chem. Theory Comput. 2022, 18, 10, 5876-5889
Alchemical free energy calculations via molecular dynamics have been widely used to obtain thermodynamic properties related to protein-ligand binding and solute-solvent interactions. Although soft-core modeling is the most common approach, the linear
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2205.11464
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
J. Chem. Phys. 150, 114110 (2019)
Kinetic energy equipartition is a premise for many deterministic and stochastic molecular dynamics methods that aim at sampling a canonical ensemble. While this is expected for real systems, discretization errors introduced by the numerical integrati
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1811.05035
Autor:
Correa, Gabriela B., Zhang, Yong, Abreu, Charlles R. A., Tavares, Frederico W., Maginn, Edward J.
Publikováno v:
Journal of Chemical Physics; 9/14/2023, Vol. 159 Issue 10, p1-14, 14p
Autor:
Naleem, Nawavi, Abreu, Charlles R. A., Warmuz, Krzysztof, Tong, Muchen, Kirmizialtin, Serdal, Tuckerman, Mark E.
Publikováno v:
Journal of Chemical Physics; 7/21/2023, Vol. 159 Issue 3, p1-22, 22p
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Eastman, Peter, Galvelis, Raimondas, Peláez, Raúl P., Abreu, Charlles R. A., Farr, Stephen E., Gallicchio, Emilio, Gorenko, Anton, Henry, Michael M., Hu, Frank, Huang, Jing, Krämer, Andreas, Michel, Julien, Mitchell, Joshua A., Pande, Vijay S., Rodrigues, João PGLM, Rodriguez-Guerra, Jaime, Simmonett, Andrew C., Singh, Sukrit, Swails, Jason, Turner, Philip
Publikováno v:
Journal of Physical Chemistry B; 1/11/2024, Vol. 128 Issue 1, p109-116, 8p
Publikováno v:
Journal of Chemical Physics; 3/21/2019, Vol. 150 Issue 11, pN.PAG-N.PAG, 11p, 1 Diagram, 6 Graphs
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.