Zobrazeno 1 - 10
of 31
pro vyhledávání: '"Ryan, E"'
Autor:
Yuwei Bao, Jack Wadden, John R. Erb-Downward, Piyush Ranjan, Weichen Zhou, Torrin L. McDonald, Ryan E. Mills, Alan P. Boyle, Robert P. Dickson, David Blaauw, Joshua D. Welch
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 22, Iss 1, Pp 1-16 (2021)
Abstract We present SquiggleNet, the first deep-learning model that can classify nanopore reads directly from their electrical signals. SquiggleNet operates faster than DNA passes through the pore, allowing real-time classification and read ejection.
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/400a7cdd3e9a4dc1a17cb22271f19b24
Autor:
Yifan Wang, Taejeong Bae, Jeremy Thorpe, Maxwell A. Sherman, Attila G. Jones, Sean Cho, Kenneth Daily, Yanmei Dou, Javier Ganz, Alon Galor, Irene Lobon, Reenal Pattni, Chaggai Rosenbluh, Simone Tomasi, Livia Tomasini, Xiaoxu Yang, Bo Zhou, Schahram Akbarian, Laurel L. Ball, Sara Bizzotto, Sarah B. Emery, Ryan Doan, Liana Fasching, Yeongjun Jang, David Juan, Esther Lizano, Lovelace J. Luquette, John B. Moldovan, Rujuta Narurkar, Matthew T. Oetjens, Rachel E. Rodin, Shobana Sekar, Joo Heon Shin, Eduardo Soriano, Richard E. Straub, Weichen Zhou, Andrew Chess, Joseph G. Gleeson, Tomas Marquès-Bonet, Peter J. Park, Mette A. Peters, Jonathan Pevsner, Christopher A. Walsh, Daniel R. Weinberger, Brain Somatic Mosaicism Network, Flora M. Vaccarino, John V. Moran, Alexander E. Urban, Jeffrey M. Kidd, Ryan E. Mills, Alexej Abyzov
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 22, Iss 1, Pp 1-32 (2021)
Abstract Background Post-zygotic mutations incurred during DNA replication, DNA repair, and other cellular processes lead to somatic mosaicism. Somatic mosaicism is an established cause of various diseases, including cancers. However, detecting mosai
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ed8ec2a7cb594e94ba5848bb9fd9be5a
Autor:
Sergio Barberán-Soler, Jenny M. Vo, Ryan E. Hogans, Anne Dallas, Brian H. Johnston, Sergei A. Kazakov
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-9 (2018)
Abstract The ability to accurately quantify all the microRNAs (miRNAs) in a sample is important for understanding miRNA biology and for development of new biomarkers and therapeutic targets. We develop a new method for preparing miRNA sequencing libr
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/cb4542e2d6824eae8d033356d38fa4f2
Autor:
Timothy Becker, Wan-Ping Lee, Joseph Leone, Qihui Zhu, Chengsheng Zhang, Silvia Liu, Jack Sargent, Kritika Shanker, Adam Mil-homens, Eliza Cerveira, Mallory Ryan, Jane Cha, Fabio C. P. Navarro, Timur Galeev, Mark Gerstein, Ryan E. Mills, Dong-Guk Shin, Charles Lee, Ankit Malhotra
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-14 (2018)
Abstract Comprehensive and accurate identification of structural variations (SVs) from next generation sequencing data remains a major challenge. We develop FusorSV, which uses a data mining approach to assess performance and merge callsets from an e
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ed8fbd6184544edc8cdbff2d7a92587c
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Adam Mil-homens, Timothy James Becker, Jane Cha, Ankit Malhotra, Wan-Ping Lee, Kritika Shanker, Chengsheng Zhang, Silvia Liu, Fabio C. P. Navarro, Jack Sargent, Charles Lee, Eliza Cerveira, Ryan E. Mills, Mallory Ryan, Dong-Guk Shin, Mark Gerstein, Qihui Zhu, Timur R. Galeev, Joseph Leone
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-14 (2018)
Genome Biology
Genome Biology
Comprehensive and accurate identification of structural variations (SVs) from next generation sequencing data remains a major challenge. We develop FusorSV, which uses a data mining approach to assess performance and merge callsets from an ensemble o
Autor:
Sergei A. Kazakov, Jenny M. Vo, Anne Dallas, Sergio Barberan-Soler, Ryan E. Hogans, Brian H. Johnston
Publikováno v:
Genome Biology
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-9 (2018)
Genome Biology, Vol 19, Iss 1, Pp 1-9 (2018)
The ability to accurately quantify all the microRNAs (miRNAs) in a sample is important for understanding miRNA biology and for development of new biomarkers and therapeutic targets. We develop a new method for preparing miRNA sequencing libraries, Re
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.